CONFIDENT O-GLYCOSYLATION SITE IDENTIFICATION USING A CYCLIC ION MOBILITY– MASS SPECTROMETER EQUIPPED WITH ECD FUNCTIONALITY

Postery | 2022 | Waters | ASMSInstrumentace
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Waters

Význam tématu

Analýza O glykosylace proteinů je klíčová pro charakterizaci bioterapeutik, protože glykosylace ovlivňuje stabilitu, biologickou aktivitu a imunogenicitu léčiv
Stanovení přesných míst O glykosylace přispívá k validaci kvality a konzistentnímu výrobnímu procesu proteinových terapeutik, jako je etanercept

Cíle a přehled studie

Studie demonstruje využití cyklického iontového mobilního spektrometru vybaveného buňkou pro electron capture dissociation k jednoznačné lokalizaci O glykosylace v peptidových fragmentech etanerceptu (Enbrel)
Prozkoumána byla především schopnost IMSn slicing a multi-pass IMS před ECD fragmentací izolovat a rozlišit izobarické glykopeptidy

Použitá metodika a instrumentace

  • Vzorky: trypsinový digest etanerceptu, koncentrace 2 až 4 µM pro infusion a LC-MS
  • Spektrometr: SELECT SERIES Cyclic IMS s post IMS ExD buňkou (eMSion)
  • Separace iontovou mobilitou: multi-pass IMS a IMSn slicing k rozlišení a izolaci před fragmentací
  • Fragmentace: electron capture dissociation zachovává glykosidické vazby a umožňuje lokalizaci zbytků
  • Chromatografie: ACQUITY I Class UPLC se CSH C18 kolonkou, gradient 1–35 % B za 25 minut při 60 °C
  • Zpracování dat: ExDViewer BETA pro semiautomatickou anotaci spekter

Hlavní výsledky a diskuse

  • Multi-pass IMS před ECD fragmentací umožnilo oddělit více izobarických forem glykosylovaných peptidů
  • IMSn slicing zvýšilo selektivitu izolace minoritních komponent a odhalilo vzácné glykoformy
  • Identifikováno bylo 11 O glykosidačních míst v etanerceptu, včetně pozičních izomer
  • LC HDMSE ECD spojilo chromatografickou separaci s iontovou mobilitou a ECD, což vedlo k jednoznačnému přiřazení glykanů k peptidovým zbytkům

Přínosy a praktické využití metody

  • Vysoká důvěra v lokalizaci O glykosylace u komplexních bioterapeutik
  • Schopnost rozlišit poziční izomery bez potřeby chemické derivatizace
  • Podpora QA/QC procesů pro validaci konzistence výrobních šarží

Budoucí trendy a možnosti využití

Rozvoj pokročilé iontové mobility a ECD bude dále umožňovat analýzu dalších labile posttranslačních modifikací
Kombinace s vysokorozlišovacími hmotovými spektrometry a automatizovaným zpracováním dat otevře nové možnosti v glykoproteomice a vývoji biosimilars

Závěr

Implementace cyklické iontové mobility s electron capture dissociation významně rozšiřuje schopnosti detailní analýzy O glykosylace
Přesné lokalizace glykozylovaných zbytků zvyšují spolehlivost charakterizace bioterapeutik a přispívají k lepší kontrole kvality

Reference

  1. S Ippoliti D Cooper Shepherd Q Yu J I Langridge Confident O glycosylation Site Identification for ENBREL etanercept Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System Application Note 720007458EN

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Confident O-glycosylation Site Identification for ENBREL (etanercept) Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System
In-Depth Versatile Characterization of Aspartic Acid Isomers via a Cyclic Ion Mobility Mass Spectrometry (cIMS)
Electron Capture Dissociation in Combination With High Performance Cyclic Ion Mobility Separation for Detailed Protein Studies
Revolutionize Metabolite Identification with Cyclic IMS