Pátý a závěrečný den <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/events/930">27. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie</a> se nesl ve znamení propojení moderních omických přístupů s praktickými aplikacemi a širším pohledem na možnosti hmotnostní spektrometrie. Dopolední sekci otevřel <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/lcms/articles?search=michal+hol%C4%8Dapek">Michal Holčapek</a> tématem moderní lipidomiky – od analytických metod až po biologické aplikace. Na něj navázal Roman Grabic, který se zaměřil na necílenou analýzu xenobiotik v životním prostředí, její současné možnosti i perspektivy pro blízkou budoucnost.V závěrečné sekci „Za hranice všední MS“ přišla na řadu derivatizace v MS praxi v podání Stanislava Opekara a také ukázka propojení molekulární biologie s hmotnostní spektrometrií při studiu regulace tvorby chlorofylu v rostlinách, kterou představil Roman Sobotka. Následovalo oficiální zakončení 27. ročníku Školy MS, spojené také s vyhlášením vítěze sekce Mládí vpřed 2026 a vítězů MS ve stolním fotbálku. Pátek tak uzavřel pětidenní program, který propojil odborné přednášky, praktické zkušenosti, nové technologie, mladou vědu i tradičně silný komunitní rozměr celé Školy hmotnostní spektrometrie.<h3>Program</h3><blockquote>👉<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/pdf/program_Skola_MS_2026_final_8c8cf90056.pdf">Finální program 27. Školy MS je ke stažení zde</a></blockquote><h4>Pátek, 25. 9. 2026</h4><h5>SEKCE XIII. Perspektiva omik v praxi&nbsp;</h5><h5>08:30 – 09:15 Moderní lipidomika: od analytických metod k biologickým aplikacím&nbsp;</h5><ul><li>Michal Holčapek&nbsp;</li></ul><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Michal_Holcapek_7760793103.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Moderní lipidomika: od analytických metod k biologickým aplikacím (Michal Holčapek)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Michal_Holcapek_7760793103.jpg 208w," sizes="100vw" width="1600" height="1201"><h5>09:15 – 10:00 Necílená analýza xenobiotik v životním prostředí: Jaké máme možnosti a vyhlídky do blízké budoucnosti&nbsp;</h5><ul><li>Roman Grabic&nbsp;</li></ul><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Roman_Grabic_97a8315cff.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Necílená analýza xenobiotik v životním prostředí: Jaké máme možnosti a vyhlídky do blízké budoucnosti (Roman Grabic)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Roman_Grabic_97a8315cff.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="900"><h5>10:00 – 10:30 Přestávka na kávu&nbsp;</h5><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Prestavka_na_kavu_stanek_Lab_Rulez_7fac8edaaf.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Přestávka na kávu - stánek LabRulez (Ivo Novotný)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Prestavka_na_kavu_stanek_Lab_Rulez_7fac8edaaf.jpg 208w," sizes="100vw" width="1600" height="1200"><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Prestavka_na_kavu_1d6f092255.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Přestávka na kávu (stánek Phenomenex)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Prestavka_na_kavu_1d6f092255.jpg 208w," sizes="100vw" width="1600" height="1200"><h5>SEKCE XIV. Za hranice všední MS</h5><h5>10:30 – 11:10 Derivatizace v MS praxi&nbsp;</h5><ul><li>Stanislav Opekar</li></ul><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Stanislav_Opekar_962318008b.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Derivatizace v MS praxi (Stanislav Opekar)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Stanislav_Opekar_962318008b.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="901"><h5>11:00 – 11:40 Jak rostliny vědí, kolik chlorofylu vyrobit? Molekulární biologie a hmotnostní spektrometrie v synergii</h5><ul><li>Roman Sobotka</li></ul><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Roman_Sobotka_8852a07afd.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Jak rostliny vědí, kolik chlorofylu vyrobit? Molekulární biologie a hmotnostní spektrometrie v synergii (Roman Sobotka)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Roman_Sobotka_8852a07afd.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="900"><h5>11:40 – 12:00 Zakončení 27. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie&nbsp;</h5><ul><li>Martin Moos, Roman Grabic, Josef Cvačka&nbsp;</li></ul><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Zakonceni_skoly_MS_0151093ea4.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Zakončení školy MS (Martin Moos)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Zakonceni_skoly_MS_0151093ea4.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="901"><h5>Vyhlášení vítěze sekce Mládí vpřed 2026</h5><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Vitezka_Mladi_Vpred_Kristyna_Myslinova_8e826c2971.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Vítězka Mládí vpřed 2026 - Kristýna Myslínová" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Vitezka_Mladi_Vpred_Kristyna_Myslinova_8e826c2971.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="901"><h5>Vyhlášení vítězů MS ve stolním fotbálku</h5><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Vyherci_ve_stolnim_fotbalku_Ivo_Novotny_a_Petr_Dusek_a502b26015.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Výherci MS ve stolním fotbálku Ivo Novotný a Petr Dušek" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Vyherci_ve_stolnim_fotbalku_Ivo_Novotny_a_Petr_Dusek_a502b26015.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="901"><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Vitezove_MS_ve_stolnim_fotbalku_7a150ede95.jpg" alt="Škola hmotnostní spektrometrie: 27. Škola MS 2026 - den 5: Výherci MS ve stolním fotbálku Ivo Novotný a Petr Dušek" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Skola_hmotnostni_spektrometrie_27_Skola_MS_2026_den_5_Vitezove_MS_ve_stolnim_fotbalku_7a150ede95.jpg 177w," sizes="100vw" width="1600" height="1413"><h5>12:00 – 13:30 Oběd</h5>

