Společnost Thermo Fisher Scientific Inc. představila hmotnostní spektrometr Thermo Scientific™ Orbitrap™ Astral™, který představuje jeden z nejvýznamnějších pokroků v oblasti hmotnostní spektrometrie za posledních 15 let.
Nový analyzátor Astral kombinuje rychlou prostupnost, vysokou citlivost a hloubkový profil proteomu, což umožňuje vědcům po celém světě odhalovat proteiny, které dříve mohly unikat detekčním mechanismům, a provádět průlomové objevy efektivněji než kdykoli předtím. Vědci mohou tyto informace využít k identifikaci nových klinických biomarkerů, včasnějšímu odhalení nemocí a vývoji nových postupů v léčbě od kardiovaskulárních chorob až po rakovinu.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Novy_hmotnostni_spektrometr_Thermo_Scientific_Orbitrap_Astral_8c08bd6204/Pragolab-Novy-hmotnostni-spektrometr-Thermo-Scientific-Orbitrap-Astral.jpg" alt="Pragolab - Nový hmotnostní spektrometr Thermo Scientific Orbitrap Astral.jpg"/>
Nový <a href="https://lcms.cz/products/836">Orbitrap Astral</a> snoubí osvědčenou platformu orbitálních pastí s novou technologií, která poskytuje až dvakrát hlubší pokrytí proteomu a až čtyřikrát vyšší prostupnost ve srovnání se současnými hmotnostními spektrometry.
&quot;Jedním z největších problémů, kterým čelíme při studiu lidského proteomu, je příliš mnoho vzorků k měření a nedostatek času,&quot; řekl Michael MacCoss, profesor na Washingtonské univerzitě. &quot;Hmotnostní spektrometr Orbitrap Astral skutečně mění pravidla hry, protože nabízí bezkonkurenční kombinaci citlivosti, dynamického rozsahu a rychlosti.&quot;
<h5>Hmotnostní spektrometr Orbitrap Astral kombinuje tři hmotnostní analyzátory:</h5>
<ul>
<li>kvadrupólový hmotnostní analyzátor pro vysokou selektivitu a vysoký přenos iontů</li>
<li>hmotnostní analyzátor Orbitrap pro měření s vysokým dynamickým rozsahem a vysokým rozlišením</li>
<li>nový analyzátor Astral pro rychlá a citlivá měření.</li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Technicke_schema_hmotnostniho_spektrometru_Thermo_Scientific_Orbitrap_Astral_feeadbd7eb/Pragolab-Technicke-schema-hmotnostniho-spektrometru-Thermo-Scientific-Orbitrap-Astral.jpg" alt="Pragolab: Technické schéma hmotnostního spektrometru Thermo Scientific Orbitrap Astral"/>
Kombinací těchto tří hmotnostních analyzátorů a souběžnou koordinací pěti samostatných iontových paketů v rámci přístroje je dosaženo nového standardu pro výkonnost hmotnostní spektrometrie, který pomůže posunout hranici poznatků v přírodních vědách.
<blockquote>
Pro více informací nás neváhejte kontaktovat na eliasova@pragolab.cz, +420 771 137 630
</blockquote>
<h3>Přehled literatury pro <a href="https://lcms.cz/library?from=2023&amp;mainauthorItems=3&amp;search=Astral&amp;to=2023">Thermo Scientific Orbitrap Astral v knihovně LabRulez</a></h3>
<ul>
<li>Orbitrap Astral mass spectrometer - Brochure (Brožury a specifikace | 2023)
</li>
<li>Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) metabolomics: an intelligent combination of targeted and untargeted workflows using the novel Orbitrap Astral mass spectrometer (Postery | 2023)
</li>
<li>Orbitrap Astral mass spectrometer - Product specifications (Brožury a specifikace | 2023)
</li>
<li>Orbitrap Astral mass spectrometer (Brožury a specifikace | 2023)
</li>
<li>ASMS: A Benchmarking Workflow for High-Throughput DIA Label-Free Quantification using a Novel High-Resolution Accurate Mass Platform (Postery | 2023)
</li>
<li>Deeper proteome coverage and faster throughput for low input samples on the Thermo Scientific Orbitrap Astral mass spectrometer (Aplikace | 2023)
</li>
<li>ASMS: Single-Shot LC-MS Workflow for Comprehensive Proteome Identification on an Orbitrap Astral Mass Spectrometer (Postery | 2023)
</li>
<li>New standards for plasma proteomics—Balancing throughput for large sample cohorts and depth of analysis for biomarker discovery (Aplikace | 2023)
</li>
<li>ASMS: An In-depth Plasma Proteomics Workflow Powered by Orbitrap Astral Mass Spectrometer (Postery | 2023)
</li>
<li>Exploring your proteomics universe with the Thermo Fisher Scientific proteomics solution (Příručky | 2023)
</li>
</ul>

