MassHunter Profinder Software - Quick Start Guide

Význam tématu

MassHunter Profinder je klíčový nástroj pro extrakci a porovnávání chemických látek z hromadných dat získaných TOF, Q-TOF a GC/MSD přístroji. Přesná identifikace a zarovnání chromatografických vrcholů významně zjednodušuje další chemometrické analýzy, statistickou klasifikaci a vizualizaci metabolických sítí.

Cíle a přehled studie

Cílem přehledu je představit základní pracovní postupy Profinderu, jeho extrakční algoritmy a novinky ve verzi B.08.00 SP2. Dokument popisuje postupy přidání vzorků, časovou korekci chromatogramů, úpravu parametrů extrakce, export výsledků a uložení projektů.

Použitá metodika a instrumentace

Profinder využívá tyto klíčové algoritmy:

• Batch Molecular Feature Extraction (MFE) – chromatografická dekonvoluce a seskupování podle hmotnosti a retenčního času
• Batch Recursive Feature Extraction (RFE) – rekurzivní extrakce cílových signálů dle mediánů získaných z MFE
• Batch Targeted Feature Extraction (TFE) – cílená extrakce na základě vstupních vzorců nebo CEF databází
• Batch Isotopologue Extraction (IE) – detekce a kvantifikace stabilně značených izotopologů s korekcí přirozeného izotopického pozadí

Pro časovou korekci chromatogramů nabízí Profinder dvě metody:

• Interpolací pomocí Legendreových polynomů 5. řádu s tlumicí maticí
• CE-specifický model založený na fyzikálních principech kapilární elektroforézy

Instrumentace:

• Agilent MassHunter Profinder Software B.08.00 SP2
• Hmotnostní spektrometry: LC/TOF, LC/Q-TOF, GC/Q-TOF, GC/MSD EI
• Platformy pro další analýzu a vizualizaci: Mass Profiler Professional, Omix Premium

Hlavní výsledky a diskuse

Verze B.08.00 SP2 přináší:

• Podporu časové korekce RT driftu vůči referenčním datům či databázi standardů
• Možnost práce s více skupinami vzorků a jejich přímý export do MPP
• Rozšířenou podporu neřízené i rekurzivní extrakce pro GC/Q-TOF a GC/MSD
• Vícejádrové zpracování a optimalizaci paměti pro rozsáhlé projekty

Díky tomu se dosahuje vyšší spolehlivosti binningu, nižšího počtu falešně pozitivních a negativních nálezů a zrychlení zpracování rozsáhlých datových sad.

Přínosy a praktické využití metody

Profinder zkracuje dobu zpracování a zjednodušuje:

• Hromadnou extrakci chromatografických a masových dat
• Automatické generování a kontrolu EIC/ECC v intuitivním uživatelském rozhraní
• Export do PFA, CEF a CSV pro chemometrickou analýzu a vizualizaci metabolických toků
• Opakované ladění parametrů a zpětnou re-analýzu uložených projektů

Budoucí trendy a možnosti využití

Dálším směrem je integrace metod strojového učení pro prediktivní filtraci šumu, rozšíření podpory nových vysokorozlišovacích MS technik a hlubší analýza izotopomerů. Vývoj se bude orientovat na vyšší automatizaci, cloudové platformy a pokročilé vizualizace v biochemických sítích.

Závěr

Agilent MassHunter Profinder představuje robustní řešení pro extrakci a zarovnání chemických signálů z TOF/Q-TOF a GC/MS dat. Verze B.08.00 SP2 zvyšuje flexibilitu a výkon aplikace, což přináší přímé výhody v metabolomice, průmyslové analytice a výzkumných laboratořích.

Reference

• Reijenga J. et al. „Pherogram normalization in capillary electrophoresis and micellar electrokinetic chromatography analyses in cases of sample matrix-induced migration time shifts“. Journal of Chromatography B, vol. 770, 2002, s. 45–51.