27. Škola MS 2026 - den 5

Pragolab je česká společnost dodávající kvalitní laboratorní přístroje z oboru analytické chemie a fyzikálních měření. Již 30 let máme zastoupení na českém a slovenském trhu.<h4>Co všechno děláme?</h4><ul><li>Jsme autorizovaným distributorem výrobce Thermo Fisher Scientific.</li><li>Poskytujeme profesionální poradenství.</li><li>Obstaráváme přípravu a vzdělávání uživatelů.</li><li>Zajišťujeme aplikační podporu.</li><li>Máme oddělení servisu, které obstarává instalace, údržby, profylaktické opravy a validace přístrojů.</li><li>Spolupracujeme na vývoji nových HW i SW řešení včetně nových patentů.</li><li>Účastníme se odborných konferencí.</li></ul>Naše divize <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.pragolab.cz/chromatografie-a-ms">Organická analýza a separační techniky</a> nabízí špičkové nástroje pro identifikaci a kvantifikaci látek – rozmanitá řešení pro všechny Vaše potřeby: HPLC, HPLC-MS, IC, IC-MS, GC či GC-MS ve farmacii, průmyslu i v nejmodernějších vědeckých ústavech.V divizi <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.pragolab.cz/opticke-mikroskopy">Optické mikroskopie</a> a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.pragolab.cz/priprava-vzorku">přípravy vzorků</a> navrhujeme řešení jednotlivých optických i elektronových mikroskopů, řešení pro metalografii, materiálové zkoušky i celkových komplexních projektů.Divize <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.pragolab.cz/prvkova-analyza">fyzikální a materiálové analýzy</a> nabízí především systémy společnosti Thermo Scientific, jako jsou ICP, AAS, XRF, XRD, XPS resp. ESCA, UV-VIS a VIS spektrofotometry, reometry, viskozimetry a extrudery. Dále mixery a detektory pro sledování rychlé kinetiky od společnosti Biologic SAS.<blockquote>Pro oblast LC-MS zastupujeme Thermo Fisher Scientific, jednoho z předních světových výrobců analytických technologií, a hledáme člověka, který s námi bude tuto oblast dál rozvíjet.</blockquote><h3>Produktový specialista pro oblast LC-MS, celá ČR</h3><h4>Co bude náplní tvé práce?</h4><ul><li>Kompletní business pod kontrolou: Povedeš obchodní případy od prvního kontaktu až po finální předání. Budeš navrhovat konfigurace, tvořit cenové nabídky a koordinovat instalace.</li><li>Partner pro prémiové zákazníky: Rychlost a mimořádný klientský servis jsou pro nás klíčové. Budeš rychle reagovat a reprezentovat značku na nejvyšší úrovni.</li><li>Vyhledávání nových příležitostí: Nebudeš jen sedět v kanceláři. Budeš aktivně vyhledávat nové klienty a rozvíjet obchodní potenciál přímo v terénu, na schůzkách i po telefonu.</li></ul><h4>Co od tebe potřebujeme?</h4><ul><li>Pevný základ v analytické chemii: Máš vysokoškolské vzdělání, které se tohoto oboru více než dotklo, a k tomu prokazatelnou zkušenost s LCMS (kapalinovou chromatografií s hmotnostní spektrometrií).</li><li>Nekonečný drajv a entuziasmus: Práce tě musí bavit. Hledáme člověka s bezbřehým nadšením, kreativním myšlením a chutí posouvat věci kupředu.</li><li>Proaktivita a vysoké pracovní nasazení: Nečekáš, až ti někdo řekne, co máš dělat. Tvůj aktivní přístup a pracovitost jsou motorem, který tě žene k úspěšným obchodům.</li></ul><h4>Co za to?</h4><ul><li>Otevřené karty při osobním setkání: finanční balíček a benefity rádi nastavíme na míru tvým zkušenostem. Pojďme si o tom promluvit osobně.</li><li>Zázemí stabilní firmy: Pragolab působí na trhu více než 35 let. Za tu dobu jsme vybudovali silné odborné zázemí a tým, o který se můžeš opřít.</li><li>Práci se špičkovými technologiemi: Budeš pracovat s moderními LC-MS systémy Thermo Scientific a podílet se na zajímavých projektech napříč různými oblastmi analytické chemie.</li><li>Svobodu a flexibilitu: Důvěřujeme ti. U nás získáš prostor pro seberealizaci a flexibilitu, abys mohl skvěle nejen pracovat, ale i žít.</li></ul>Zaujalo tě to? Ozvi se nám.<blockquote><h5>Kontaktní osoba:</h5><ul><li>Ing. Lukáš Plaček, Ph.D. (Vedoucí divize Organická analýza)</li><li><a href="mailto:placek@pragolab.cz">placek@pragolab.cz</a></li><li>+420 733 656 164</li></ul></blockquote>