Orbitrap Astral – nová technologie, která Vás nutí přehodnotit, co vše je možné

Letošní Škola hmotnostní spektrometrie je po 5ti intenzivních dnech za námi. Poslední dopoledne obsahovalo 7 odborných přednášek ve 2 sekcích, závěrečné předávání ceny za nejlepší plakátová sdělení a oficiální zakončení.
V pořadí 13. odborná sekce byla zaměřena na zpracování dat a validace metod se zaměřením na metabolomiku nebo hmotnostně-spektrometrické metody. Následovala přednáška o selektivitě Phenylových kolon a nových možností orbitálních pastí.
Závěrečná sekce již patřila aplikacím. Jak používat &quot;Acustic droplet ejection&quot; ve spojení s ESI-MS, jak vyžívat UHPLC-HRMS ve farmaceutické QC a jakou roli hraje MS v toxikologických aplikacích jsme se dozvěděli v posledních 3 přednáškách.
A nastal tak konec 24. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie, kterého se účastnilo 272 odborníků s průměrným věkem 38 let. Z toho bylo 101 účastníků z univerzitního prostředí, 53 z prostředí akademického a 61 z komerční podnikové sféry.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/SSJMM_Predani_oceneni_za_nejlepsi_plakatove_sdeleni_24_Skoly_MS_Sponzorem_souteze_je_spolecnost_Pragolab_389eea5f1f/SSJMM-Predani-oceneni-za-nejlepsi-plakatove-sdeleni-24.-Skoly-MS-(Sponzorem-souteze-je-spolecnost-Pragolab).jpg" alt="SSJMM: Předání ocenění za nejlepší plakátové sdělení 24. Školy MS (Sponzorem soutěže je společnost Pragolab)"/>
<h5>Viděli jsme:</h5>
<ul>
<li>12 klasických přednáškových sekcí a 37 odborných přednášek</li>
<li>slavnostní sekci předání Ceny V. Hanuše a přednášku jejího laureáta</li>
<li>sekci mladých - <a href="https://gcms.cz/article/3159">Mládí vpřed</a>, 6 přednášek</li>
<li>9 firemních přednášek - <a href="https://lcms.cz/library?from=2023&amp;mainauthorItems=264&amp;publicationTypeItems=7&amp;sources=LCMS-GCMS&amp;to=2023">ke stažení v knihovně</a></li>
<li>sekci plakátových sdělní, <a href="https://lcms.cz/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/abstrakty_sbornik_final_2023_3640c3638d/abstrakty_sbornik_final_2023.pdf">40 posterů</a> + prezentaci <a href="https://lcms.cz/articles?search=%C5%A0kola+hmotnostn%C3%AD+spektrometrie+v+zrcadle+%C4%8Dasu">historie Školy MS</a></li>
</ul>
<h3>PÁTEK</h3>
<h4>SEKCE XIII. STATISTICKÉ ZPRACOVÁNÍ DAT A VALIDACE METOD</h4>
<ul>
<li>Předsedající: Vladimír Vrkoslav</li>
</ul>
<h5>8:30 - 9:15 Statistické zpracování dat v metabolomických studiích</h5>
<ul>
<li>Eva Cífková</li>
</ul>
<h5>9:15 - 10:00 <a href="https://lcms.cz/library?instrumentationItems=31&amp;search=validation">Validace hmotnostně-spektrometrických metod</a></h5>
<ul>
<li>David Friedecký</li>
</ul>
<h5>10:00 - 10:15 Phenylová selektivita</h5>
<ul>
<li>Jan Vlasák - Phenomenex</li>
<li><a href="https://lcms.cz/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_MS_Phenylova_selektivita_Jan_Vlasak_cb3686a2fc/Skola-MS-Phenylova-selektivita-(Jan-Vlasak).pdf">pdf přednáška ke stažení</a></li>
</ul>
<h5>10:15 - 10:30 Nové možnosti <a href="https://lcms.cz/library?instrumentationItems=31-30-33">orbitálních pastí</a></h5>
<ul>
<li>Lukáš Plaček - <a href="https://lcms.cz/companies/42">Pragolab</a></li>
<li><a href="https://lcms.cz/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Skola_MS_Nove_moznosti_orbitalnich_pasti_Lukas_Placek_9af8e7cddc/Skola-MS-Nove-moznosti-orbitalnich-pasti-(Lukas-Placek).pdf">pdf přednáška ke stažení</a></li>
</ul>
Společnost Thermo Fisher Scientific uvedla letos na trh nový hmotnostní spektrometr <a href="https://lcms.cz/library?instrumentationItems=33&amp;mainauthorItems=3&amp;search=Astral">Orbitrap Astral</a> jako jeden z nejvýznamnějších pokroků v oblasti hmotnostní spektrometrie za poslední desetiletí. Díky značné poptávce v proteomických, metabolomických a lipidomických kruzích po instrumentu, který by s maximální rychlostí a velmi vysokým rozlišením identifikoval látky s extrémně odlišným koncentračním zastoupením (&gt; 12 řádů), se poprvé zrodil nástroj s více vysoce rozlišujícími hmotnostními analyzátory fungujícími synchronně a paralelně.
Hmotnostní spektrometr Orbitrap Astral kombinuje tři hmotnostní analyzátory: kvadrupólový hmotnostní analyzátor pro vysokou selektivitu a vysoký přenos iontů, hmotnostní analyzátor Orbitrap pro měření s vysokým dynamickým rozsahem a vysokým rozlišením a nový analyzátor Astral pro rychlá a citlivá měření. Kombinací těchto tří hmotnostních analyzátorů a souběžnou koordinací pěti samostatných iontových paketů v rámci přístroje je dosaženo nového standardu pro výkonnost hmotnostní spektrometrie, který pomůže posunout hranici poznatků v přírodních vědách.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/SSJMM_Nove_moznosti_orbitalnich_pasti_Lukas_Placek_03d75b3fde/SSJMM-Nove-moznosti-orbitalnich-pasti-(Lukas-Placek).jpg" alt="SSJMM: Nové možnosti orbitálních pastí (Lukáš Plaček)"/>
<h5>10:30 - 11:00 PŘESTÁVKA NA KÁVU</h5>
<h4>SEKCE XIV. APLIKACE</h4>
<ul>
<li>Předsedající: David Friedecký</li>
</ul>
<h5>11:00 - 11:30 &quot;Acustic droplet ejection&quot; ve spojeni s ESI-MS</h5>
<ul>
<li>Anna Janovská</li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/SSJMM_Acustic_droplet_ejection_ve_spojeni_s_ESI_MS_Anna_Janovska_8ef95ad265/SSJMM-Acustic-droplet-ejection-ve-spojeni-s-ESI-MS-(Anna-Janovska).jpg" alt="SSJMM: Acustic droplet ejection ve spojeni s ESI-MS (Anna Janovská)"/>
<h5>11:30 - 12:00 Potřebujeme <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=5&amp;instrumentationItems=31-30&amp;search=quality">UHPLC-HRMS ve farmaceutické kontrole kvality?</a></h5>
