LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníProteomika
VýrobceWaters
Význam tématu
LC-MS analýzy bílkovin a peptidů vyžadují precizní kontrolu přípravy vzorku, chromatografie i detekce. Často se opomíjí, že část analytů může během skladování v kontejneru nenávratně přiléhat na stěny nádoby, což vede ke zkreslení kvantitativních výsledků. Nespecifická vazba (NSB) tak snižuje citlivost, přesnost i reprodukovatelnost měření.
Cíle a přehled studie / článku
Studie si klade za cíl identifikovat hlavní faktory vedoucí k NSB peptidů a navrhnout systematický postup, jak minimalizovat tyto ztráty bez použití blokovacích činidel. Autoři porovnávají různé materiály kontejnerů i vzorkových rozpouštědel a hodnotí vliv parametrů skladování na návratnost analytů.
Použitá metodika
Postup zahrnuje tři klíčové kroky:
- Výběr vhodného materiálu kontejneru s ohledem na iontové a hydrofobní interakce analytů.
- Optimalizace složení vzorkového rozpouštědla pro snížení adsorpce a zachování kompatibility s LC-MS.
- Stanovení ideálních podmínek skladování (teplota, doba), které nejméně ovlivňují návratnost peptidů.
Použitá instrumentace
Separační systém: ACQUITY UPLC I-Class s fixed loop injektorem. Mass spektrometr: Xevo TQ-S s univerzálním zdrojem. Kolona: CORTECS C18+ (90 Å, 1,6 µm, 2,1 × 50 mm) při 55 °C. Mobilní fáze: voda s 0,1 % kyseliny mravenčí (A) a acetonitril s 0,1 % kyseliny mravenčí (B). Gradient 15–45 % B za 1,2 minuty, následný 95 % B wash a re-equilibrace. Objem injekce: 10 µl full loop.
Hlavní výsledky a diskuse
Hydrofobní peptidy byly zcela ztraceny v běžných skleněných i polypropylenových kontejnerech. Speciálně navržené QuanRecovery nádoby dosáhly výrazně vyšší návratnosti napříč testovanými peptidy, přičemž nejvýrazněji se projevilo zadržení melittinu. Úprava poměru vody a acetonitrilu ve vzorku modifikovala hydrofobní interakce, ale často omezila retenci na kolóně. Skladování v inertních nádobách QuanRecovery při pokojové teplotě zachovalo vysokou obnovu i po 47 hodinách, kdežto běžné nízkovazebné destičky selhávaly již při > 10 °C.
Přínosy a praktické využití metody
Systematický přístup nabízí:
- Eliminaci blokovacích činidel, která mohou interferovat s LC-MS detekcí.
- Univerzální kroky pro výběr kontejneru, rozpouštědla a skladovacích podmínek.
- Zvýšení přesnosti, citlivosti a reprodukovatelnosti kvantitativních LC-MS analýz bílkovin a peptidů.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj povrchových úprav a vývoj nových materiálů mohou dále snižovat NSB. Integrace tohoto protokolu do automatizovaných pracovních toků a jeho aplikace na různé biologické matrice (např. krevní séra) posílí spolehlivost vysoce propustných analýz.
Závěr
Systematický výběr kontejneru, optimalizace rozpouštědla a kontrola skladovacích podmínek efektivně předchází ztrátám peptidů způsobeným NSB. Implementace navrženého postupu přináší vyšší kvalitu kvantitativních LC-MS metod bez potřeby blokovacích aditiv.
Reference
- M.C. Jung, Achieving Maximum Protein and Peptide Recovery, Sensitivity, and Reproducibility using QuanRecovery Vials and Plates, Waters White Paper, 720006543EN (2019)
- Bobaly B., Sipko E., Fekete J., Challenges in liquid chromatographic characterization of proteins, J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci 1032, 3–22 (2016)
- Rabe M., Verdes D., Seeger S., Understanding protein adsorption phenomena at solid surfaces, Adv Colloid Interface Sci 162, 87–106 (2011)
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.