Label-Free Analysis by HPLC with Charged Aerosol Detection of Glycans Separated by Charge, Size and Isomeric Structure

Postery | 2016 | Thermo Fisher Scientific | PittconInstrumentace
HPLC
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Thermo Fisher Scientific

Význam tématu


N-glykanové struktury u glykoproteinů hrají klíčovou roli v jejich biologické aktivitě a mohou sloužit jako biomarkery onemocnění nebo ovlivňovat účinnost bioterapeutik. Precizní a rychlá analýza glykanového profilu je proto zásadní pro výzkum i rutinní kontrolu kvality biopharmaceutik.

Cíle a přehled studie


Cílem bylo vyvinout jednoduchou a rychlou metodu kvantitativního profilování N-glykanů bez nutnosti chemického značení. Metoda kombinuje enzymatické uvolnění glykanů (PNGase-F) s mixed-mode UHPLC separací a přímou detekcí nabitými aerosolovými částicemi (CAD), přičemž je zachována kompatibilita s hmotovou spektrometrií pro další šetrnou charakterizaci.

Použitá metodika a instrumentace


UHPLC separace:
  • Zařízení: Thermo Scientific Vanquish UHPLC s Charged Aerosol Detector H
  • Kolóna: GlycanPac AXR-1 (1,9 µm, 2,1 × 100 mm), teplota 30 °C
  • Mobilní fáze A: voda; B: 100 mM amonný formiát pH 4,4; průtok 0,4 mL/min; gradient 4→39 % B (1 mM/min)
  • Injekce 2 µL; odpařovací teplota CAD 50 °C; datová frekvence 10 Hz; filtr 5 s
Enzymatická příprava:
  • PNGase-F digest s QA-Bio deglykozylací sadou
  • Denaturace 100 °C, inkubace 18 h při 37 °C
  • Odsátí supernatantu a přímá injekce do UHPLC

Hlavní výsledky a diskuse


  • Optimální gradientní sklon 1 mM/min poskytuje nejlepší rozlišení
  • Zařazení 5 % organického rozpouštědla mírně zlepšilo S/N, nebylo však nezbytné
  • Evaporační teplota 50 °C je kompromisem mezi citlivostí a stabilitou signálu
  • Detekční limity pod 10 ng/µL (0,6–8,8 pmol/µL); dynamický rozsah > 100×
  • Retenční časy RSD < 0,1 %; plocha špiček RSD < 3 %
  • Přímá detekce glykanů z fetuinu a alfa-kyselého glykoproteinu bez interference reagencií

Přínosy a praktické využití metody


  • Eliminace časově náročného značení šetří náklady i čas
  • Vysoká citlivost a linearita vyhovují potřebám QC laboratoří
  • Kompatibilita s MS umožňuje multifázovou analýzu ze stejného vzorku
  • Univerzální detekční princip pro všechny nevolatilní analyty

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Integrace UHPLC-CAD s high-resolution MS pro detailní strukturální analýzu
  • Automatizace vzorkování a vysokopropustné platformy pro vysoce efektivní screening
  • Rozšíření aplikací na široké spektrum glykoproteinů v biomedicíně a regulované výrobě
  • Využití strojového učení pro rychlé vyhodnocování glykanových profilů

Závěr


Vyvinutá label-free UHPLC-CAD metoda je robustní, přesná a rychlá. Nabízí uniformní odezvu, vysokou citlivost a přesnost retence i plochy špiček, ideální pro QC bioterapeutik i výzkumné účely. Eliminace derivatizace zjednodušuje workflow a zachovává kompatibilitu s dalšími analytickými technikami.

Reference


  1. Varki A Biological Roles of Oligosaccharides All of the Theories Are Correct Glycobiology 1993 3 97-130
  2. Spencer D Freeke J Barattini V A HILIC Method for the Analysis of Bovine Fetuin Glycans Thermo Scientific Application Note 2072 2013
  3. Hurum D Basumallick L Rohrer J Evaluating protein glycosylation in limited-quantity samples by HPAE-PAD Thermo Scientific Application Note 1050 2013
  4. Udayanath A Saba J Viner R Liu X Rao S Agroskin Y Huhmer A Pohl C Integrated LC/MS Workflow for the Analysis of Labeled and Native N-Glycans from Proteins Using a Novel Mixed-Mode Column and a Q Exactive Mass Spectrometer Thermo Scientific Application Note 595 2014
  5. Aich U Saba J Liu X Thayer J Pohl C Separation of 2AB-labeled N-linked glycans from bovine fetuin on a novel ultra-high resolution mixed-mode column Thermo Scientific Application Note 20908 2014

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Label-Free Analysis by UHPLC with Charged Aerosol Detection of Glycans Separated by Charge, Size, and Isomeric Structure
Label-Free Profiling of O-linked Glycans by HPLC with Charged Aerosol Detection
Improved profiling of sialylated N-linked glycans by ion chromatography-Orbitrap mass spectrometry
Charge Profiling of 2AB-labelled N-linked Glycans
Charge Profiling of 2AB-labelled N-linked Glycans
2016|Agilent Technologies|Aplikace