<ul>
<li>Lucie Nováková</li>
</ul>
<h5>12:00 - 12:30 <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=3&amp;instrumentationItems=31">MS v toxikologii</a></h5>
<ul>
<li><a href="https://lcms.cz/articles?search=Martin+Kucha%C5%99">Martin Kuchař</a></li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/SSJMM_MS_v_toxikologii_Martin_Kuchar_81ee51ad2b/SSJMM-MS-v-toxikologii-(Martin-Kuchar).jpg" alt="SSJMM: MS v toxikologii (Martin Kuchař)"/>
<h5>12:30 - 12:50 Zakončení 24. Školy MS</h5>
<ul>
<li>Josef Cvačka</li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/SSJMM_Zakonceni_24_Skoly_MS_Josef_Cvacka_c90078e41d/SSJMM-Zakonceni-24.-Skoly-MS-(Josef-Cvacka).jpg" alt="SSJMM: Zakončení 24. Školy MS (Josef Cvačka)"/>
<h5>12:50 - 14:00 OBĚD</h5>
<h3>Nejlepší přednáška v sekci Mládí vpřed 24. ročníku Školy MS</h3>
<h4>Přímá analýza pylových zrn s využitím modifikované ASAP-MS techniky</h4>
<ul>
<li>PETRA KREJČÍ</li>
</ul>
Mikroskopická analýza je běžně využívaným nástrojem pro identifikaci pylových zrn, kde jsou jednotlivé druhy pylových zrn identifikovány na základě jejich morfologie bez znalosti chemického složení pylového zrna. Za účelem studia chemického složení pylových zrn je nejčastěji využíváno spojení plynové chromatografie s hmotnostní spektrometrií (GC/MS).
Doposud však nebyla realizována studie, která by se zabývala analýzou taxonomicky odlišných druhů pylových zrn se zaměřením na jejich chemickou odlišnost. Navíc využívané GC/MS přístupy vyžadují extrakci analytů z pylových zrn do kapalné fáze, což může vést k diskriminaci některých analytů na základě použitých extrakčních rozpouštědel.
Tento příspěvek se zabývá studiem chemického složení vybraných druhů pylových zrn zvolených na základě taxonomické odlišnosti/příbuznosti, zbarvení a vzhledu povrchu. Pro účely rychlé a přímé analýzy pylových zrn byla modifikována kapilára pro hmotnostní spektrometrii s přímou sondou (analýzu pevných vzorků za atmosférického tlaku, ASAP-MS). S využitím elektronicky řízeného mikromanipulátoru byly vyizolovány klastry o definovaném počtu pylových zrn, které byly následně umístěny do modifikované kapiláry a přímo analyzovány technikou ASAP-MS. ASAP-MS analýza poskytla informace o chemickém složení studovaných druhů pylových zrn a s využitím PCA analýzy experimentálně získaných dat bylo dosaženo dělení jednotlivých druhů na základě jejich chemické odlišnosti. Byly identifikovány biomarkery, které byly pro daný druh buď specifické nebo byly ve spektrech pozorovány se značně vyšší intenzitou oproti ostatním druhům. Na základě PCA plotu se nejvíce odlišoval borovicový pyl, jediný zástupce jehličnanů a nahosemenných rostlin. Jeho výrazná odlišnost je způsobena malou chemickou variabilitou, která souvisí jak se způsobem šíření pylu, tak i s evoluční zastaralostí a vývojovou izolací studovaného druhu. Ostatní studované druhy, zástupci krytosemenných rostlin, byly děleny na základě chemických odlišností souvisejících s jejich taxonomickou klasifikací, přičemž značnou chemickou odlišnost vykazoval slunečnicový pyl, který je bohatý na charakteristické látky lipidické povahy. Modifikovaná ASAP-MS technika se ukázala jako vhodný nástroj ke studiu chemické variability a charakterizace různých druhů pylu.
Současně byly s využitím mikromanipulátoru izolovány definované počty pylových zrn slunečnice (1 - 10 pylových zrn), které byly vždy vloženy do modifikované kapiláry a následně přímo analyzovány technikou ASAP-MS. Přičemž pozornost byla zaměřena na přítomnost signálu odpovídající helianyl oktanoátu jakožto specifické složky pylového zrna slunečnice. Signál zmíněné látky byl pozorován ve všech spektrech s klesající intenzitou v závislosti na snižujícím se počtu analyzovaných pylových zrn, avšak vždy dostatečně odlišený od pozadí ve spektru. Dosažené výsledky potvrdily využitelnost zavedeného postupu k analýze jednoho pylového zrna umožňující jeho identifikaci a klasifikaci.
Modifikovanou ASAP-MS techniku je možno využít k rychlé a přímé mikroanalýze rozmanitých pevných materiálů rostlinného původu bez předchozí úpravy studovaného vzorku a současně nabízí další možnosti pro analýzu struktur na úrovni jedné buňky nebo buněčné struktury.
<h3>Nejlepší plakátová sdělení 24. ročníku Školy MS</h3>
<h4>1. Mass spectrometry methods and instrumentation for the space dust generation</h4>
<ul>
<li>ANATOLII SPESYVYVI</li>
</ul>
Nanometer to micrometer size ice particles as constitute of cosmic dust can originate from comets, plumes on icy satellites, hypervelocity meteoroid impacts on different icy surfaces. Mass spectrometric measurements of the molecular composition of such ice grains from Enceladus with the Cosmic Dust Analyzer on the Cassini spacecraft revealed the presence of organic molecules with masses over 200 amu. For future missions thus it is essential to have laboratory source of hypervelocity ice particles, which facilitates testing of new generation of the space high resolution mass spectrometric detectors. This requirement can be divided into two conceptual parts: the ice particle generation and the ice particle acceleration. We have developed instrument SELINA (Selected Ice Nanoparticle Accelerator) which resolves the ice particle generation part of the task. On the basis of our mass spectrometry experience we have applied and combined existing techniques to produce well defined beam of size selected icy nanoparticles on the output of the apparatus.
