Using Agilent MassHunter to Perform NIST MSMS Search

Prezentace | 2024 | James Little/Mass Spec Interpretation ServicesInstrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ, LC/TOF, Software
Zaměření
Výrobce
Agilent Technologies

Význam tématu


Massová spektrometrie doplněná o vyhledávání fragmentačních spekter v knihovnách představuje nejmodernější přístup k rychlé a spolehlivé identifikaci neznámých sloučenin v chemické analýze. Díky kombinaci přesné hmotnostní měření a databázových algoritmů lze dosáhnout vysoké selektivity i citlivosti, což je nezbytné v oblasti environmentální analýzy, potravinové kontroly či farmaceutického výzkumu.

Cíle a přehled studie


Cílem dokumentu je představit přehled postupu vyhledávání MSMS spekter pomocí softwaru Agilent MassHunter ve spojení s NIST MSMS Search v.3.0 (2023). Autor demonstruje konfiguraci parametrů, import spekter a třídění výsledků na modelové sadě pesticidů. Studie slouží jako rychlá orientační příručka k efektivnímu nastavení workflow.

Použitá metodika a instrumentace


Analýzu provádí systém Agilent Time-of-Flight (TOF) v pozitivním iontovém režimu s tandemovou fragmentací. Software MassHunter Qualitative Analysis zajišťuje extrakci iontových chromatogramů a průměrování spekter při kolizních energiích 10, 20 a 40 V. Pro identifikaci se využívá NIST MSMS Search v.3.0 s možnostmi Identity MS/MS a Similarity/Hybrid Search, která dokáže zachytit příbuzné struktury i v případě chybějícího standardu v knihovně.

Hlavní výsledky a diskuse


Ukázkové spektra směsi pesticidů (např. imazalil, diazinon, atrazin, malathion) byla úspěšně porovnána s referenčními daty. Klíčovým krokem je správné nastavení tolerance prekurzorového m/z a filtrace nízko intenzních iontů, čímž se zvyšuje kvalita shody. Hybridní vyhledávání odhalilo strukturálně podobné látky i bez přímého záznamu v databázi. Řazení výsledků dle plného spektra (Full Spectrum Score) a rev-doterance impurit (Impurity Tolerant) umožňuje lepší odlišení pravděpodobných kandidátů.

Přínosy a praktické využití metody


  • Rychlá a automatizovaná identifikace složitých vzorků bez nutnosti standardů
  • Vysoká selektivita díky přesné hmotnostní analýze a filtračním algoritmům
  • Možnost sdílení uložených konfigurací mezi uživateli pro zajištění konzistence výsledků

Budoucí trendy a možnosti využití


V následujících letech se očekává rozšíření umělé inteligence pro predikci fragmentačních vzorců a integrace globálních knihoven s otevřenými zdroji, jako jsou MONA spektrální knihovny. Rovněž se rozvíjí interoperabilita mezi různými softwarovými platformami a cloudovými databázemi pro sdílení dat v reálném čase.

Závěr


Přehled použití Agilent MassHunter ve spojení s NIST MSMS Search v.3.0 poskytuje systematický postup pro efektivní identifikaci neznámých látek. Klíčové jsou správná volba parametrů, filtrace šumu a uložení konfigurací pro opakované použití. Kombinace identity a hybridního vyhledávání maximalizuje možnost detekce jak známých, tak strukturálně příbuzných analy­tů.

Reference


  1. James Little. Mass Spec Interpretation Services. Sept. 14, 2024.
  2. Little J. Using Agilent MassHunter to Perform NIST MSMS Search. littlemsandsailing.com, 2024.
  3. MassHunter Qualitative Analysis Training Videos EP01–EP03. YouTube.
  4. NIST MSMS Full Course: LCMS Unknown Identification with NIST Search. littlemsandsailing.com, 2020.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

LCMS Unknown Identification with NIST Search Using MSMS Libraries
Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications (NIST Search Type Demonstration)
Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications (Setting Up NIST Search and Freestyle Parameters)
LCMS Unknown Identifications Using MSMS Libraries Part II: NIST Search Software and Libraries