HPLC
ZaměřeníProteomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Význam tématu
N-glykanové struktury u glykoproteinů hrají klíčovou roli v jejich biologické aktivitě a mohou sloužit jako biomarkery onemocnění nebo ovlivňovat účinnost bioterapeutik. Precizní a rychlá analýza glykanového profilu je proto zásadní pro výzkum i rutinní kontrolu kvality biopharmaceutik.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo vyvinout jednoduchou a rychlou metodu kvantitativního profilování N-glykanů bez nutnosti chemického značení. Metoda kombinuje enzymatické uvolnění glykanů (PNGase-F) s mixed-mode UHPLC separací a přímou detekcí nabitými aerosolovými částicemi (CAD), přičemž je zachována kompatibilita s hmotovou spektrometrií pro další šetrnou charakterizaci.
Použitá metodika a instrumentace
UHPLC separace:
- Zařízení: Thermo Scientific Vanquish UHPLC s Charged Aerosol Detector H
- Kolóna: GlycanPac AXR-1 (1,9 µm, 2,1 × 100 mm), teplota 30 °C
- Mobilní fáze A: voda; B: 100 mM amonný formiát pH 4,4; průtok 0,4 mL/min; gradient 4→39 % B (1 mM/min)
- Injekce 2 µL; odpařovací teplota CAD 50 °C; datová frekvence 10 Hz; filtr 5 s
- PNGase-F digest s QA-Bio deglykozylací sadou
- Denaturace 100 °C, inkubace 18 h při 37 °C
- Odsátí supernatantu a přímá injekce do UHPLC
Hlavní výsledky a diskuse
- Optimální gradientní sklon 1 mM/min poskytuje nejlepší rozlišení
- Zařazení 5 % organického rozpouštědla mírně zlepšilo S/N, nebylo však nezbytné
- Evaporační teplota 50 °C je kompromisem mezi citlivostí a stabilitou signálu
- Detekční limity pod 10 ng/µL (0,6–8,8 pmol/µL); dynamický rozsah > 100×
- Retenční časy RSD < 0,1 %; plocha špiček RSD < 3 %
- Přímá detekce glykanů z fetuinu a alfa-kyselého glykoproteinu bez interference reagencií
Přínosy a praktické využití metody
- Eliminace časově náročného značení šetří náklady i čas
- Vysoká citlivost a linearita vyhovují potřebám QC laboratoří
- Kompatibilita s MS umožňuje multifázovou analýzu ze stejného vzorku
- Univerzální detekční princip pro všechny nevolatilní analyty
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace UHPLC-CAD s high-resolution MS pro detailní strukturální analýzu
- Automatizace vzorkování a vysokopropustné platformy pro vysoce efektivní screening
- Rozšíření aplikací na široké spektrum glykoproteinů v biomedicíně a regulované výrobě
- Využití strojového učení pro rychlé vyhodnocování glykanových profilů
Závěr
Vyvinutá label-free UHPLC-CAD metoda je robustní, přesná a rychlá. Nabízí uniformní odezvu, vysokou citlivost a přesnost retence i plochy špiček, ideální pro QC bioterapeutik i výzkumné účely. Eliminace derivatizace zjednodušuje workflow a zachovává kompatibilitu s dalšími analytickými technikami.
Reference
- Varki A Biological Roles of Oligosaccharides All of the Theories Are Correct Glycobiology 1993 3 97-130
- Spencer D Freeke J Barattini V A HILIC Method for the Analysis of Bovine Fetuin Glycans Thermo Scientific Application Note 2072 2013
- Hurum D Basumallick L Rohrer J Evaluating protein glycosylation in limited-quantity samples by HPAE-PAD Thermo Scientific Application Note 1050 2013
- Udayanath A Saba J Viner R Liu X Rao S Agroskin Y Huhmer A Pohl C Integrated LC/MS Workflow for the Analysis of Labeled and Native N-Glycans from Proteins Using a Novel Mixed-Mode Column and a Q Exactive Mass Spectrometer Thermo Scientific Application Note 595 2014
- Aich U Saba J Liu X Thayer J Pohl C Separation of 2AB-labeled N-linked glycans from bovine fetuin on a novel ultra-high resolution mixed-mode column Thermo Scientific Application Note 20908 2014
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.