The highly charged water droplets are generated via electrospray ionization source with subsequent transfer from atmosphere pressure into the vacuum accompanied by the evaporative cooling and transition of water droplets from liquid phase to ice. The combination of two frequency controlled quadrupoles with differential pumping allows to produce charged particle beams of specified narrow size distributions within a range of 50-1000 nm diameter with 0.1-1 Hz repetition rates. The individual particle charge and velocity is measured by the non-destructive single pass charge detector. Special efforts were made to design SELINA as a compact transportable apparatus. As a result, all parts of instrument can be fitted on the two 19’’ cart (except for mechanical pumps) including control electronics. This allows to combine SELINA particle source with different stationary accelerators.
<h4>Komplexní metabolomická studie vzorků močí a sér pacientů trpících deficitem ATP syntasy</h4>
<ul>
<li>DANA DOBEŠOVÁ</li>
</ul>
Dědičné metabolické poruchy (DMP) tvoří velkou skupinu závažných onemocnění způsobených defekty enzymů nebo jiných proteinů. Řadí se k nim například také poruchy oxidativní fosforylace v mitochondriích. TMEM je velmi vzácné autosomálně recesivní onemocnění projevující se poruchou ATP syntasy, pátého komplexu dýchacího řetězce zodpovědného za tvorbu ATP. Příčinou tohoto onemocnění je mutace v genu TMEM70, který se podílí na stavbě struktury tohoto enzymu. Předmětem zájmu této studie bylo popsat patobiochemické procesy u pacientů trpících touto poruchou.
Pro komplexní popis změn v metabolickém profilu TMEM pacientů bylo použito 21 vzorků sér a 25 močí, které byly porovnávány s profily 38 sér a 37 močí získaných od zdravých jedinců. U pacientů se v několika případech jednalo o opakované odběry. Vzorky sér byly podrobeny cílenému metabolomickému přístupu. Pro analýzu močí byla zvolena kombinace metabolomiky a metody organických kyselin. Oba typy přístupů byly provedeny pomocí ultraúčinné kapalinové chromatografie spojené s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Získaná data byla následně podrobena processingu a statistickému zpracování, zahrnující jednorozměrné a vícerozměrné (ne)supervizované metody.
Cílená metabolomická analýza detekovala v sérových vzorcích 124 metabolitů. Analýza močových vzorků odhalila 214 metabolitů. Jednalo se o aminokyseliny a jejich deriváty, aminy, acylkarnitiny, acylglyciny, peptidy, koenzymy, organické kyseliny, puriny a pyrimidiny a sacharidy. U obou materiálů byly zjištěny významné rozdíly v metabolickém profilu pacientů v porovnání se zdravými kontrolami, především v hladinách organických kyselin a aminokyselin. Sérový a močový profil TMEM pacientů byl výrazně ovlivněn zvýšenými hladinami meziproduktů metabolismu pyruvátu a citrátového cyklu. To mohlo souviset přímo s deficitem ATP syntasy, která je závislá v rámci dýchacího řetězce na dodávce elektronů ze zmíněného cyklu. Buňka je následně nucena k podpoře anaerobního dýchání, a tedy k aktivaci glykolýzy a zvýšené produkci pyruvátu a laktátu. Po objasnění všech významných změn mohou výsledky naší studie přispět k pochopení patobiochemie související s tímto onemocněním a zlepšit tak i diagnostické přístupy.
<h4>Reversed-phase UHPLC/MS Approach for the Analysis of Lipids in Human Plasma from Pancreatic Cancer Patients and Long Survivors</h4>
<ul>
<li>ZUZANA VAŇKOVÁ</li>
</ul>
Lipids are diverse endogenous biomolecules that play an important role in human metabolism. Their dysregulation is related to many serious diseases, e.g., various types of cancer. Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the most common causes of cancer-related deaths worldwide, with an average 5-year survival rate of less than 10%. Comprehensive lipid profiling currently appears to be a possible way of early detection of this type of cancer. Mass spectrometry is the primary technique for lipidomic analysis, and the connection to separation methods enables the identification and quantification of a large number of lipids from various lipid categories.
The main objective of this study was to apply our robust and high-throughput quantitative reversed-phase ultrahigh-performance liquid chromatography (RP-UHPLC) method to the lipidomic profiling of PDAC patients . The main advantage of separation in RP mode is the possibility of distinguishing isobaric molecules due to the predictable retention behavior of logical lipid series. This approach allows the quantitation of more lipid species than in case of other lipid class separation methods. The UHPLC is coupled to a low-resolution mass spectrometer, where the characteristic transitions of each lipid species were measured by multiple reaction monitoring (MRM) scanning.
This fully validated method enables the quantitation of more than 450 lipid species in PDAC samples, healthy volunteers, and long-term survivors of PDAC (more than 5-year survival without recurrence). The unsupervised PCA without sample classification and supervised OPLS-DA with known sample classification were performed to visualize dysregulated lipids in PDAC samples. The most downregulated lipid classes include sphingolipids with very long fatty acyl chains (e.g., SM 41:1;O2 and Cer 41:1;O2), which is in agreement with previously published data. These results provide clear evidence that long-term survivors retain characteristics of the cancer group, which indicates that the changes in sphingolipid metabolism are permanent even after recovery from PDAC.

