Analysis of Isomeric Permethylated Lacto-oligosaccharides Using Electron Transfer Dissociation Combined with Ion Mobility MS

Aplikace | 2013 | WatersInstrumentace
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Waters

Význam tématu


Glykanové struktury a glykosylace hrají klíčovou roli v biologických procesech, ovlivňují stabilitu, skládání a buněčné interakce proteinů. Analytická identifikace isomerů oligosacharidů je náročná kvůli variabilitě vazeb a anomerie.

Cíle a přehled studie


Cílem studie bylo rozlišení dvou isomerů mléčných lakto-oligosacharidů – Lacto-N-tetraosu (LNT) a Lacto-N-neotetraosu (LNnT) – pomocí elektronové transferové disociace (ETD) kombinované s iontovým mobilitním hmotnostním spektrometrem (IM-MS).

Použitá metodika a instrumentace


Vzorky LNT a LNnT byly permethylovány, což zvýšilo stabilitu a informační hodnotu fragmentů. Kationizace proběhla pomocí Mg2+. Analýza byla provedena na systému Synapt G2 HDMS s T-Wave iontovou mobilitou a ETD zdrojem.
  • ESI v pozitivním módu pro MS
  • Glow discharge v negativním módu pro ETD
  • T-Wave iontová mobilita v dusíku (3,5 mbar)

Hlavní výsledky a diskuse


ETD fragmentace vedla převážně ke cross-ring štěpení, na rozdíl od CID, která vyvolává hlavně glykozidické štěpení. Klíčovým rozdílem byla intenzita interního iontu E2 (m/z 228), výrazně odlišná mezi LNT a LNnT. Iontová mobilita umožnila separaci překrývajících se iontů Y2 (m/z 463,2) a B2(H) (m/z 464,3), což zjednodušilo interpretaci spekter a odhalilo rozdíly v kompaktnosti struktur.

Přínosy a praktické využití metody


ETD-IM-MS nabízí spolehlivé rozlišení izomerů oligosacharidů a zvyšuje informační hodnotu fragmentačních dat. Metoda je vhodná pro charakterizaci glykoproteinů v biotechnologii a kvalitativní i kvantitativní analýzu v průmyslových a klinických laboratořích.

Budoucí trendy a možnosti využití


Perspektivní je rozšíření na širší škálu glykánů a komplexních N-/O-vázaných oligosacharidů, integrace s chromatografickými metodami a vývoj pokročilého softwaru pro automatizovanou analýzu iontové mobility. Využití ve výzkumu glykobiologie a glykoproteomiky má potenciál odhalit nové biomarkery.

Závěr


ETD v kombinaci s iontovou mobilitou významně zjednodušuje rozlišení isomerních permethylovaných oligosacharidů a poskytuje detailnější fragmentační informace. Tato metodika představuje slibný nástroj pro analytickou chemii glykosacharidů.

Reference


1. Domon B, Costello CE. A systematic nomenclature for carbohydrate fragmentations in FAB-MS/MS spectra of glycoconjugates. Glycoconjugate J. 1988;5:397–409.
2. Han L, Costello CE. Electron transfer dissociation of milk oligosaccharides. J Am Soc Mass Spectrom. 2011;22(6):997–1013.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Structural analysis of isomeric chemicals by using high resolution MS/MS on Curved Field Reectron incorporated with a novel focusing technology
ADD A NEW DIMENSION TO YOUR RESEARCH WITH THE AGILENT 6560 ION MOBILITY Q-TOF LC/MS
Elucidating the Complexities of the Human Milk Glycomewith Ion Chromatography-Mass Spectrometry (IC-MS)
Advantages of Ion Mobility QTOF for Characterization of BioPharma Molecules