Produktový specialista pro oblast LC-MS, celá ČR

Když NIST26 zpracovává LC-MS/MS data v okně Chromatogram Window, výsledný seznam identifikovaných sloučenin představuje pouze jednu část celého procesu. Za výsledky zobrazenými v softwaru stojí celá skupina mezisouborů obsahujících chromatografické záznamy, extrahovaná MS/MS spektra, výsledky vyhledávání, informace o izotopech, modely píků a vazby mezi chromatografickými prvky a spektry. V nedávno zveřejněném <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/pdf/identifications_raw_files_28359b66de.pdf">návodu</a> se James Little z Mass Spec Interpretation Services zaměřil na to, co tyto soubory představují, jak souvisejí s novým zpracováním dat v NIST26 založeným na XIC a jaké další informace mohou analytikům nabídnout.Výchozím bodem je složka Identifications, která se vytvoří při zpracování LC-MS/MS souboru v okně Chromatogram Window v NIST26. Namísto jediného výsledkového souboru software generuje skupinu mezivýstupů souvisejících s dekonvolucí MS/MS a vyhledáváním v knihovně. Tato data se následně využívají k vytvoření informací, které jsou uživateli prezentovány v okně Chromatogram Window. Materiál se rovněž zabývá otázkou, zda by některé z těchto výstupů mohly mít využití i mimo samotný identifikační workflow, například jako vstup pro vícerozměrnou analýzu nebo porovnávání vzorků.<h4>Přístup ke zpracování LC-MS/MS založený na XIC</h4>Postup popsaný v prezentaci je založen na extrahovaných iontových chromatogramech (XIC). Namísto toho, aby bylo každé MS/MS spektrum považováno za samostatný identifikační výsledek, NIST26 propojuje spektrální informace s chromatografickým chováním.Nejprve jsou extrahovány chromatografické informace z dat MS1, spektra jsou seskupeny podle retenčního času, přiřazují se MS/MS spektra k píkům v XIC a následně jsou tyto informace využity k ověření nebo zpřesnění identifikací. Schémata na stranách 8–15 materiálu znázorňují celý proces jako vícekrokový postup, nikoli jako jednoduchou posloupnost „MS/MS spektrum → shoda s knihovnou → identifikace“.Tento rozdíl je důležitý, protože chromatografická dimenze poskytuje další podpůrné informace. Kandidátní identifikace může být hodnocena nejen podle shody MS/MS spektra s knihovnou, ale také podle toho, zda se příslušný prekurzor chová v chromatogramu konzistentně, zda odpovídá jeho izotopový profil a zda je MS/MS spektrum správně přiřazeno k příslušnému chromatografickému píku.<h4>Paralelní zpracování vytváří více mezisouborů</h4>Jedním z důvodů, proč složka Identifications obsahuje tolik souborů, je skutečnost, že NIST26 rozděluje surový mzML dataset do několika částí pro paralelní zpracování. Každá z těchto částí vytváří vlastní mezivýstupy.Prezentace popisuje několik důležitých typů souborů. Soubory .tic obsahují informace o celkovém iontovém chromatogramu založeném na intenzitě MS1 v závislosti na retenčním čase a využívají se například pro detekci píků, zarovnání retenčních časů a vymezení oken XIC. Soubory .mgf obsahují MS/MS spektra po detekci píků ve formátu Mascot Generic Format a slouží jako vstup pro vyhledávání v knihovně. Soubory .tsv obsahují tabulkové výsledky vyhledávání, včetně kandidátních identifikací, příslušných skóre a informací o prekurzorech.Tyto mezisoubory tak odpovídají jednotlivým úrovním zpracování dat: chromatografickým informacím z MS1, spektrálním informacím z MS2, výsledkům vyhledávání v knihovně a následnému vzájemnému ověření těchto vrstev.