Software
ZaměřeníVýrobceAgilent Technologies
Význam tématu
Software pro řízení a zpracování dat od hmotnostních spektrometrů je klíčové pro moderní analytickou chemii.
Standardizované a unifikované prostředí snižuje čas nasazení, usnadňuje školení a zajišťuje konzistentní výsledky napříč platformami GC/MS, LC/MS a ICP-MS.
Rostoucí množství dat v oblastech potravinářství, farmacie, proteomiky, metabolomiky a forenzní toxikologie vyžaduje flexibilní a škálovatelné SW řešení.
Cíle a přehled studie / článku
Prezentace popisuje Agilent MassHunter Workstation a doplňující moduly zaměřené na kvalitativní i kvantitativní analýzy.
Cílem je představit hlavní funkce, pracovní postupy a možnosti automatizace pro aplikace v identifikaci neznámých látek, screening, kvantifikaci, profilování a integraci multiomic dat.
Moduly jsou navrženy pro jednotnou obsluhu přístrojů Agilent (GC/MSD, GC-FID, LC/QQQ, LC/TOF, QTOF, ICP-MS).
Použitá metodika a instrumentace
- Software MassHunter Acquisition, Qualitative Analysis, Quantitative Analysis, BioConfirm, PCDL Manager, Profinder, Mass Profiler, Mass Profiler Professional, Molecular Structure Correlator, SimLipid, Pathway Architect.
- Řízení a zpracování dat z přístrojů Agilent GC/MSD, GC-FID, LC/QQQ, LC/TOF, QTOF a ICP-MS.
- Správa referenčních databází PCD a PCDL s možností propojení na METLIN, NIST, Spectrum Mill.
- Operační prostředí Windows 7 Pro 64 bit, Excel 2013.
- Metodiky zahrnují parameterless integrátory (Agile2), tMRM, All Ions MS/MS, Molecular Feature Extraction (MFE), Find by Formula (FBF), Auto MS/MS a recursivní vyhledávání.
Hlavní výsledky a diskuse
- Jednotné prostředí MassHunter poskytuje komplexní kontrolu, kvalifikaci a kvantifikaci dat napříč různými MS systémy bez nutnosti střídání SW nástrojů.
- Qualitative Analysis nabízí pokročilé zobrazení chromatogramů, spekter, MFE a knihovních vyhledávání s přesností pod 10 ppm, podporou anotací a vizualizací strukturálních schémat.
- Kvantitativní modul využívá tMRM a parameterless Agile integrátor pro rychlou a spolehlivou kvantifikaci s detekcí odchylek pomocí více než 40 kvalitativních kontrol.
- Personal Compound Databases (PCD/PCDL) a nástroj Pathways to PCDL umožňují vytváření vlastních databází metabolit a následnou multiómickou interpretaci.
- Mass Profiler Professional integruje statistické nástroje (PCA, ANOVA, shlukování) a ID Browser pro umístění signálů do biologického kontextu, podporuje import z GC-MS, LC-MS, ICP-MS a NMR.
- Lipidomics modul SimLipid poskytuje vysokoproduktivní vyhledávání lipidů s využitím MS/MS pattern matchingu a exportem výsledků ve formátu .CEF pro další analýzu.
Přínosy a praktické využití metody
- Zkrácení času potřebného k validaci metod napříč laboratořemi a přístroji.
- Zvýšení spolehlivosti analýz díky pokročilým algoritmům pro detekci a integraci chromatografických vrcholů.
- Automatizace rutinních úloh, včetně reportingu do PDF, exportu do LIMS a generování .CEF souborů.
- Možnost rychle rozšířit databáze o vlastní referenční spektra a strukturální anotace pro lepší identifikaci neznámých sloučenin.
- Komplexní multiomic workflow spojující genomiku, proteomiku, metabolomiku a lipidomiku v jediné platformě.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Vývoj cloudových a síťových řešení pro sdílení a spolupráci na datech mezi pracovišti.
- Integrace umělé inteligence a strojového učení pro prediktivní identifikaci a kompenzaci chybějících dat.
- Rozšiřování referenčních databází s automatickou synchronizací komunitních repozitářů.
- Podpora nových iontových separačních technik (ion mobility, PASEF) a jejich integrace do pracovních postupů.
- Propojení s klinickými a biologickými databázemi pro personalizovanou medicínu a biomarkerové studie.
Závěr
Agilent MassHunter Workstation představuje komplexní softwarové řešení pro řízení a vyhodnocení dat z více MS platforem. Modulární architektura, podpora databází, statistických a pathway analyzátorů umožňuje efektivní identifikaci, kvantifikaci a multiomic interpretaci. Automatizace a standardizace výrazně zjednodušují nasazení ve výzkumu i rutinní analytické praxi.
Reference
- Blackwell A. a kol. MassHunter Software Overview, Tips & Tricks. Agilent Technologies, ASTS Vancouver, 8. 5. 2014 a ASTS La Jolla, 20. 5. 2014.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.