24. Škola MS 2023 - den 5

Když letos uvedla společnost Thermo Fisher Scientific nový <a href="https://lcms.cz/products/836">hmotnostní spektrometr Orbitrap Astral</a>, všem bylo jasné, že jde o jeden z nejvýznamnějších pokroků v oblasti hmotnostní spektrometrie za poslední desetiletí. Díky značné poptávce v proteomických, metabolomických a lipidomických (nazývané jako „omics“ či „omiky“) kruzích po instrumentu, který by s maximální rychlostí a velmi vysokým rozlišením identifikoval látky s extrémně odlišným koncentračním zastoupením (&gt; 12 řádů), se poprvé zrodil nástroj s více vysoce rozlišujícími hmotnostními analyzátory fungujícími synchronně a paralelně.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_1_Spolecnost_Thermo_Fisher_Scientific_se_dlouhodobe_profiluje_jako_korporace_rozvijejici_komplexni_diagnostiku_nemoci_d5db2a27e3/Pragolab-Obr.-1-Spolecnost-Thermo-Fisher-Scientific-se-dlouhodobe-profiluje-jako-korporace-rozvijejici-komplexni-diagnostiku-nemoci.jpg" alt="Pragolab: Obr. 1 - Společnost Thermo Fisher Scientific se dlouhodobě profiluje jako korporace rozvíjející komplexní diagnostiku nemocí a výzkum, výrobu a analýzu léčiv, zvláště biofarmak. "/>
Thermo Fisher Scientific se dlouhodobě profiluje jako korporace rozvíjející komplexní diagnostiku nemocí a výzkum, výrobu a analýzu léčiv, zvláště biofarmak, čemuž napomáhá významná divize analytické instrumentace. Potřeby rozvoje této oblasti se odráží ve směrech pokroku analyzátorů, kde bezpochyby hraje prim hmotnostní spektrometrie s nepřekonatelnou orbitální pastí. Jednoznačně největší výzvou posledních let se staly potřeby proteomiky, metabolomiky a lipidomiky (na rozdíl od genetiky odráží aktuální stav živého organismu), tedy mohutně se rozvíjejících oblastí studia (analyticky řečeno) komplexních vzorků s extrémním počtem analytů ohromného koncentračního rozsahu. Nic složitějšího nelze vyžadovat, na druhou stranu vedle hmotnostní spektrometrie se žádná jiná technika neetablovala na úroveň, jež by takovou „směs“ charakterizovala stejně či lépe. Informace o počínající nemoci může být skryta jako jehlička v kupce sena v neznámém analytu na relativně nízké koncentrační úrovni koeluující z chromatografického systému spolu s dalšími stovkami látek. Jak nastavit systém, vyvinout metodu a aplikovat ji, aby nám neunikla?
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_2_Hlavni_oblasti_rozvoje_hmotnostni_spektrometrie_urcujici_smer_pokroku_instrumentace_1afebf5bf3/Pragolab-Obr.-2-Hlavni-oblasti-rozvoje-hmotnostni-spektrometrie-urcujici-smer-pokroku-instrumentace..jpg" alt="Pragolab: Obr. 2 - Hlavní oblasti rozvoje hmotnostní spektrometrie určující směr pokroku instrumentace"/>
Charakterizace organických látek se již dávno posunula od tradiční trojkombinace spektrometrií hmotnostní, nukleární magnetické rezonance a infračervené; díky složitosti směsí a tudíž nutnosti předřazení separační techniky se hmotnostní spektrometrie stala jedinou identifikační spektrometrií v omics problematice. Ani logický odklon od jednotkového rozlišení směrem k rozlišení vysokému (z čehož lze odvodit elementární složení analytu) ke strukturní analýze nestačí, musí být doplněno fragmentačním spektrem (MS/MS) identifikované molekuly, nejlépe pak též vysoce rozlišeným. V každém sekundovém chromatografickém okně nechť je změřeno jedno ultra-vysoce rozlišené spektrum (full scan, rozlišení &gt; 200 000 FWHM) a u maxima detekovaných iontů pak MS/MS spektrum s rozlišením &gt; 80 000 FWHM.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_3_Informace_o_pocinajici_nemoci_muze_byt_skryta_jako_jehlicka_v_kupce_sena_v_neznamem_analytu_na_relativne_nizke_6d2d101beb/Pragolab-Obr.-3-Informace-o-pocinajici-nemoci-muze-byt-skryta-jako-jehlicka-v-kupce-sena-v-neznamem-analytu-na-relativne-nizke.jpg" alt="Pragolab: Obr. 3 - Informace o počínající nemoci může být skryta jako jehlička v kupce sena v neznámém analytu na relativně nízké koncentrační úrovni koeluující z chromatografického systému spolu s dalšími stovkami látek."/>
