Accelerate Your Research with Advanced Omics Solutions

Význam tématu

Integrace multi-omics metod je klíčová pro hlubší pochopení biologických systémů, protože umožňuje propojení genetické informace, transkriptomu, proteomu a metabolomu. To vede k lepšímu odhalení regulačních procesů a souvislostí mezi molekulárními úrovněmi a fenotypem.

Cíle a přehled prezentace

Prezentace shrnuje pokročilé řešení Agilent pro multi-omics analýzy včetně instrumentace, spotřebního materiálu, analytických postupů a softwaru. Klade důraz na workflow pro metabolomiku, proteomiku i stabilní izotopové metody a integraci výsledků v rámci biologických drah.

Použitá metodika a instrumentace

• Chromatografie a MS: GC/MS (5977B), GC/QQQ (7000D), GC/Q-TOF (7200B), UHPLC-QQQ a Q-TOF (1290 Infinity II, 6400 a 6500 Series)
• Příprava vzorků: Captiva EMR-Lipid pro odstraňování fosfolipidů, Poroshell HILIC-Z kolony pro aminokyselinovou a metabolomickou analýzu
• Ionizační zdroje: Agilent Jet Stream ESI, nízkoenergetická EI pro potvrzení molekulárního iontu
• Ion Mobility All Ions MS/MS: driftová separace fragmentů místo kvadrupólové izolace
• Reálná měření buněčné funkce: Seahorse XF pro kinetiku glykolýzy a dýchání a ATP rate assay
• Softwarové nástroje: MassHunter Core, Profinder, Mass Profiler Professional, Pathway Architect, VistaFlux, Spectrum Mill, PCDL Manager, Skyline, METLIN, Fiehn Library

Hlavní výsledky a diskuse

Odstraňování fosfolipidů přes 99 % v různých biologických matricích zlepšuje kvalitu LC/MS analýzy. Robustní HILIC-Z metodiky umožňují kvantifikaci volných aminokyselin a metabolitů, sledování metabolických změn v kultivačním médiu i účinků methotrexátu v purinové dráze. Stable isotope tracing pomocí VistaFlux zjednodušuje sledování izotopologů, dMRM databáze pro 219 centrálních metabolitů zrychluje cílenou analýzu. IM All Ions MS/MS poskytuje reprodukovatelná MS/MS spektra bez izolace, Seahorse XF odhaluje dynamiku výroby ATP.

Přínosy a praktické využití metody

• Komplexní multi-omics workflow od přípravy vzorku až po integraci dat
• Zvýšení citlivosti a selektivity analytických metod
• Automatizace procesů a snížení rizika chyb
• Vizualizace integrálních výsledků na biologických drahách pro podporu rozhodování

Budoucí trendy a možnosti využití

Další rozvoj se očekává v oblasti umělé inteligence a strojového učení pro analýzu multi-omics dat, vylepšení real-time sledování metabolického toku v živých buňkách, rozšiřování databází stabilních izotopů a zdokonalení software pro automatickou návrh pathway-directed experimentů a iterativní vylučování rušivých signálů.

Závěr

Agilent poskytuje ucelené portfolio instrumentace, spotřebního materiálu, metodik a softwaru pro efektivní multi-omics studie. Díky tomu lze získat hlubší biologické poznatky, zrychlit výzkumné workflow a zlepšit kvalitu rozhodování v biovědních i průmyslových aplikacích.

Reference

Žádné relevantní reference.