LCMS Unknown Identification with NIST Search Using MSMS Libraries

Význam tématu

Vyhledávání MS/MS spekter proti referenčním databázím umožňuje přesnou identifikaci neznámých analytů v komplexních vzorcích. Integrace Agilent MassHunter Qualitative Analysis se softwarem NIST MSMS Search zjednodušuje workflow a zvyšuje spolehlivost výsledků.

Cíle a přehled studie / článku

Článek představuje ucelený návod na nastavení a optimalizaci MS/MS vyhledávání v Agilent MassHunter Qualitative Analysis za pomoci NIST MSMS Search verze 3. Autor popisuje typické volby uživatele, filtry, režimy hledání a způsob třídění výsledků.

Použitá metodika a instrumentace

• Software Agilent MassHunter Qualitative Analysis (YouTube videa EP01–EP03)
• Modul NIST MSMS Search 2023 verze 3
• Databáze: NIST 2023, Wiley, osobní knihovny, MONA (713 k spekter, 653 k struktur)

Hlavní výsledky a diskuse

Autor demonstruje nastavení režimů Identity MS/MS, Identity/High Resolution No Precursor a Similarity/Hybrid MS/MS. Popisuje volby tolerance prekurzorového m/z, „funnel“ filtry, volbu „Best Matching“ a rozdílné metody řazení výsledků (Full Spectrum Score, Impurity Tolerant Rev-Dot, Partial Spectrum PSS-DOT). Důraz je kladen na odstranění šumu a nízko intenzních iontů. Uložení konfigurace umožňuje rychlé opakování analýz.

Přínosy a praktické využití metody

• Rychlá a spolehlivá identifikace neznámých sloučenin
• Zvýšení kvality dat díky filtraci šumu
• Flexibilita ve výběru datových knihoven
• Konsistence díky možnosti ukládání a obnovy nastavení

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se integrace umělé inteligence pro pokročilé vyhodnocení spekter, rozšíření online a cloudových databází, automatizace workflow v rámci laboratoří a využití prediktivních modelů pro identifikaci nových sloučenin.

Závěr

Popisovaný postup zjednodušuje MS/MS identifikaci, umožňuje efektivní filtraci a třídění výsledků a přispívá ke zvýšení reproducibility analytických metod. Uložení uživatelských nastavení šetří čas při opakovaných analýzách.

Reference

1. Little J. Using Agilent MassHunter to Perform NIST MSMS Search. Mass Spec Interpretation Services, Sept. 9, 2024. Dostupné online: https://littlemsandsailing.com/2024/10/using-agilent-masshunter-to-perform-nist-msms-search/
2. Little J. LCMS unknown identification with NIST search using MSMS libraries. Mass Spec Interpretation Services, Dec. 2020. Dostupné online: https://littlemsandsailing.com/2020/12/lcms-unknown-identification-with-nist-search-using-msms-libraries/