S podobným korporátním zadáním se zřejmě potýkal vynálezce orbitálních pastí Alexander Makarov se svým týmem a čelil tak výzvě, která měla posunout hranice hmotnostní spektrometrie. Z arzenálu dostupných a ve vývojových buňkách Thermo Fisher Scientific vylepšovaných hmotnostních analyzátorů (kvadrupól, lineární iontová past, orbitální iontová past a multireflexní time of flight, ozn. mrTOF) zvolil dvě možné paralelizace, a to:
1. uspořádání kvadrupólu spolu se dvěma či více orbitálními iontovými pastmi 2. uspořádání kvadrupólu s orbitální iontovou pastí a multireflexním time of flight analyzátorem
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_4_Pozadavek_akvizice_jednoho_ultra_vysoce_rozliseneho_spektra_a_u_maxima_detekovanych_iontu_zmereni_MS_MS_spektra_2614e49219/Pragolab-Obr.-4-Pozadavek-akvizice-jednoho-ultra-vysoce-rozliseneho-spektra-a-u-maxima-detekovanych-iontu-zmereni-MS-MS-spektra.jpg" alt="Pragolab: Obr. 4 - Požadavku akvizice jednoho ultra-vysoce rozlišeného spektra (full scan, rozlišení &gt; 200 000 FWHM) a u maxima detekovaných iontů změření MS/MS spektra s rozlišením &gt; 80 000 FWHM v každém sekundovém chromatografickém okně může vyhovět jen uspořádání C a D. (A – lineární uspořádání kvadrupólu Q a orbitrapu OT, kdy je HRMS a MS/HRMS měřeno v sérii; B – paralelní uspořádání kvadrupól Q – orbitrap OT a lineární iontové pasti LIT charakteristické pro tribridy; C a D – paralelní uspořádání kvadrupólu Q, orbitrapu OT a dalšího orbitrapu OT či time of flight analyzátoru TOF patentováno A. Makarovem)."/>
Obě varianty obsahují dva a více nezávislé vysoce rozlišující prvky, což pravděpodobně odstartovalo novou éru hmotnostní spektrometrie z pohledu instrumentace. Makarov pracoval (a pracuje) na obou verzích, nicméně komerční podobu (letos) vtiskl do varianty s multireflexním time of flight analyzátorem. S nešvarem standardních průletových analyzátorů se vypořádal brilantně: aby nedocházelo k iontovým aberacím - odchylkám v dráze iontů způsobujících ztrátu citlivosti - upravil paralelní iontová zrcadla na konvergující (ionty jsou nuceny na konci dráhy obrátit svůj směr; pozn.: lze využít pro nový typ elektrostatické pasti, viz obr. 7), které opatřil kompenzačními elektrodami usměrňujícími odchylky v ose z (kolmá na rovinu dráhy iontů) a implementoval nízkoztrátové iontové pasti pro akumulaci a koncentraci iontů před injektáží do mrTOF. Světlo světa tak spatřila unikátní hybridní instrumentace se dvěma vysoce rozlišujícími analyzátory – orbitální pastí dosahující rozlišení až 480 000 FWHM a bezztrátovým multireflexním průletovým analyzátorem s rozlišením 80 000 FWHM (pro MS/HRMS spektra) a frekvencí sběru dat 200 spekter za sekundu. Zatímco jeden balík iontů podléhá detekci v orbitální iontové pasti, paralelně s tím další balík iontů sekvenčně podléhá fragmentaci, další akumulaci, další čeká na injektáž do mrTOF a konečně poslední prolétá mimořádným multiodrazovým aparátem.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_5_Standardni_mr_TOF_nevyhovujici_puvodnimu_zadani_vlevo_musel_byt_upraven_tak_aby_nedochazelo_k_iontovym_aberacim_odchylkam_v_draze_iontu_zpusobujicich_ztratu_citlivosti_f4d4f4dc87/Pragolab-Obr.-5-Standardni-mrTOF-nevyhovujici-puvodnimu-zadani-(vlevo)-musel-byt-upraven-tak-aby-nedochazelo-k-iontovym-aberacim-odchylkam-v-draze-iontu-zpusobujicich-ztratu-citlivosti.jpg" alt="Pragolab: Obr. 5 - Standardní mrTOF nevyhovující původnímu zadání (vlevo) musel být upraven tak, aby nedocházelo k iontovým aberacím - odchylkám v dráze iontů způsobujících ztrátu citlivosti - 1) úpravou paralelních iontových zrcadel na konvergující (vpravo nahoře), které jsou opatřeny kompenzačními elektrodami usměrňujícími odchylky v ose z (kolmá na rovinu dráhy iontů) a 2) implementací nízkoztrátových iontových pastí pro akumulaci, koncentraci iontů před injektáží do mrTOF (vpravo dole) dle patentu US 9136101 B2. 15.9.2015 a US 10964520 B2. 30.3.2021."/>
Unikátní technologie použitá v novém hmotnostním spektrometru oslňuje dechberoucí výkonností; pomocí Orbitrap Astral lze ve stejném vzorku za stejný čas identifikovat o 50 % více proteinových skupin oproti současně nejlepšímu dostupnému instrumentu. První výsledky z laboratoří navíc ukazují, že se díky „hvězdnému“ nástroji budou zcela jistě posouvat i hranice ve výzkumu závažných onemocnění a možnostech jejich léčby. Díky všem, kteří se o to snažili a snaží, a nechť je nadále povzbuzuje latinské rčení per aspera ad ASTRA (přes překážky ke vznešeným cílům).
