Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

Út, 23.3.2021 | Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

V srpnu až září 2020 jsem pro Vás představil 5ti dílnou serii webinářu Wiley Webinar Series o vyhledávání v knihovně EI spekter NIST. Série demonstruje efektivní využití softwaru NIST, jako je MS Search, MS Interpreter a AMDIS s knihovnami Wiley, NIST a uživateli vytvořenými knihovnami.

V páté části se podíváme na:

Prezentaci k páté části naleznete v knihovně LabRulezGCMS.

  • Webinar topics
  • Help Files for NIST Search
  • General Windows commands/functions
  • Creating a user library spectrum
  • Creating a user library spectrum: opening edit spectrum
  • Creating a user library spectrum: spectrum information window
  • Creating a user library spectrum: adding comments and synonyms
  • Creating a user library spectrum: using windows notepad and tags
  • Creating a user library spectrum: comment field display with user tags
  • Creating a user library spectrum: comment field display showing user tags
  • Tags included with Wiley libraries
  • Possible quality checks before adding spectra to user libraries
  • Addition of spectrum to user library or creating new library
  • (Re)Index Indices for structure, hybrid search and InChIKey for user library
  • NIST formatted user libraries at Eastman Chemical Company
  • Software essentials and approach
  • Excerpt of typical DOS script used in approach
  • Webinar References
  • Acknowledgements

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

James Little/Mass Spec Interpretation Services
LinkedIn Logo
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.