Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceWaters
Význam tématu
Ion mobility separace spojená s vysokým rozlišením hmotnostní spektrometrie hraje klíčovou roli v identifikaci a strukturálním potvrzení metabolitů, zejména u sloučenin s halogeny jako tienolidová kyselina a její isomer, které se liší mechanismy hepatotoxicity.
Cíle a přehled studie / článku
- Analyzovat metabolické dráhy tienolidové kyseliny (TA) a jejího isomeru (TAI) v moči potkanů po dávkách ve 2, 6 a 24 hodinách.
- Využít kombinaci LC-HRMS a ion mobility separation pro identifikaci a kvantifikaci metabolitů.
- Srovnat experimentálně získané hodnoty collision cross section (CCS) s predikcemi z ML modelů SVR a hybridního gradient boosting modelu.
Použitá metodika a instrumentace
- Chromatografie: ACQUITY UPLC I-Class s kolonnou HSS T3 1.8 µm, gradient 0.1% kyselina mravenčí ve vodě a acetonitrilu.
- MS: Vion IMS QTof, ESI+, LE 6 eV, HE ramp 35–55 eV, rozsah 50–1200 m/z, proud N2 jako drift plyn.
- Data processing: UNIFI Scientific Information System, WebMetabase, CCS predikční modely (SVR a hybrid).
Hlavní výsledky a diskuse
- Identifikováno několik klíčových metabolitů včetně hydroxylace, O-dealkylace, acetylace, glukuronidace, konjugací s glycinem a unikátní cysteinové konjugace u TAI.
- Halogenové izotopové vzory a charakteristické fragmenty usnadnily lokalizaci modifikací na molekulách.
- Experimentální CCS hodnoty ukázaly silnou korelaci s predikcemi, kde hybridní model dosáhl R2≈0.96 oproti SVR modelu.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšená jistota v strukturálním potvrzení metabolitů díky kombinaci IMS a MS/MS.
- Rychlejší a cílenější identifikace metabolitů pro toxikologický výzkum a vývoj léčiv.
- Možnost aplikace v QA/QC laboratořích pro sledování metabolitů i stopových látek.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Další zdokonalování ML modelů pro přesnější CCS predikci a strukturální návrh.
- Integrace IMS s datově nezávislou akvizicí (DIA) pro komplexnější profilaci metabolitů.
- Rozšíření na lidské klinické vzorky a farmakokinetické studie.
Závěr
Ion mobility HRMS se osvědčila jako efektivní přístup pro detailní charakterizaci a potvrzení struktur metabolitů tienolidové kyseliny a jejího isomeru. Hybridní model CCS zvyšuje důvěru v identifikaci, což přispívá k rychlejší validaci metabolických profilů v toxikologii.
Reference
- Bonierbale E. et al. Chem Res Toxicol 1999, 286–296.
- Coen M. et al. Chem Res Toxicol 2012, 2412–2422.
- King A. et al. J Chrom B 2018, 142–148.
- Grant I. Thesis, Imperial College London, 2016.
- Zhou Z. et al. J CBPA 2018, 34–41.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.