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_6_Znazorneni_trajektorie_iontu_mezi_zrcadly_jejichz_odchylky_jsou_korigovany_kompenzacnimi_elektrodami_385b984138/Pragolab-Obr.-6-Znazorneni-trajektorie-iontu-mezi-zrcadly-jejichz-odchylky-jsou-korigovany-kompenzacnimi-elektrodami.jpg" alt="Pragolab: Obr. 6 - Znázornění trajektorie iontů mezi zrcadly, jejichž odchylky jsou korigovány kompenzačními elektrodami (tvar kompenzačních elektrod je odvozenou funkcí tvaru zakřivení iontových zrcadel) dle patentu US 9136101 B2. 15.9.2015 a US 10964520 B2. 30.3.2021."/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_7_Potencial_bezztratoveho_mr_TOF_pro_vyvoj_noveho_typu_elektrostaticke_pasti_patentovane_Makarovem_dle_US_9136101_B2_15_9_2015_vlevo_63833926ed/Pragolab-Obr.-7-Potencial-bezztratoveho-mrTOF-pro-vyvoj-noveho-typu-elektrostaticke-pasti-patentovane-Makarovem-dle-US-9136101-B2.-15.9.2015-(vlevo).jpg" alt="Pragolab: Obr. 7 - Potenciál bezztrátového mrTOF pro vývoj nového typu elektrostatické pasti patentované Makarovem dle US 9136101 B2. 15.9.2015 (vlevo); Alexander Makarov byl fascinován elektrostatickými pastmi již v 80. letech minulého století."/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_8_Zatimco_jeden_balik_iontu_je_detekovan_v_orbitalni_iontove_pasti_paralelne_s_tim_dalsi_balik_iontu_sekvencne_podleha_8a758b443b/Pragolab-Obr.-8-Zatimco-jeden-balik-iontu-je-detekovan-v-orbitalni-iontove-pasti-paralelne-s-tim-dalsi-balik-iontu-sekvencne-podleha.jpg" alt="Pragolab: Obr. 8 - Zatímco jeden balík iontů je detekován v orbitální iontové pasti, paralelně s tím další balík iontů sekvenčně podléhá fragmentaci, další akumulaci, další čeká na injektáž do mrTOF a konečně poslední prolétá unikátním multiodrazovým aparátem."/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_9_Srovnani_poctu_identifikaci_proteinovych_skupin_pomoci_soucasneho_high_end_instrumentu_sedive_309f1f1d1b/Pragolab-Obr.-9-Srovnani-poctu-identifikaci-proteinovych-skupin-pomoci-soucasneho-high-end-instrumentu-(sedive).jpg" alt="Pragolab: Obr. 9 - Srovnání počtu identifikací proteinových skupin pomocí současného high-end instrumentu (šedivě) a s novým Orbitrap Astral (barevně) za různý čas chromatografické separace."/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Obr_10_Rodina_soucasnych_zastupcu_hmotnostnich_spektrometru_s_orbitalni_pasti_9f70b562c2/Pragolab-Obr.-10-Rodina-soucasnych-zastupcu-hmotnostnich-spektrometru-s-orbitalni-pasti..jpg" alt="Pragolab: Obr. 10 - Rodina současných zástupců hmotnostních spektrometrů s orbitální pastí"/>
Pro více informací kontaktujte Lukáše Plačka (placek@pragolab.cz, +420 733 656 164).
Tým Pragolab s.r.o.
<h3>Přehled literatury pro <a href="https://lcms.cz/library?from=2023&amp;mainauthorItems=3&amp;search=Astral&amp;to=2023">Thermo Scientific Orbitrap Astral v knihovně LabRulez</a></h3>
<ul>
<li>Orbitrap Astral mass spectrometer - Brochure (Brožury a specifikace | 2023)
</li>
<li>Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) metabolomics: an intelligent combination of targeted and untargeted workflows using the novel Orbitrap Astral mass spectrometer (Postery | 2023)
</li>
<li>Orbitrap Astral mass spectrometer - Product specifications (Brožury a specifikace | 2023)
</li>
<li>Orbitrap Astral mass spectrometer (Brožury a specifikace | 2023)
</li>
<li>ASMS: A Benchmarking Workflow for High-Throughput DIA Label-Free Quantification using a Novel High-Resolution Accurate Mass Platform (Postery | 2023)
</li>
<li>Deeper proteome coverage and faster throughput for low input samples on the Thermo Scientific Orbitrap Astral mass spectrometer (Aplikace | 2023)
</li>
<li>ASMS: Single-Shot LC-MS Workflow for Comprehensive Proteome Identification on an Orbitrap Astral Mass Spectrometer (Postery | 2023)
</li>
<li>New standards for plasma proteomics—Balancing throughput for large sample cohorts and depth of analysis for biomarker discovery (Aplikace | 2023)
</li>
<li>ASMS: An In-depth Plasma Proteomics Workflow Powered by Orbitrap Astral Mass Spectrometer (Postery | 2023)
</li>
<li>Exploring your proteomics universe with the Thermo Fisher Scientific proteomics solution (Příručky | 2023)
</li>
</ul>

