Maximizing Phosphopeptide Recovery in LC-MS Studies with MaxPeak High Performance Surfaces Technology

Aplikace | 2021 | WatersInstrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Waters

Význam tématu


Analýza fosfopeptidů pomocí LC-MS je klíčová pro proteomiku i objevování biologických markerů, avšak interakce kovových povrchů chromatografických systémů s fosfátovými skupinami vede k nízké obnovitelnosti a špatnému tvaru piků. Technologie MaxPeak High Performance Surfaces (HPS) cíleně minimalizuje tyto nežádoucí interakce a znamená významný krok kupředu ve spolehlivosti a citlivosti analýz fosforylovaných peptidů.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem bylo porovnat konvenční chromatografický systém s HPS upravenou verzí (ACQUITY PREMIER) v oblasti obnovitelnosti a detekce fosfopeptidů. Jako modelové vzorky byly zvoleny tryptické digesty alfa- a beta-kaseinu a standardní syntetické směsi PhosphoMix. Studie hodnotí vliv počtu fosforylací a délky peptidů na signál a kvalitu chromatografických piků.

Použitá metodika a instrumentace


Vzorky: tryptické digesty alfa- a beta-kaseinu; syntetické směsi PhosphoMix 1 a 3.

Chromatografie:
  • LC systémy: ACQUITY UPLC I-Class (konvenční) a ACQUITY PREMIER (HPS)
  • Kolony: CSH 2.1×100 mm (běžná i HPS úprava)
  • Mobilní fáze: A=H2O+0.1% HCOOH, B=ACN+0.1% HCOOH
  • Gradient 1–40 % B za 15 min, průtok 150 µL/min, teplota kolony 55 °C, vzorku 8 °C

Hmotnostní spektrometrie:
  • MS systém: SYNAPT XS, ESI+ mód
  • Režim akvizice: ToF MSE (50–2000 Da)
  • Trap CE ramp 14–40 eV, kapilární napětí 2.2 kV, kužel 30 V

Software: MassLynx v4.2, PLGS 3.0.3, Skyline.

Hlavní výsledky a diskuse


HPS úprava zlepšila detekci i tvar piků fosfopeptidů bez ovlivnění nemodifikovaných peptidů. Některé peptidy nebyly v konvenčním systému vůbec detekovatelné, zatímco v HPS konfiguraci vykázaly vysoké iontové počty a ostré chromatografické píky. Efekt zesiloval se s rostoucím počtem fosforylací. Pokrytí sekvence beta-kaseinu v PLGS ukázalo výrazný nárůst identifikovaných fosforylovaných sekvencí pouze v HPS systému.

Přínosy a praktické využití metody


Ultratrvanlivá bariéra HPS:
  • Odstraňuje potřebu opakované pasivace kovových cest přídavnými činidly
  • Zvyšuje citlivost i pro nízko protonované fosfopeptidy
  • Zlepšuje kvantitativní reprodukovatelnost v proteomických studiích

Budoucí trendy a možnosti využití


Rozšíření HPS povrchů na další třídy kovových komponent LC-MS by mohlo vést k univerzálnímu zvýšení výkonu pro široké spektrum polarizovaných analytů. Integrace s novými iontovými zdroji a rozšířenými režimy fragmentace může dále zlepšit identifikaci a kvantifikaci posttranslačních modifikací.

Závěr


MaxPeak HPS technologie zásadně zvyšuje obnovitelnost fosfopeptidů v LC-MS analýzách, odstraňuje ztráty v kovových kapalinových cestách a přináší ostřejší, citlivější a spolehlivější data. Tato inovace posouvá hranice kvalitativních a kvantitativních proteomických aplikací.

Reference


1. Liu X. et al. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2005;19(19):2747–2756.
2. Winter D.J. et al. J. Proteome Res. 2009;8(1):418–424.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Increased Sensitivity for LC-MS Analysis of Phosphopeptides on an ACQUITY QDa Detector Using XSelect Premier Columns
Improving Chromatographic Separations Of Biopharmaceuticals With MaxPeak High Performance Surfaces (HPS) Technology
Enhancing Phosphopeptide Quantitation using PREMIER Peptide CSH C18 Columns
Increasing Recovery of Phosphorylated Peptides Using ACQUITY PREMIER Technology Featuring MaxPeak High Performance Surfaces