SialoCapper-ID Kit : A Novel Derivatization Tool for Glycan Analysis by Mass Spectrometry

Aplikace | 2021 | ShimadzuInstrumentace
Spotřební materiál, MALDI, LC/TOF, LC/MS
Zaměření
Klinická analýza
Výrobce
Shimadzu

Význam tématu


Neutralizace a analýza sialových kyselin na glykanech je klíčová pro pochopení biologických interakcí, např. mechanismu infekce viru chřipky nebo účinků biofarmaceutik. Detekce a rozlišení izomerů α2,3 a α2,6 navazujících sialových kyselin poskytuje hlubší vhled do strukturálních změn glykosylace a podporuje vývoj a kontrolu kvality léčiv.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem článku je představit inovativní metodiku SALSA (sialic acid linkage-specific alkylamidation) a přidružený SialoCapper™-ID Kit, která umožňuje chemickou derivatizaci sialových kyselin, zpřehledňuje mass spectra a diskriminuje α2,3/α2,6 izomery bez nutnosti porovnání se standardy nebo použití enzymů.

Použitá metodika a instrumentace


  • Přenosná chemická derivatizace SALSA ve dvou krocích: konverze α2,6-sialových kyselin na isopropylamid (∆m +41 Da) a α2,3 na methylamid (∆m –18 Da vedoucí k rozdílu 28 Da mezi izomery).
  • Dva režimy aplikace: kapalinová reakce pro vzorky v roztoku a pevná fáze s použitím BlotGlyco® perel pro simultánní purifikaci a derivatizaci.
  • Analytická instrumentace: MALDImini-1 kompaktní MALDI-DIT (Shimadzu) pro MALDI-MS a MSn analýzu, purifikační GL-Tip Amide pro odstranění přebytečných reagentů, volitelné HILIC čip/kolony pro odsolení.
  • Software: Supporting Tool for SialoCapper-ID Kit – pro odhad složení glykánů s aplikovanými modifikacemi a pokročilou filtraci izomerů.

Hlavní výsledky a diskuse


  • Disociace izomerů: Po derivatizaci se mezi α2,3 a α2,6 sialovými kyselinami objevuje rozdíl 28 Da, což usnadňuje jejich identifikaci bez chromatografie.
  • Zvýšená citlivost: Neutralizací karboxylových skupin se potlačí ztráty sialových zbytků a vícenásobná addukce kovů, což zjednoduší spektrální interpretaci a zlepšuje kvantitativní přesnost.
  • Praktické ukázky: Analýza standardních glykánů z fetuinu a N-glykánů ze séra prokázala čistší spektra, zřetelné vzájemné poměry izomerů a možnost potvrzení vazebných typů v MS2 spektrech.
  • Software umožnil jednoznačné určení složení při aplikaci filtru α2,3/α2,6, což eliminovalo nepravděpodobné kandidáty a podpořilo biologickou relevanci objevů.

Přínosy a praktické využití metody


  • Úspora času a práce: Eliminace potřeby standardů či enzymatické hydrolýzy pro rozlišení vazeb.
  • Kompatibilita: Možnost integrace do stávajících workflow s běžnými metodami značení a purifikace glykánů.
  • Citlivost: Detekce stopových množství sialoglykanů bez plýtvání vzorkem.
  • Flexibilita: Aplikace v kapalné i pevné fázi, kompatibilita s dalšími chemickými a enzymatickými úpravami.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Rozšíření na další třídy glykokonjugátů, např. glykolipidy nebo proteomické rozbory sialylace.
  • Integrace s LC-MS/MS v režimu vysokého průtoku pro klinické a průmyslové aplikace.
  • Vývoj automatizovaných systémů pro přípravu vzorků a sítí pro datovou analýzu s podporou strojového učení.
  • Vylepšení softwaru a databází pro rychlou dekonvoluci a interpretaci komplexních glykanových profilů.

Závěr


SialoCapper-ID Kit představuje robustní a snadno implementovatelnou chemickou metodiku pro stabilizaci a rozlišení vazeb izomerů sialových kyselin v glykanových analýzách pomocí hmotnostní spektrometrie. Díky zvýšené citlivosti, zjednodušenému workflow a unikátnímu software přispívá k přesnějšímu pochopení strukturálních a biologických vlastností glykosylace.

Reference


  • Nishikaze T., et al. Differentiation of Sialyl Linkage Isomers by One-Pot Sialic Acid Derivatization for Mass Spectrometry-Based Glycan Profiling. Anal Chem. 2017;89:2353-2360.
  • Hanamatsu H., et al. Sialic acid Linkage Specific Derivatization of Glycosphingolipid Glycans by Ring-Opening Aminolysis of Lactones. Anal Chem. 2018;90:13193-13199.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

N-Glycan Analysis of ACE2 as SARS-CoV-2 Receptor
Sialic Acid Linkage Isomer Discrimination of N-glycans derived from Rat Cochlea using SialoCapper-ID Kit
Analysis of Serum N-Glycans of Gene-KO Mouse Using MALDI-7090 and SialoCapper-ID Kit
Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers