TOOLS FOR MASS SPECTROMETRY - PROTEOMICS AND METABOLOMICS

Význam tématu

Masová spektrometrie se stala klíčovou metodou pro charakterizaci a kvantifikaci proteinů i metabolitů ve vědeckém výzkumu i průmyslové praxi. Komplexní workflow od přípravy vzorku přes rozklad, značení, chromatografickou separaci až po analýzu na hmotnostním spektrometru umožňuje objev nových biomarkerů, studium biologických drah a podporuje rozhodování v klinice či zemědělství.

Cíle a přehled katalogu

Poskytnout komplexní přehled produktů pro proteomiku a metabolomiku v jednom zdroji zahrnujícím:

• Produkty pro přípravu vzorku – extrakce proteinů, inhibice enzymů, deplece vysoce hojné frakce
• Reagencie pro značení a standardizaci – stabilně izotopově značené aminokyseliny, peptide standards, AQUA, iTRAQ®, mTRAQ®, ICAT®, SILAC
• Chromatografické fáze – LC/MS a (U)HPLC kolony s různou pórovitostí i staničními fázemi
• GC a SPME – sériové produkty pro plynovou chromatografii a přípravu vzorku
• Databáze a knihovny standardů – METLIN, MSMLS, univerzální proteomické standardy (UPS), Retention Time Calibration

Použitá metodika a instrumentace

Workflow produktů je členěno do pěti kroků:

• 1) Příprava vzorku: CelLytic sady pro lyzi, Prot ePrep deplece, MSSAFE koktejl inhibitorů
• 2) Digestion & Labeling: Trypsin proteázy, SILAC látky, chemické derivatizátory (TMS, acylace)
• 3) Standardizace & Kalibrace: UPS standardy, MS Qual/Quant QC mix, Peptidační kalibranty, iTRAQ/mTRAQ, SILuMab
• 4) Chromatografická separace: Ascentis Express a BIOshell Fused-Core kolony pro LC-MS; TSKgel pro SEC a IEX; GC kolony a SPME
• 5) Detekce & Analýza: MALDI-MS kalibranty, METLIN databáze MS/MS spekter, stable-isotope library pro metabolity

Hlavní nabídka produktů

• Proteomika: SILAC značení, Seppro deplece vysoce hojné frakce, CelLytic extrakce, proteázy MS grade, AQUA a PEPscreen peptidové knihovny, iTRAQ/mTRAQ, ICAT, SILuMab pro mAb kvantifikaci
• Metabolomika: Supel-Select SPE (HLB, SAX, SCX), HybridSPE®-Phospholipid pro odstranění fosfolipidů, SupelMIP® molekulární imprinting, stabilně značené metabolity, GC derivatizátory, SPME vlákna
• Chromatografie: Kolony pro (U)HPLC/LC-MS – C18, C8, F5, RP-amide, HILIC, Phenyl-hexyl; SEC a IEX kolony TSKgel STAT
• Standardy & Databáze: Universal Proteomics Standards UPS1/UPS2, Retention Time Calibration Mix, SigmaProt intact protein LC-MS standard, METLIN MS/MS databáze, MSMLS metabolitová knihovna

Přínosy a praktické využití

Integrovaný sortiment podporuje:

• Maximalizaci citlivosti a selektivity LC-MS a MALDI-MS analýz
• Jednoduchou a reprodukovatelnou přípravu vzorků i v HT prostředí
• Standardizaci a ověřování metod napříč laboratořemi
• Efektivní objev a validaci biomarkerů v klinice, farmaceutickém vývoji, QA/QC

Budoucí trendy a možnosti využití

• Rozšíření využití vysoce propustných nano- a mikroproudových platforem
• Automatizace a mikrofluidické integrace přípravy vzorku a separace
• Směřování k multi-omics datové integraci (metabolomika + proteomika + genomika)
• Propojení s AI-podporovanou analýzou MS/MS spekter a predikcí struktur

Závěr

Komplexní portfolia produktů pokrývající celý MS workflow v proteomice a metabolomice umožňují výzkumníkům zefektivnit vývoj i validaci analytických metod a podporují objev nových biomarkerů. Jednotný katalog zajišťuje konzistentní výsledky napříč instrumentací a laboratořemi.

Reference

Text neobsahuje samostatný seznam literatury.