Orbitrap Astral - hvězdný hmotnostní spektrometr

<h5>Těšit se můžete na:</h5>
<ul>
<li>10 zajímavých přednášek z oblastí:</li>
<li>Interaktivní workshopy</li>
<li>Bohaté občerstvení</li>
</ul>
<h5>Termín a místo:</h5>
<ul>
<li>Termín: 28. 11. 2023</li>
<li>Místo: Hotel Don Giovanni Prague</li>
</ul>
<h5>Témata:</h5>
<ul>
<li>Příprava vzorků a separace</li>
<li>Malé molekuly</li>
<li>Biofarmaka a oligomery</li>
</ul>
<h3>Registrace</h3>
Z důvodu omezené kapacity si, prosím, rezervujte své místo co nejdříve. Registrace je možná do 14. 11. 2023.
<ul>
<li>👉 <a href="https://forms.office.com/Pages/ResponsePage.aspx?id=aR-wpy9pT0iMxW5H7RJK8WO2jiQLb7NOszjVkgYyezJUQjA5OVFHWTA2NFRZN0NDSE5QVERDSlZZMC4u">Registrační formulář</a></li>
</ul>
<h3>Program</h3>
<h5>08:15 — 09:00 Registrace a welcome coffee</h5>
<h4>09:00 — 10:30 Příprava vzorků a separace</h4>
<h5>1. Jak může metoda <a href="https://lcms.cz/library?mainauthorItems=3&amp;sources=LCMS&amp;search=HILIC">HILIC</a> pomoci ve Vaší laboratoři?</h5>
<ul>
<li>Přednášející: prof. PharmDr. <a href="https://lcms.cz/articles?search=Lucie+Nov%C3%A1kov%C3%A1">Lucie Nováková</a>, Ph.D. (Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové)</li>
</ul>
<h5>2. Automatizovaná platforma pro stanovení chirality farmaceutických produktů a metabolitů využívající chlormravenčany</h5>
<ul>
<li>Přednášející: Ing. <a href="https://lcms.cz/articles?search=Martin+Moos">Martin Moos</a>, Ph.D. (Biologické centrum AV ČR, v. v. i.)</li>
</ul>
<h5>10:30 — 11:00 Coffee break a interaktivní workshopy</h5>
<h4>11:00 — 12:00 Malé molekuly</h4>
<h5>3. Význam <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=5&amp;instrumentationItems=31&amp;mainauthorItems=3&amp;search=impurities&amp;sources=LCMS">hmotnostní spektrometrie při identifikaci nečistot</a></h5>
<ul>
<li>Přednášející: Mgr. Eva Harazim, Ph.D. (Teva Czech Industries s.r.o.)</li>
</ul>
<h5>4. Inovace a vývoj analytické instrumentace</h5>
<ul>
<li>Přednášející: Ing. Michal Godula, Ph.D. (Thermo Fisher Scientific)</li>
</ul>
<h5>5. Kvantifikace stopových nečistot ve farmacii: <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=5&amp;instrumentationItems=31-35&amp;mainauthorItems=3&amp;search=impurities+quantification&amp;sources=LCMS">QqQ</a> vs. <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=5&amp;instrumentationItems=31-33&amp;mainauthorItems=3&amp;sources=LCMS&amp;search=impurities+quantification">Orbitrap</a> Exploris</h5>
<ul>
<li>Přednášející: Ing. Petra Dinisová (Zentiva, k.s.)</li>
</ul>
<h5>6. <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=3&amp;instrumentationItems=31&amp;mainauthorItems=3&amp;search=impurities+quantification&amp;sources=LCMS">LC-MS ve forenzní analýze</a></h5>
<ul>
<li>Přednášející: doc. Ing. <a href="https://lcms.cz/articles?search=Martin+Kucha%C5%99">Martin Kuchař</a>, Ph.D. (<a href="https://lcms.cz/companies/11">VŠCHT Praha</a>)</li>
</ul>
<h5>12:00 — 12:30 Coffee break a interaktivní workshopy</h5>
<h4>12:30 — 13:30 Biofarmaka a oligomery</h4>
<h5>7. Analýza <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=5&amp;instrumentationItems=31&amp;mainauthorItems=3&amp;sources=LCMS&amp;search=mAb">monoklonálních protilátek</a> a jejich konjugátů pomocí hmotnostní spektrometrie</h5>
<ul>
<li>Přednášející: Mgr. Martin Hubálek, Ph.D. (<a href="https://lcms.cz/companies/62">Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.</a>)</li>
</ul>
<h5>8. LC/UV-MS analýza syntetických <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=5&amp;instrumentationItems=31&amp;mainauthorItems=3&amp;sources=LCMS&amp;search=Oligonucleotides">oligonukleotidů</a> — výzvy, kam se podíváte</h5>
<ul>
<li>Přednášející: Ing. Martina Čumová, Ph.D. (Synthon, s.r.o.)</li>
</ul>
<h5>9. Využití <a href="https://lcms.cz/library?categoryItems=5&amp;instrumentationItems=31-33&amp;mainauthorItems=3&amp;search=Peptides&amp;sources=LCMS">HRMS v oblasti peptidové chemie</a></h5>
<ul>
<li>Přednášející: Ing. Lenka Svobodová, Ph.D. (APIGENEX s.r.o.)</li>
</ul>
<h5>10. Hyaluronan v očích LC-MS: zkoumání metabolismu a syntézy značením ¹³C</h5>
<ul>
<li>Přednášející: Ing. Matěj Šimek, Ph.D. (Contipro a.s.)</li>
</ul>
<h5>13:30 Oběd</h5>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pragolab_Seminar_Hmotnostni_spektrometrie_v_bio_farmaceuticke_analyze_ed0acfc9b8/Pragolab-Seminar-Hmotnostni-spektrometrie-v-(bio)farmaceuticke-analyze.jpg" alt="Pragolab: Seminář: Hmotnostní spektrometrie v (bio)farmaceutické analýze"/>
 V případě jakýchkoli dotazů kontaktujte, prosím, Andreu Zuzánkovou: zuzankova@pragolab.cz/+420 778 960 580.
Aktuální informace také na našem webu <a href="https://www.pragolab.cz/udalosti/detail/469">Hmotnostní spektrometrie v (bio)farmaceutické analýze / Mass Spectrometry in (Bio)Pharmaceutical Analysis</a>
Těšíme se na setkání s Vámi.
Tým Pragolab s.r.o.

Seminář: Hmotnostní spektrometrie v (bio)farmaceutické analýze

Webináře

Aplikace

Akademie

Osobnosti

Plasty

Životní prostředí

Potraviny

Vody

Zdraví

Přednáška

Vědecký článek

Rozhovor

Toxikologie

Popularizace

Věda a výzkum

Software

Covid-19

Kariéra

Článek

Laboratoře

Různé

Produkt

Video

Poster

Nejbližší akce

Typ novinky

Zaměření

Škola hmotnostní spektrometrie je odborná vzdělávací akce pořádaná od roku 1986, která vedle zajímavých přednášek a kurzů nabízí i nespočet příležitostí k přátelským setkáním a diskusím.

Škola hmotnostní spektrometrie

Jsme jedním z lídrů na českém a slovenském trhu v oblasti laboratorních zařízení a svým zákazníkům přinášíme špičkové přístroje z oboru analytické chemie a fyzikálních měření více než 25 let.

Pragolab

DataApex at ISC 2026

Představení přístroje Revo od společnosti Nicoya

Waters at ISC 2026

From Legacy Workflows to Paperless Labs: Track Every Sample, Process, and Decision

Informatics series #34 Ready for Self-Documenting Chromatography?

Ask the Expert: What to expect from the new Thermo Scientific™ Orbitrap™ Excedion™ Hybrid mass spectrometers