Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Pá, 5.3.2021 | Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.

Mass Spec Interpretation Services/James Little: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

V srpnu až září 2020 jsem pro Vás představil 5ti dílnou serii webinářu Wiley Webinar Series o vyhledávání v knihovně EI spekter NIST. Série demonstruje efektivní využití softwaru NIST, jako je MS Search, MS Interpreter a AMDIS s knihovnami Wiley, NIST a uživateli vytvořenými knihovnami.

Ve třetí části se podíváme na:

Prezentaci ke třetí části naleznete v knihovně LabRulezGCMS.

  • Help files and manuals
  • Common Windows commands/functions
  • AMDIS essentials
  • Opening files
  • Deconvoluting spectra and obtaining manual spectrum using LMB
  • Evaluating results
  • Externalsearching of commercial/user libraries with NIST MS
  • Uncertain peaks
  • Plotting selected ion chromatograms in normal and log scale
  • Manually obtaining background subtracted spectra
  • Internalsearching (no structures) of commercial/user databases
  • Internalsearching (no structures) of target libraries
  • Optimizing peak detection
  • Comparing two chromatograms for differences
  • Retention indices
  • Problemno chromatogram/spectrum window
  • Webinar References
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

James Little/Mass Spec Interpretation Services
LinkedIn Logo
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.
Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.