Příprava vzorků, Spotřební materiál
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceAgilent Technologies
Význam tématu
V oblasti LC/MS omics analýz se klade vysoký důraz na reprodukovatelnost extrakce a minimální pozadí kontaminantů. Předkondicionování sorpčních destiček Captiva EMR–Lipid optimalizuje povrch destičky, rovnoměrně navlhčuje sorbent a odstraňuje zbytky nedezinfikovaných částic. To vede k vyšší výtěžnosti a konzistentním výsledkům při následné frakcionaci metabolitů, lipidů a proteinů z biologických vzorků.
Cíle a přehled studie
Cílem předloženého návodu je implementovat automatizovaný proces předkondicionování 96-jamkových destiček Captiva EMR–Lipid na platformě Agilent Bravo Metabolomics Sample Prep. Metoda má zajistit jednotné navlhčení destiček a přípravu solventu blízkého matrici vzorku dříve, než dojde k separaci analytů z plazmy či buněčných kultur. Protokol je součástí Agilent end-to-end LC/MS omics workflow.
Použitá metodika a instrumentace
Ultrachlorované nebo LC/MS-grade rozpouštědla ve směsi 2:1:1 (voda:methanol:ethanol) se připraví v objemu 180 mL pro jednu destičku. Kapalina se aplikuje v dvou stejných krocích po 800 µL do každé jamky, přičemž Bravo platforma zajišťuje jejich přenos a propuštění pod vakuem. Čas a tlak filtrace lze upravit, dokud nejsou všechna espresso prázdná.
Použitá instrumentace
- Agilent Bravo Metabolomics Sample Prep Platform (G5589AA)
- Agilent Captiva EMR–Lipid 96-jamková destička (5190-1001)
- Agilent 250 µL jednorázové špičky, 96 v racku (19477-002)
- Agilent reservoir, single cavity (201244-100)
- Milli-Q Integral System s LC-Pak Polisher a 0,22 µm filtrací
Hlavní výsledky a diskuse
Implementace protokolu potvrdila rovnoměrné předkondicionování destiček a významné snížení variability mezi jamkami. Optimalizovaný přenos preconditioning solventu zajistil konzistentní vrstvení matrice, což vedlo k lepší reproducibilitě frakcionace metabolitů a lipidů. Eliminovalo se pozadí nechtěných kontaminantů a zlepšila se účinnost zachycení cílových analyzovaných látek.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda přináší následující výhody:
- Časová úspora díky plné automatizaci předkondicionování
- Vyšší konzistence a reproducibilita vzorků
- Snížení manuálních úkonů a rizika chyby
- Kompatibilita s dalšími Agilent omics workflow
Budoucí trendy a možnosti využití
Dalším krokem v rozvoji je integrace automatizovaných předkondicionovacích protokolů s umělou inteligencí pro adaptivní řízení parametrů filtrace a objemu solventu. Mikrofluidní moduly by mohly dále redukovat spotřebu vzorku a rozpouštědel. Kombinace multi-omics extrakcí na jedné platformě otevře cestu k komplexnímu biologickému profilování v klinických a farmaceutických laboratořích.
Závěr
Automatizovaný protokol předkondicionování Captiva EMR–Lipid 96-jamkových destiček na platformě Agilent Bravo představuje spolehlivý nástroj pro zvýšení konzistence LC/MS omics analýz. Standardizace tohoto kroku minimalizuje kontaminaci, optimalizuje výtěžnost a zkracuje dobu přípravy vzorků, což přispívá k vyšší kvalitě dat v biochemickém výzkumu a QA/QC kontrolách.
Reference
- Sartain M.; et al. Enabling Automated, Low-Volume Plasma Metabolite Extraction with the Agilent Bravo Platform. Agilent Technologies application note, publication number 5994-2156EN, 2020.
- Van de Bittner G. C.; et al. An Automated Dual Metabolite + Lipid Sample Preparation Workflow for Mammalian Cell Samples. Agilent Technologies technical overview, publication number 5994-5065EN, 2022.
- Van de Bittner G. C.; et al. Automated Fractionation of Low-Volume Plasma Samples for LC/MS Multi-Omics. Agilent Technologies technical overview, publication number 5994-7357EN, 2024.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.