Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications (NIST Search Type Demonstration)

Význam tématu

Proces identifikace organických látek v komplexních směsích za pomoci hmotnostní spektrometrie s třídou Orbitrap a pokročilého vyhledávání MS/MS je zásadní pro farmaceutický výzkum, environmentální analýzy i průmyslovou kontrolu kvality.

Cíle a přehled článku

Článek demonstruje použití softwaru Thermo Freestyle ve spojení s NIST MSMS Search v3.0 pro efektivní vyhledávání a identifikaci sloučenin. Představuje typická nastavení, volby režimů vyhledávání a tipy pro optimalizaci výsledků.

Použitá metodika a instrumentace

Metoda využívá akvizici dat na Orbitrapu s MS/MS a následné softwarové zpracování v Thermo Freestyle. Vyhledávání probíhá v třídním režimu (Tandem Mode) NIST MS Search 3.0, kde lze volit:

• Identity MS/MS – omezení na spektrum s přesnou m/z tolerancí
• Identity/High Resolution – porovnání celkového spektra bez volby prekurzoru
• Similarity/Hybrid MS/MS – rozšířené hledání podobných struktur v knihovnách

Hlavní výsledky a diskuse

Optimalizace filtrů („funnel“), odstranění šumu a nízkointenzních iontů zlepšila kvalitu identifikací. Volba "Best Matching" zjednodušuje interpretaci tím, že zobrazuje pouze nejrelevantnější výsledky podle CAS čísla. Uživatelé mohou ukládat a obnovovat konfigurace nastavení pro konzistentní opakování analýz.

Přínosy a praktické využití metody

Ukládání a sdílení nastavení šetří čas a zajišťuje konzistentní výsledky v rutinních laboratořích. Hybridní vyhledávání umožňuje detekci analogů i bez přímé přítomnosti sloučeniny v databázi. Efektivní filtrace šumu vede k přesnějšímu skórování spekter.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se další rozvoj hybridních algoritmů a integrace strojového učení pro automatizované přiřazování struktur. Rozšíření knihoven o více environmentálních a farmaceutických sloučenin podpoří širší aplikaci metody. Zvýšená kompatibilita mezi platformami zjednoduší sdílení a porovnávání dat.

Závěr

Použití Thermo Freestyle s NIST MSMS Search 3.0 ukazuje význam správné volby režimu vyhledávání a filtrů pro spolehlivou identifikaci sloučenin. Možnost ukládat vlastní konfigurace podporuje konzistentní výsledky napříč opakovanými analýzami.

Reference

• Little J. Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications, 2025.