Enhancing detection of hemoglobin variants in clinical research using dried blood spot and high-resolution accurate mass (HRAM) Orbitrap mass spectrometry

Aplikace | 2024 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
LC/HRMS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/MS
Zaměření
Klinická analýza
Výrobce
Thermo Fisher Scientific

Význam tématu


Hematologické poruchy jako hemoglobinopatie a talasémie představují významnou zdravotní zátěž. Spolehlivá detekce a kvantifikace variant hemoglobinu je klíčová pro diagnostiku a monitorování nemocí jako srpkovitá anémie a další hemoglobinové dysfunkce. Metoda kombinující DBS (dried blood spots) a HRAM Orbitrap hmotnostní spektrometrie nabízí rychlý, automatizovatelný a vysoce citlivý přístup s minimální přípravou vzorku.

Cíle a přehled studie


Cílem studie bylo vyvinout top-down LC-MS workflow pro identifikaci a kvantifikaci variant hemoglobinu přímo z DBS. Využití Orbitrap Exploris 240 umožňuje vysoké rozlišení pro rozlišení blízkých hmotností variant a propojení identifikace (ProSightPD) s kvantifikací (TraceFinder) v jednom běhu.

Použitá metodika


  • Příprava vzorku: 10 µL DBS vzorku, extrakce vodou, srážení acetonitrilem, příprava na 96-jamkovou destičku (<1 hodina).
  • Chromatografie: Vanquish Flex UHPLC, kolona MAbPac RP 1×100 mm, 4 µm; gradient formiát/acetonitril/voda/isopropanol, průtok 0,12 mL/min, teplota 80 °C.
  • Hmotnostní spektrometrie: Orbitrap Exploris 240 s BioPharma volbou; H-ESI, pozitivní ionizace, rozlišení 120 000 (m/z 200); scan range 500–3000 m/z (intaktní hmotnosti), 780–920 m/z (cílená analýza).
  • Datová analýza: ProSightPD pro top-down sekvenování a identifikaci mutací; TraceFinder pro extrakci spekter a kvantifikaci pomocí nejintenzivnějších izotopových iontů z nábojových stavů +18 a +19.

Použitá instrumentace


  • UHPLC: Thermo Scientific Vanquish Flex
  • Kolona: MAbPac RP 1×100 mm, 4 µm
  • MS: Thermo Scientific Orbitrap Exploris 240 s BioPharma volbou
  • Software: Thermo Scientific ProSightPD, Thermo Scientific TraceFinder 5.1

Hlavní výsledky a diskuse


  • Intaktní hmotnostní rozdíl mezi normální β a mutantní β (Hb S) činí 30 Da (~1,6 m/z při +19), plně separovatelný při rozlišení 120 000.
  • Detekována čtyři řetězce hemoglobinu (α, β, δ, S-β) s >40% sekvenčním pokrytím β řetězců; δ řetězec potvrzuje citlivost metody i na nízkoabundantní varianty.
  • Lineární kvantifikace Hb S v rozsahu 2,5–100 mg/mL, LOD 1 mg/mL, LOQ 2,5 mg/mL, koeficient lineárity R2 > 0,99.
  • Mezidenní přesnost a opakovatelnost během 3 dní byla dobrá (RSD < 8 %, většina měření < 5 %).

Přínosy a praktické využití metody


  • Minimalizace přípravy vzorku a vysoká propustnost (96-jamkový formát) vhodné pro masový skríning.
  • Vysoké rozlišení Orbitrap MS umožňuje rozlišení izobarických variant bez komplikovaných chromatografických úprav.
  • Integrovaná identifikace a kvantifikace v jediném LC-MS běhu zkracuje dobu odezvy v klinickém výzkumu.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Rozšíření databáze cSNP pro detekci nových a vzácných hemoglobinových variant.
  • Automatizace přípravy DBS a datového zpracování pro rutinní klinickou diagnostiku.
  • Aplikace metody na další proteinové biomarkery v DBS a měření post-translačních modifikací hemoglobinu.

Závěr


Top-down LC-MS s Orbitrap Exploris 240 a DBS představuje rychlý, robustní a citlivý přístup pro identifikaci a kvantifikaci hemoglobinových variant. Metoda podporuje vysoce propustné zpracování vzorků a přesné rozlišení i velmi podobných forem hemoglobinu, což zefektivňuje diagnostiku a výzkum hemoglobinopatií.

Reference


  1. Bain BJ. Haemoglobinopathy Diagnosis. 2nd ed. Haemoglobin and the Genetics of Haemoglobin Synthesis. Blackwell Science; 2006.
  2. Modell B, Darlison M. Global epidemiology of haemoglobin disorders and derived service indicators. Bull World Health Organ. 2008;86:480–487.
  3. Billett HH. Hemoglobin and Hematocrit. In: Walker HK, Hall WD, Hurst JW, editors. Clinical Methods. 3rd ed. Boston: Butterworths; 1990. Chapter 151.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Enhanced Detection of Hemoglobin Variants in Clinical Research by DBS and High-Resolution Accurate Mass (HRAM) MS
High Throughput Testing Method with Newborn’s DBS for Hemoglobinopathies by LCMS-8045 with ZenTech Targeted MS/MS Hemo Device
Exploring Depth and Breadth of a Protein Complex Mixture with Top-Down Data-Independent Acquisition Using an Orbitrap Fusion Tribrid Mass Spectrometer
Analysis of Hemoglobin Variants using an Automated Sample Preparation Workstation Coupled to LC-MS