<h4>Od tisíců spekter k finálním identifikacím</h4>Materiál uvádí názorný příklad toho, jak výrazně se může dataset během zpracování zredukovat.V popsaném příkladu obsahoval původní mzML soubor 3 380 spekter, která byla rozdělena do čtyř částí pro zpracování. Z těchto dat bylo pro vyhledávání v knihovně extrahováno 216 tandemových MS/MS spekter. Nakonec se do výsledků zobrazovaných nebo zahrnutých do reportu dostalo 158 MS2 vyhledávání. Podle poznámky Jamese Littla trvalo zpracování těchto 158 spekter přibližně 11 sekund.Tento příklad ukazuje, že výsledná tabulka představuje pouze vybranou část spektrálních informací původně obsažených v souboru. Mezivýstupy přitom uchovávají informace o tom, jakým způsobem byl tento výběr vytvořen.<h4>Co obsahují „check“ soubory?</h4>Jedním z hlavních sdělení prezentace je, že soubory neformálně označované jako „check“ soubory nejsou pouze dočasným balastem. Z koncepčního hlediska tvoří mezivrstvu důkazů mezi původním vyhledáváním MS/MS spekter v knihovně a finální identifikací.Podle workflow uvedeného v materiálu mohou tyto soubory obsahovat XIC záznamy pro jednotlivé prekurzorové ionty, izotopové záznamy, modely píků, vazby na retenční časy, vztahy mezi ionty vznikajícími ve zdroji a informace o seskupování, které určují, která MS/MS spektra náležejí ke kterým chromatografickým píkům.Workflow tak může využívat chromatografické informace k potvrzení nebo zamítnutí kandidátních identifikací, zpřesnění přiřazení prekurzorů a rozlišení relevantních MS/MS spekter od signálů pozadí. Prezentace tento přístup porovnává s tradičnějším workflow, ve kterém může shoda MS/MS spektra s knihovnou v podstatě představovat konec identifikačního procesu. V přístupu NIST26 založeném na XIC je posloupnost spíše následující: MS/MS vyhledávání → kandidátní identifikace → ověření pomocí XIC → zpřesnění a nové seřazení výsledků.<h4>Chromatografické informace přidávají další úroveň jistoty</h4>Praktická hodnota tohoto dodatečného zpracování spočívá v kombinaci informací, které by jinak byly hodnoceny odděleně.MS/MS spektrum může vykazovat přesvědčivou shodu s knihovnou, NIST26 však může navíc ověřit, zda prekurzor vytváří souvislý chromatografický pík, zda se očekávané izotopové signály objevují společně a zda jsou vztahy mezi retenčními časy konzistentní. Interní datové soubory mohou rovněž pomoci sledovat fragmenty vznikající ve zdroji, které by jinak mohly být nesprávně interpretovány jako samostatné sloučeniny.Závěrečný snímek materiálu shrnuje tyto soubory jako hlavní vrstvu podpůrných informací nového přístupu NIST, která obsahuje chromatografické informace, izotopové chování, konzistenci retenčních časů a vztahy mezi ionty vznikajícími ve zdroji. Podle prezentace tato data pomáhají opravovat nesprávná přiřazení prekurzorů, rozpoznávat fragmenty vznikající ve zdroji a zvyšovat celkovou spolehlivost MS/MS identifikace.