Agilent MassHunter Profinder Software

Význam tématu

Agilent MassHunter Profinder představuje pokročilý nástroj pro extrakci molekulárních znaků z hromadných dat hmotnostní spektrometrie. Kombinuje cílené i necílené přístupy k získání kompletního přehledu o sloučeninách v analýzovaných vzorcích. Díky tomu zkracuje dobu analýzy a usnadňuje diferenciální studie ve výzkumu malých molekul, intact proteinů i izotopologického profilování.

Cíle a přehled studie

Cílem popsaného softwaru je podpořit práci s větším množstvím MS dat najednou a zvýšit kvalitu výsledků skrze:

• automatickou detekci a zarovnání sloučenin napříč vzorky,
• možnost opakované analýzy v batch-recursive režimu,
• podporu cílených i necílených workflow.

Použitá metodika a instrumentace

Metodika vychází z algoritmu Molecular Feature Extraction (MFE), který rozděluje spektra na biny, zarovnává je a identifikuje kandidátní sloučeniny na základě m/z, retenční doby a intenzity signálu. Klíčové prvky:

• batch-recursive módy pro vylepšenou opakovatelnost,
• cílené vyhledávání známých vzorců ve velkých datových sadách,
• manuální vizualizace a re-integrace signálů pro ověření extrakce.

Instrumentace:

• Hmotnostní spektrometry Agilent (TOF, Q-TOF) s GC, LC, CE či SFC aparaturou,
• nominal mass GC/MS systémy.

Hlavní výsledky a diskuse

Software prokázal:

• rychlé a multithreadové zpracování rozsáhlých profilovacích experimentů,
• přesnou rekurzivní extrakci vedoucí k vyšší selektivitě detekce,
• efektivní vizualizaci výsledků a snadnou manuální validaci,
• bezproblémové exporty do formátů .CEF, .PFA a .CSV pro další analýzu.

Diskuse ukazuje, že kombinace cíleného i necíleného přístupu významně zkracuje pracovní postupy a zvyšuje spolehlivost identifikace nových i známých sloučenin.

Přínosy a praktické využití metody

Profinder nachází uplatnění v:

• metabolomice potravin, nápojů a životního prostředí,
• farmaceutickém výzkumu intact proteinů,
• izotopologickém flux analýzách s 13C, 15N či 2H značením,
• QA/QC laboratořích vyžadujících rychlé a opakovatelné výsledky.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se integrace s cloudovými platformami a pokročilými AI nástroji pro automatickou anotaci sloučenin. Dále vývoj modulů pro lipidomiku, proteomiku a rozšíření kapacit pro vysokorychlostní analýzu stabilních izotopů. Vzniká potenciál pro propojení s LIMS, datovými repozitáři a dalšími bioinformatickými řešeními.

Závěr

Agilent MassHunter Profinder výrazně zrychluje a zefektivňuje extrakci molekulárních dat z hmotnostní spektrometrie. Díky kombinaci batch-recursive režimů, manuální validace a bohatých exportních formátů podporuje široké spektrum aplikací od malých molekul až po proteiny a izotopologii.

Reference

Agilent Technologies, Inc. (2016). Agilent MassHunter Profinder Software. © Agilent Technologies, Inc., USA