Příprava vzorků, Spotřební materiál
ZaměřeníMetabolomika, Proteomika, Lipidomika
VýrobceAgilent Technologies
Význam tématu
Manuální předkondicionování 96-jamkové desky s Agilent Captiva EMR–Lipid zásadně zlepšuje kvalitu separace biomolekul v LC/MS omics workflow. Předkondicionování předchází vazbě nechtěných kontaminantů, zajišťuje konzistentní tok rozpouštědla a optimalizuje retenci cílových analyzátů.
Cíle a přehled studie / článku
Tato metodika popisuje manuální postup předkondicionování desky pomocí pozitivního tlakového manifoldu. Cílem je připravit sorbent na následné frakcionace metabolitů, lipidů a proteinů z plazmy nebo kultivačních vzorků, aby byla dosažena vysoká reprodukovatelnost a efektivita extrakce.
Použitá metodika
Pro předkondicionování se připraví 180 ml směsi voda:methanol:ethanol (2:1:1), použité rozpouštědla musí být LC/MS třídy nebo vyšší. Každá z 96 jamek desky obdrží 800 µl této směsi, která je následně protlačena skrz sorbent pomocí tlakového manifoldu. Proces se opakuje dvakrát, přičemž nejprve se používá nastavení nízkého průtoku k zajištění rovnoměrné distribuce a poté vysoký tlak (10–20 psi) pro kompletní odstranění zbytkového rozpouštědla a nečistot.
Použitá instrumentace
- Agilent Captiva EMR–Lipid desky, 96-well, kód 5190-1001
- Agilent pozitivní tlakový manifold PPM-96 (low flow/high flow), kód 5191-4116
- Agilent 2-column reservoir, kód 203852-100
- Agilent single cavity reservoir, kód 201244-100
- Milli-Q Integral System s LC-Pak Polisher a 0,22 µm filtr (MilliporeSigma)
Hlavní výsledky a diskuse
Výsledkem předkondicionování je čistý sorbent s eliminovanými potenciálními kontaminanty, což vede k lepší obnovitelnosti a přesnosti analýzy. Aplikace nízkého a následně vysokého tlaku garantuje kompletní odstranění zbytků rozpouštědel a rušivých látek ve filtrech. Tento postup zvyšuje citlivost LC/MS měření a snižuje šum v signálu.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšení reprodukovatelnosti extrakce metabolitů, lipidů i proteinů
- Minimalizace křížové kontaminace mezi vzorky
- Optimalizace pracovní doby díky modularitě postupu
- Kompatibilita s manuálními i automatizovanými platformami Agilent
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace předkondicionování do plně automatizovaných omics workflow
- Rozšíření metody na další typy matrice, např. tkáňové extrakty
- Vývoj upravených sorbentů pro selektivní retenci specifických tříd lipidů
- Vyšší míra miniaturizace a high-throughput aplikace
Závěr
Manuální předkondicionování s Agilent Captiva EMR–Lipid je klíčovým krokem k dosažení vysoce kvalitních a reprodukovatelných dat v LC/MS omics analýzách. Dodržení navrženého protokolu s vhodně zvolenými tlakovými režimy zajišťuje optimální výkon sorbentu a minimalizuje rušivé vlivy během analýzy.
Reference
- Sartain M. et al. Enabling Automated, Low-Volume Plasma Metabolite Extraction with the Agilent Bravo Platform. Agilent Technologies application note, publication number 5994-2156EN, 2020.
- Van de Bittner G.C. et al. An Automated Dual Metabolite and Lipid Sample Preparation Workflow for Mammalian Cell Samples. Agilent Technologies technical overview, publication number 5994-5065EN, 2022.
- Van de Bittner G.C. et al. Automated Fractionation of Low-Volume Plasma Samples for LC/MS Multi-Omics. Agilent Technologies technical overview, publication number 5994-7357EN, 2024.
- Agilent Captiva EMR–Lipid Manual Fractionation of Low-Volume Plasma Samples for LC/MS Multi-Omics. Agilent Technologies method guide, publication number 5994-7482EN, 2024.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.