<h4>Lze výstupy využít i mimo identifikaci sloučenin?</h4>Další zajímavou otázkou nastolenou v prezentaci je, zda by bylo možné informace generované během zpracování v NIST26 znovu využít pro další analytické úlohy.Výstupní soubor .tsv obvykle obsahuje jeden řádek pro každý detekovaný chromatografický prvek a může zahrnovat retenční čas, m/z prekurzoru, plochu píku nebo intenzitu, skóre shody s knihovnou, název sloučeniny, sumární vzorec a případně také informace o aduktu.Materiál naznačuje, že tento typ tabulkového výstupu by mohl představovat vhodný výchozí bod pro vytvoření matice příznaků (feature matrix) pro následné analýzy, jako jsou:<ul><li>analýza hlavních komponent (PCA),</li><li>hierarchické shlukování,</li><li>porovnávání „dobrých“ a „špatných“ vzorků,</li><li>detekce odlehlých hodnot,</li><li>a hledání markerů.</li></ul>Je však důležité zdůraznit, že tato část materiálu je prezentována jako průzkum možného využití, nikoli jako formálně demonstrovaný workflow NIST26. James Little uvádí, že k analýze vztahů mezi vytvořenými soubory a posouzení jejich potenciálního využití byl použit ChatGPT.<h4>Proč NIST26 vytváří tolik souborů?</h4>Velké množství mezisouborů je ve výsledku důsledkem dvou hlavních vlastností strategie zpracování: paralelizace a víceúrovňové analýzy.Surová data jsou rozdělena do několika částí, aby se urychlilo jejich zpracování, zatímco samostatné datové výstupy vznikají pro chromatografické zpracování MS1, spektrální vyhledávání MS2 a následné vzájemné ověření výsledků. Workflow tak zachovává podpůrné informace z několika kroků analýzy, místo aby je okamžitě sloučil do jediné finální tabulky výsledků.Výsledkem je složka, která může na první pohled působit zbytečně složitě, ve skutečnosti však odráží samotnou architekturu analýzy. Jak materiál zdůrazňuje, mezisoubory nejsou pouze zbytky po zpracování dat; dokumentují způsob, jakým byly chromatografické a hmotnostně spektrometrické informace zkombinovány při tvorbě finální identifikace.<h4>Více než jen vyhledávání v knihovně</h4>Hlavním sdělením prezentace je, že nový LC-MS/MS workflow v NIST26 jde za hranice klasického porovnávání spekter s knihovnou. Začleněním chování XIC, izotopových informací, vztahů mezi píky, konzistence retenčních časů a MS/MS dat může software při hodnocení identifikace využívat více nezávislých zdrojů informací.Pro analytiky znamená porozumění obsahu složky Identifications lepší přehled o tom, jak jsou finální výsledky vytvářeny. Zároveň se otevírá možnost kontrolovat mezikroky zpracování při řešení problematických nebo sporných identifikací a případně znovu využít některé tabulkové výstupy na úrovni jednotlivých chromatografických prvků pro širší porovnávání vzorků.Rostoucí význam těchto mezidat zároveň odráží širší posun v LC-MS/MS analýze: spolehlivá identifikace je stále méně založena na jediném skóre nebo jediném spektru a stále více na kombinované interpretaci chromatografických, spektrálních a kontextových informací.

