Seminář Wiley - Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

Čt, 18.2.2021 | Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
V první části série Vám ukážeme, jak hledat v knihovně NIST MS pro identifikaci analytů při EI GC-MS analýzách. Data jsou měřeny na různých GC-MS systémech a poté se odesílají ke zpracování do NIST MS search.

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

V srpnu až září 2020 jsem pro Vás představil 5ti dílnou serii webinářu Wiley Webinar Series o vyhledávání v knihovně EI spekter NIST. Série demonstruje efektivní využití softwaru NIST, jako je MS Search, MS Interpreter a AMDIS s knihovnami Wiley, NIST a uživateli vytvořenými knihovnami.

V první části se podíváme na:

Prezentaci k první části naleznete v knihovně LabRulezGCMS.

  • NIST Mass Spectrometry Software and Wiley Libraries
  • Help Files for NIST Search
  • General Windows commands/functions
  • Customizing the windows
  • Tour of NIST Search Program
  • Critical parameters for searching library
  • Setting up presearch parameters
  • Primary Libraries of EI Spectra and Associated Structures
  • Other EI Libraries: Wiley/NIST Combined and specialty
  • Selecting the libraries used for spectral searches
  • Select the libraries used for similar structure searches
  • Selecting limits to avoid high match factors for partial spectra
  • Constraints applied to hit list after the list is determined
  • Saving setup of standard search parameters
  • Searching demonstration/Tip No. Synonyms and databases
  • Reverse match for mixtures versus standard match .
  • Display of related species
  • InChIKey field link to PubChem on web
  • Updating indices in older libraries
  • Library spectra m/z values by nominal not exact mass
  • Retention indices (Kovat) determined by users in AMDIS
  • Different derivative displays
  • Using NIST software to obtain proposed nominal MW and substructures
  • Webinar references
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

James Little/Mass Spec Interpretation Services
LinkedIn Logo
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.
 

Podobné články

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

Ve druhé části série Vám ukážeme, jak v NIST MS používat přesné a podobné hledání pomoci struktury. Uživatel může použít své preferované kreslicí programy pro zadávání struktur do programu NIST MS Search.
Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter

Ve třetí části série Vám ukážeme, jak pracuje AMDIS pro zpracování EI GC-MS dat. Kromě NIST Search lze totiž komponenty identifikovat také pomocí komerčních nebo uživatelských knihoven v rámci AMDIS.
Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

Hybridní vyhledávání v NIST MS knihovnách s vylepšeným vyhledávacím algoritmem generuje skóre podobnosti pro fragmenty i neutrální ztráty. Tím výrazně rozšiřuje možnosti komerčních a uživatelských knihoven.
Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
Video | Akademie

Seminář Wiley - Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

DEMO ukázka vytváření uživatelské knihovny NIST. Kromě toho se podíváme na levnou, ale výkonnou metodu pro její kombinování, aktualizaci, distribuci a archivaci v podnikové síti.