Spotřební materiál, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC kolony
ZaměřeníProteomika
VýrobceWaters
Význam tématu
Peptidové mapování je základní technikou pro charakterizaci biopharmaceutik a kontrolu kvality proteolytických vzorků. Tradičně se při této metodě využívají mobilní fáze s trifluoroctovou kyselinou (TFA), která sice zlepšuje tvar píků, avšak výrazně potlačuje signál v ESI-MS. Použití slabšího iontově párovacího činidla, jako je kyselina mravenčí (FA), vyžaduje sloupce s nezávislostí na silných párovacích činidlech a nabízí citlivější detekci hmotnostní spektrometrií.
Cíle a přehled studie
Studie porovnává novou stacionární fázi Charged Surface Hybrid (CSH) C18 s konvenčními BEH C18 a superficially porous C18 sloupci při separaci tryptických peptidů z enolázy a při rozlišení polypeptidů do 12 kDa. Cílem bylo ověřit, zda CSH130 C18 umožní vysokou peak capacity i při použití FA mobilních fází a jak si vede u větších peptidů a malých proteinů.
Použitá instrumentace
- Chromatografický systém: Waters ACQUITY UPLC H-Class Bio System s termostatovanou kolonkou (40 °C) a autosamplerem (10 °C)
- Mass spektrometr: Xevo G2 Q-Tof v režimu ESI+ s rozlišením a scan rate 10 Hz
- Sloupce: ACQUITY UPLC CSH130 C18 (1,7 µm, 130 Å), BEH130 C18 (1,7 µm, 130 Å), BEH300 C18 (1,7 µm, 300 Å), superficially porous C18 (1,7 µm, 100 Å)
- Vzorky: MassPREP Enolase Digestion Standard; směs velkých peptidů a malých proteinů (1–12 kDa) v 0,1 % FA ve vodě
- Válce: LCGC Certified Clear Glass Qsert Vial
Hlavní výsledky a diskuse
- Peak capacity: CSH130 C18 s FA dosáhl hodnoty 532, což představuje nárůst o ~30 % oproti BEH130 (399) a superficially porous C18 (405).
- Selektivita a retence: CSH130 C18 vykázal odlišné pořadí elučních časů peptidů, přičemž polarita a náboj peptidů ovlivňovaly jejich interakci s povrchem sloupce.
- Separace velkých peptidů a malých proteinů: CSH130 C18 nabídl nejlepší tvar píků pro druhy až do ~6 kDa (např. insulin). Pro větší proteiny (ubiquitin, cytochrom c) dosáhl BEH300 C18 mírně lepšího rozlišení díky větším pórům.
- Citlivost MS: Použití FA mobilních fází s CSH130 C18 minimalizovalo iontovou supresi a umožnilo citlivější detekci oproti TFA.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda s CSH130 C18 umožňuje vysokou kapacitu a citlivost LC-MS peptidového mapování bez nutnosti silných iontově párovacích činidel. Výsledky ukazují, že je vhodná pro rutinní QC biopharmak, analýzu terapeutických inzulinů i detailní charakterizaci peptidů v komplexních směsích.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Optimalizace mobilních fází pro ještě širší rozsah kyselin a pufrů šetrných k MS.
- Rozvoj povrchově modifikovaných fází cílených na specifické posttranslační modifikace peptidů.
- Integrace s vysokorychlostními a multidimenzionálními LC systémy pro komplexní proteomické aplikace.
Závěr
Nová CSH130 C18 stacionární fáze prokázala v kombinaci s FA mobilními fázemi vynikající výkon pro peptidové mapování i separaci malých proteinů. Nabízí vyšší peak capacity, unikátní selektivitu řízenou povrchovým nábojem a lepší citlivost v LC-MS analýzách než tradiční C18 materiály.
Reference
- Kuhlmann FE et al. J Am Soc Mass Spectrom. 1995;6(12):1221–1225.
- Apffel A et al. J Chromatogr A. 1995;712(1):177–190.
- Chakraborty AB, Berger SJ. J Biomol Tech. 2005;16(4):327–335.
- Annesley TM. Clin Chem. 2003;49(7):1041–1044.
- Temesi D, Law B. LC-GC Int. 1999;17:626–632.
- Lauber MA et al. Waters Application Note 720004568EN. 2013.
- Chambers EE et al. Bioanalysis. 2013;5(1).
- Gillece-Castro BL et al. Waters Application Note 720001792EN. 2011.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.