Složka Identifications: Raw soubory vytvářené při zpracování MS/MS dat v NIST26

Akademie

Software

Kariéra

Článek

Video

Nejbližší akce

Škola hmotnostní spektrometrie je odborná vzdělávací akce pořádaná od roku 1986, která vedle zajímavých přednášek a kurzů nabízí i nespočet příležitostí k přátelským setkáním a diskusím.

Škola hmotnostní spektrometrie

Jsme jedním z lídrů na českém a slovenském trhu v oblasti laboratorních zařízení a svým zákazníkům přinášíme špičkové přístroje z oboru analytické chemie a fyzikálních měření více než 25 let.

Pragolab

Mým hlavním zájmem je identifikace organických sloučenin hmotnostní spektrometrií v organických směsích.

James Little/Mass Spec Interpretation Services

Agilent Technologies

...
<blockquote>
Presenter: Scott Melis, PhD (Application Scientist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Scott Melis has a PHD in Physics from Georgetown University in Washington, DC and started with Agilent in 2021 as a Molecular Spectroscopy Application Scientist. In his graduate work, Scott studied nanoparticle formation and growth for a variety of applications. Projects that he worked with include developing processes to deposit and characterize semiconducting molecular nano-cocrystals for use in optoelectronic devices as well as controlling polymer nanoparticle size through rapid mixing conditions.
</blockquote>

Agilnt Technologies: UV/Vis Software Bootcamp

UV/Vis Software Bootcamp

In this ICP-MS MassHunter Software “How to…..” webinar series, we pick a most-frequent-asked topic each week and give a brief demonstration and discussion on the subject.
Topics include, but are not limited to, Building a batch template, Half mass correction, Reporting templates, and IntelliQuant, to name a few.
You don’t want to miss them! Come with all your questions for our immediate answers!
<blockquote>
Presenter: Yan Cheung, PhD (Application Scientist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Yan received her Ph.D. in Analytical Chemistry from Indiana University Bloomington. She joined Agilent Technologies as an Application Scientist in the Life Science and Chemical Analysis team in April 2020. Yan has extensive experience in operating and method development in ICP-MS. Yan also has years of experience working in the oil and gas industry.
</blockquote>

Agilent Technologies: ICP-MS MassHunter How To: What is and How to use Half Mass Correction

ICP-MS MassHunter How To: What is and How to use Half Mass Correction

Topics include, but are not limited to, Building a batch template, Half mass correction, Reporting templates, and IntelliQuant, to name a few.

ICP-MS MassHunter How To: How to use Half Mass Correction

This Seminar is designed to help chemists and lab managers become more familiar with the workings of Agilent’s newest software - OpenLab CDS.
Participants will listen to an Agilent expert and watch a series of live demonstrations.They will have amble opportunity to ask their own specific questions during the course of this seminar. Customers that are new to OpenLab CDS or are using an older software package from Agilent such as ChemStation would benefit from seeing the future of their laboratory software.
<blockquote>
Presenter: Richard Mutkoski (Laboratory Informatics Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Richard Mutkoski began with Agilent (HP) in 1995. He has been an Application Engineer in Agilent’s Laboratory Informatics for the past 18 years. Prior to his career at Agilent Rich spent 12 years in a variety of small pharmaceutical firms in both R&amp;D and QA/QC capacities affording him first-hand knowledge of those workflows, bottlenecks and challenges.
</blockquote>

Agilent Technologies: Get The Most Out of Your OpenLab CDS System – An Exploration of Agilent’s Newest Chromatography Data System

Get The Most Out of Your OpenLab CDS System – An Exploration of Agilent’s Newest Chromatography Data System

Become more familiar with the workings of Agilent’s newest software - OpenLab CDS.

Get The Most Out of Your OpenLab CDS System

Learn about the function and advantages of the new control panel including creating instruments, creating projects, activity logs, storage types and paths.
Learn the basic operations of user privileges including assigning permissions and roles, and license utilities.
<blockquote>
Presenter: Richard Mutkoski (Laboratory Informatics Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Richard Mutkoski has been a field representative for over 27 years for both hardware and software. In his current role as an Informatics Application Engineer, Rich presents technical solutions of the OpenLab suite of products to customers worldwide. Prior to his tenure at Agilent Rich spent 15 years in a variety of Pharma QA/QC and R&amp;D positions providing him a unique understanding of those workflows, bottlenecks and challenges.
</blockquote>

Agilent Technologies: Openlab CDS ChemStation Edition - Getting Started

Openlab CDS ChemStation Edition - Getting Started

Learn about the function and advantages of the new control panel including creating instruments, creating projects, activity logs, storage types and paths.

The FDA guidance for Computer System Assurance (CSA) is intended to reduce the time and effort of the Computerized System Validation (CSV) process without compromising regulatory compliance or data integrity.
The regulated life science industries generally consider the CSV process as burdensome and as a hindrance to adopting new automation technologies that could greatly improve the efficiency and productivity of their business. In this presentation we will examine the six major points of the CSA guidance and how they can be used to improve your CSV process. We will also examine Agilent’s validation services, our process efficiencies, and how we intend to integrate elements of the CSA guidance.
<blockquote>
Presenter: Michael Korbel (Sr. Compliance Consultant, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Michael has over 22 years of experience in regulated environments in the pharmaceutical and bio-tech industries. Half of Michael&#39;s career has been spent on the customer side of the industry in both IT and laboratory positions, supporting, qualifying, and validating regulated instruments and computerized systems. The other half has been spent providing consultative compliance service programs from the vendor side of the industry. His experience includes technical support and validation of both standalone and enterprise laboratory informatics systems, as well as instrument qualification, preventive maintenance, and relocation services. Michael’s current role at Agilent Technologies is to create new compliance consulting services for our regulated customers and implement them globally. Michael holds a B.S. in Biology, with minors in Chemistry and Environmental Science.
</blockquote>

Agilent Technologies: New FDA guidance “Computer System Assurance” and Agilent Validation Service Offerings

New FDA guidance “Computer System Assurance” and Agilent Validation Service Offerings

The six major points of the CSA guidance and how they can be used to improve your CSV process.

New FDA guidance “Computer System Assurance”

Now that you are using the OpenLab CDS system, why are you still using Excel?
Unlock the incredible calculation potential of your system. You have run a triplicate injection of standards and would like to determine the percent recovery of your samples against the average of those standards. This session will introduce you to the method of being able to do just that within OpenLab CDS WITHOUT the use of Excel.
<blockquote>
Presenter: Richard Mutkoski (Laboratory Informatics Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Richard Mutkoski has been a field representative for over 27 years for both hardware and software. In his current role as an Informatics Application Engineer, Rich presents technical solutions of the OpenLab suite of products to customers worldwide. Prior to his tenure at Agilent Rich spent 15 years in a variety of Pharma QA/QC and R&amp;D positions providing him a unique understanding of those workflows, bottlenecks and challenges.
</blockquote>

Agilent Technologies: Calculate Percent Recovery of Samples in OpenLab CDS

Calculate Percent Recovery of Samples in OpenLab CDS

The method of being able to do just that within OpenLab CDS WITHOUT the use of Excel.

