LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníLipidomika
VýrobceShimadzu
Význam tématu
Fosfolipidy jsou klíčovými stavebními složkami buněčných membrán, hrají roli v transportu lipidů, skladišťují energii a slouží jako prekurzory mediátorů. Změny v poměru fosfolipidů v krvi a tkáních korelují s různými onemocněními, proto je jejich přesná kvantifikace nezbytná pro porozumění biologickým funkcím a detekci biomarkerů.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo navrhnout schéma identifikace a kvantifikace fosfolipidů založené na dvojím skenování hmotnostního spektra (precursor ion scan a neutral loss scan) na trojitém kvadrupólu nízkého rozlišení a následném databázovém vyhledávání v programu SimLipid. Modelovou aplikací bylo sledování změn fosfolipidového profilu jater myší po podání fluorescenční sondy na bázi uhlíkových nanotrubiček.
Použitá metodika
- Příprava vzorků: tkáň jater byla izolována 5 hodin po intravenózním podání CNT sondy (300 mg/mL), rychle zmrazena, rozdrcena a extrahována metodou Bligh & Dyer.
- Analýza MS/MS: provedeny precursor ion scan na m/z 184 pro fosfatidylcholin (PC) a sfingomyelin (SM) a neutral loss scan m/z 141 pro fosfatidylethanolaminu (PE).
- Databázové vyhledávání: výsledné spektrální soubory byly importovány do SimLipid, kde se při toleranci 0,2 Da přiřazovaly k více než 5000 možným fosfolipidovým druhům.
Použitá instrumentace
- UHPLC: kolona Phenomenex Kinetex C8 (150×2,1 mm, 2,6 µm), mobilní fáze A 20 mM formiátu amonného ve vodě, B acetonitril/2-propanol (1:1), gradient 20–100 % B během 35 minut, teplota 45 °C, průtok 0,3 mL/min.
- MS: Shimadzu LCMS-8060, ESI(+/-), rozptylový plyn 3 L/min, sušící plyn 10 L/min, interface 300 °C, block heater 400 °C, napětí 4 kV/-3 kV.
Hlavní výsledky a diskuse
- Metoda spolehlivě detekovala desítky druhů PC, SM a PE ve vzorcích jater.
- Po aplikaci CNT sondy došlo k nárůstu koncentrací dlouhořetězcových a polyenových fosfolipidů (např. PC(38:6), PC(40:6), PE(38:6), PE(40:6)) a k výrazným změnám v několika druzích sfingomyelinů (SM(38:1), SM(40:3), SM(42:3)).
- Naopak klesly hladiny kratších a méně nenasycených fosfolipidů, například PC(34:1) a PE(34:1).
- Výsledky potvrzují schopnost sledovat dynamiku lipidového složení při biologických zásazích.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a vysoce specifická identifikace více než stovek fosfolipidových druhů.
- Široké možné využití v biomarkerovém výzkumu, farmakokinetice a toxikologii.
- Jednoduchá integrace do rutinních QC/QA protokolů v průmyslové analytice.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Prohloubení analýzy kombinací s vysoko rozlišovacím MS a MRM metodami pro určení složení mastných kyselin.
- Rozšíření databází fosfolipidů a automatizace zpracování dat pomocí AI nástrojů.
- Využití pro studium lipidomické variability ve zdravotním a farmaceutickém výzkumu.
Závěr
Schéma založené na LC-TQ-MS ve spojení s databázovým vyhledáváním v SimLipid umožňuje efektivní a kvantitativní profilování fosfolipidů. Aplikace na jaterní model potkanů prokázala schopnost detekovat metabolické změny v reakci na biologický zásah.
Reference
- Tsuyoshi Nakanishi, Masaki Yamada, Ningombam Sanjib Meitei. Phospholipid characterization by a TQ-MS data based identification scheme. ASMS 2017.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.