This seminar introduces a powerful feature in OpenLab CDS: Custom Calculator.
OpenLab CDS users or chromatographers thinking of moving to OpenLab CDS from another data system can see how this unique feature allows the addition of user defined chromatography calculations directly into the OpenLab CDS data system.
<blockquote>
Presenter: Kathleen O&#39;Dea (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Kathleen O’Dea has a 20 year history with Agilent’s OpenLab products. As an Informatics Application Engineer, Kathleen has visited customers around the world in a wide variety of market areas, helping them to select and implement OpenLab software products.
</blockquote>

Agilent Technologies: Introducing the Custom Calculator in OpenLab CDS

Introducing the Custom Calculator in OpenLab CDS

Powerful feature in OpenLab CDS: Custom Calculator.

Integration is essential to chromatography for the identification and determination of peak area and height.
Although Software does an excellent job with integration, chromatography is not always perfect and careful consider must be given to integration.
In this presentation, three essential integration topics are covered: Integration parameters--some basic parameters must be understood when reviewing chromatography to ensure optimal analyses. Integration techniques--the most appropriate for solving some common problems are discussed. Finally, manual intervention--given the overall goal to achieve robust integration, when and why manual integration should be performed.
<blockquote>
Presenter: Greg Hunlen (Application Scientist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Gregory Hunlen has served as an Application Scientist with Agilent Technologies since 2012. He applies his expertise to the Agilent Infinity II series of LC instruments, providing knowledge of LC solutions such as two dimensional LC and LCMSD workflows. He also delivers product demonstrations and lunch &amp; learns. As a key value, Greg likes to talk about maximizing the use of all features our technologies provide. Often, instruments are under-utilized perhaps as a lack of understanding of all that they can offer. When we explore these features, we discover that we can truly optimize the efficiencies of our instruments. Prior to joining Agilent, Greg spent 20 + years in the pharmaceutical research industry on the liquid phase chromatography side of drug development.
</blockquote>

Agilent Technologies: HPLC Integrate with Confidence

HPLC Integrate with Confidence

Integration parameters--some basic parameters must be understood when reviewing chromatography to ensure optimal analyses.

Are you an analyst, manager, or reviewer who needs to get work done but may not be in the lab?
Especially important today, remote access is a key feature that can increase productivity, reduce compliance costs and is a key part of a disaster recovery plan. This virtual seminar introduces options for thin client technology enabling all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab, whether this is at from nearby desks, across sites, or from home.
<blockquote>
Presenter: Mike Ratto (Lab Informatics Applications Specialist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Mike Ratto has been with Agilent for 29 years as a field representative for both hardware and software products. In his current role as an Informatics Application Specialist, Mike presents technical solutions of OpenLab family of products to customers all over the world.
</blockquote>

Agilent Technologies: Agilent Software products and Architecture to enable work from home options

Agilent Software products and Architecture to enable work from home options

Options for thin client technology enabling all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab.

Agilent Software products and Architecture to enable work

Are you an analyst, manager, or reviewer who follows the social distancing guidelines but need to get work done without full access to your lab?
Especially important today, Remote Access is a key feature that can increase productivity, reduce compliance costs and can be an integral part of a disaster recovery plan. This virtual seminar introduces options using “Thin Client technology which enables all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab, whether this is at from nearby desks, across sites, or from home.
Our learning objectives during this 1 hour session are as follows:
<ul>
<li>An introduction to “Thin Client” technology
</li>
<li>Data and instrument access options from lab, office or home with OpenLab
</li>
<li>Learn technology options that support Social Distancing in the laboratory
</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Mike Ratto (Lab Informatics Applications Specialist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Mike Ratto has been with Agilent for 29 years as a field representative for both hardware and software products. In his current role as an Informatics Application Specialist, Mike presents technical solutions of OpenLab family of products to customers all over the world.
</blockquote>

Agilent Technologies: OpenLab CDS/ECM Remote Access Solutions to support Social Distancing in the Lab

OpenLab CDS/ECM Remote Access Solutions to support Social Distancing in the Lab

Options using “Thin Client technology which enables all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab.