<p><strong>Přenesení špičkových vědeckých výsledků do praxe, urychlení vývoje nových produktů pro včasnější diagnostiku a výzkum biologických léčiv přinese spojení Mikrobiologického ústavu AV ČR a biotechnologické společnosti AffiPro. Ta vlastní unikátní technologie a produkty pro hmotnostní spektrometrii. Tento strategický krok otevírá možnosti spolupráce především na poli personalizované medicíny.</strong></p><p>Spin-off společnost AffiPro vzniká spojením Mikrobiologického ústavu AV ČR a firmy AffiPro, s.r.o. Zápis změny v obchodním rejstříku provedl Městský soud v Praze 14. května 2025. Poměr vkladových podílů činí <strong>13,75 % (MBÚ AV ČR) ku 86,25 % (dosavadní společníci AffiPro).</strong></p><p><i>„Naším cílem je výrazně urychlit a zefektivnit vývoj biologických léčiv a zároveň přinášet inovace, které zjednoduší práci vědeckým týmům v oblasti strukturní biologie a klinické diagnostiky,“ </i>říká jednatel a zakladatel <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://affipro.cz/"><strong>společnosti AffiPro</strong></a> Petr Pompach.</p><p><i>„Využíváme technologie imobilizovaných enzymových reaktorů (IMERs), měkkého přistávání iontů (Ion Soft Landing, ISL) a robotických zařízení pro automatizované zpracování vzorků. Tyto nástroje umožňují například detailní analýzu post-translačních modifikací bílkovin nebo strukturní charakterizaci proteinů a nukleových kyselin,“ </i>dodává.</p><p>Podle vedoucího Laboratoře strukturní biologie a buněčné signalizace Mikrobiologického ústavu AV ČR v centru BIOCEV a zároveň zakladatele AffiPro Petra Nováka je hlavním cílem firmy přispět k rozvoji personalizované medicíny: <i>„Naše technologie se již nyní používají k analýze proteinů a biologických léčiv či v klinické diagnostice. Současně vyvíjíme nástroje pro detailní analýzu oligonukleotidů, které najdou uplatnění v oblasti genových terapií a vakcín na bázi mRNA.“</i></p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/MBU_Mikrobiologicky_ustav_AV_CR_vstupuje_do_biotechnologicke_spolecnosti_Affi_Pro_pomuze_to_vyvoji_novych_leciv_2_6aefdabcd5.jpg" alt="MBÚ: Mikrobiologický ústav AV ČR vstupuje do biotechnologické společnosti AffiPro, pomůže to vývoji nových léčiv: Foto zleva: RNDr Petr Novák, Ph.D. | vedoucí laboratoře strukturní biologie a&nbsp;buněčné signalizace MBÚ AV ČR v&nbsp;centru BIOCEV; RNDr. Petr Pompach, Ph.D. | Jednatel společnosti AffiPro; Ing. Jiří Hašek, CSc. | ředitel MBÚ AV ČR." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_MBU_Mikrobiologicky_ustav_AV_CR_vstupuje_do_biotechnologicke_spolecnosti_Affi_Pro_pomuze_to_vyvoji_novych_leciv_2_6aefdabcd5.jpg 173w," sizes="100vw" width="1536" height="1384"></p><p>Společnost AffiPro uvádí na trh jedinečné portfolio produktů určených pro základní výzkum, zdravotnictví, biotechnologický i farmaceutický průmysl. Spojením výzkumného zázemí Akademie věd a dynamiky biotechnologické firmy vzniká silná platforma pro inovace, technologický transfer a spolupráci s průmyslovými partnery. Výzkumné, vývojové a výrobní kapacity firmy AffiPro jsou situované ve Vestci u Prahy, části vědecko-technologického klastru STAR.</p><p><i>„Děkuji všem, kteří se podíleli na této komercializaci výstupů činnosti našeho ústavu. Jedná se o první vstup MBÚ AV ČR do společnosti typu spin-off za dobu své existence. Úspěšný rozvoj firmy v posledních letech i budoucí plány dávají značný předpoklad efektivního pokračování spolupráce mezi naším ústavem a firmou AffiPro. Věřím, že jsme učinili logický krok, který bude přínosem pro obě strany a povede ke zvýšení konkurenceschopnosti českého biotechnologického průmyslu,“</i> říká Jiří Hašek, ředitel Mikrobiologického ústavu AV ČR.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/MBU_Mikrobiologicky_ustav_AV_CR_vstupuje_do_biotechnologicke_spolecnosti_Affi_Pro_pomuze_to_vyvoji_novych_leciv_75c7d1eeaa.jpg" alt="MBÚ: Mikrobiologický ústav AV ČR vstupuje do biotechnologické společnosti AffiPro, pomůže to vývoji nových léčiv: Společnost AffiPro s.r.o. se zabývá především vývojem a&nbsp;distribucí enzymatických kolon, robotického zařízení pro vodík-deuteriovou výměnu (na obrázku) a&nbsp;funcionalizovanými povrchy pro klinické aplikace." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_MBU_Mikrobiologicky_ustav_AV_CR_vstupuje_do_biotechnologicke_spolecnosti_Affi_Pro_pomuze_to_vyvoji_novych_leciv_75c7d1eeaa.jpg 221w," sizes="100vw" width="1536" height="1086"></p><blockquote><p><strong>Více informací na </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://www.affipro.cz"><strong>www.affipro.cz</strong></a><strong> , </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://www.mbu.cas.cz"><strong>www.mbu.cas.cz</strong></a><strong> , </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://www.biocev.eu"><strong>www.biocev.eu</strong></a><strong> , </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://www.star-cluster.cz"><strong>www.star-cluster.cz</strong></a></p></blockquote>

Mikrobiologický ústav AV ČR vstupuje do biotechnologické společnosti AffiPro, pomůže to vývoji nových léčiv

<h3>🔬 <strong>LC/MS v analytické chemii – obecné zaměření</strong></h3><p><strong>LC/MS (kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí)</strong> je jednou z nejvýkonnějších technik pro kvalitativní i kvantitativní analýzu organických i anorganických látek. Kombinuje <strong>účinnost separace</strong> kapalinové chromatografie s <strong>citlivostí a selektivitou hmotnostního spektrometru</strong>, což umožňuje přesně detekovat sloučeniny i v nízkých koncentracích, často na úrovni ng/L až pg/L.</p><p><strong>Analytický chemik pracující s LC/MS se běžně zabývá:</strong></p><ul><li>přípravou vzorků (extrakce, filtrace, derivatizace),</li><li>optimalizací separačních metod (volba kolon, mobilní fáze),</li><li>nastavením MS detekce (ionizační režimy, analyzátory),</li><li>interpretací dat (kvalitativní identifikace, kvantifikace, validace metod),</li><li>aplikací v oblasti <strong>klinické diagnostiky, farmacie, forenzní analýzy, životního prostředí, potravinářství</strong> nebo<strong> výzkumu biomarkerů</strong>.</li></ul><h3>⚙️ <strong>Hlavní výrobci LC/MS systémů</strong></h3><p>Mezi přední globální výrobce patří:</p><ul><li><strong>Thermo Fisher Scientific</strong> (série <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=134&amp;manufacturerItems=3"><strong>Orbitrap</strong></a>, <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=20&amp;manufacturerItems=3"><strong>TSQ</strong></a>, <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=37&amp;manufacturerItems=3&amp;search=vanquish"><strong>Vanquish</strong></a>)</li><li><strong>Agilent Technologies</strong> (série <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=20&amp;manufacturerItems=10"><strong>6400/6500 QQQ</strong></a>, <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=21&amp;manufacturerItems=10"><strong>LC/Q-TOF 6546/6560</strong></a>)</li><li><strong>SCIEX</strong> (systémy TripleTOF, QTRAP, X500R)</li><li><strong>Waters</strong> (série <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=20&amp;manufacturerItems=5"><strong>Xevo</strong></a>, <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/252"><strong>Synapt</strong></a>, <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=40&amp;manufacturerItems=5"><strong>Acquity UPLC</strong></a>)</li><li><strong>Shimadzu</strong> (<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=20&amp;manufacturerItems=1"><strong>LCMS-8060</strong></a>/<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=21&amp;manufacturerItems=1"><strong>9030</strong></a>, <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=37&amp;manufacturerItems=1"><strong>Nexera</strong></a>)</li></ul><h3>🇨🇿 <strong>Distribuce a servis LC/MS v České republice</strong></h3><p>Hlavní dodavatelé systémů a podpory LC/MS na českém trhu:</p><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/42"><strong>Pragolab s.r.o.</strong></a> (Thermo Fisher Scientific)</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/37"><strong>Altium International s.r.o. (HPST) </strong></a>(Agilent Technologies)</li><li><strong>BioTech a.s.</strong> (SCIEX)</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/50"><strong>Waters Gesellschaft m.b.H.</strong></a><strong> </strong>(přímé zastoupení)</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/43"><strong>SHIMADZU Handels GmbH</strong></a></li></ul><h3><strong>💼 Přehled aktuálních pracovních pozic – LC/MS</strong></h3><blockquote><p class="cke-user_style-important"><strong>👉</strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/career"><strong>Detaily nabízených pracovních pozic v sekci KARIÉRA</strong></a></p></blockquote><blockquote><p class="cke-user_style-important"><strong>👉Vyhledávejte a filtrujte v největší databázi s více než 1000 pracovních pozic v analytické chemii a laboratorních technologiích v ČR i zahraničí.</strong></p></blockquote><h5><strong>1. Altium International: SERVISNÍ TECHNIK – SW specialista (Chromatografie, MS)</strong></h5><ul><li>Česká republika</li><li>Servisní technik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Software, Plynová chromatografie</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/1749"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>2. Pragolab s.r.o.: Field Service Engineer For LC/GC/MS</strong></h5><ul><li>Bratislava</li><li>Servisní technik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Plynová chromatografie</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/968"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>3. Fakultní nemocnice Ostrava: Vedoucí proteomické výzkumné skupiny</strong></h5><ul><li>Ostrava</li><li>Vědecký a výzkumný pracovník, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/2280"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>4. Státní zdravotní ústav: ZDRAVOTNÍ LABORANT/-KA – Oddělení stafylokokových a bakteriálních alimentárních infekcí</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Laborant, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Molekulární biologie</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/2276"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>5. Národní centrum zemědělského a potravinářského výzkumu: Výzkumný pracovník/ce – analytický chemik</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Analytický chemik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Vědecký a výzkumný pracovník</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/2019"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>6. Národní centrum zemědělského a potravinářského výzkumu: Výzkumný pracovník – chemik</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Analytický chemik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Vědecký a výzkumný pracovník</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/2018"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>7. Ústav pro hydrodynamiku AV ČR: Analytik/Analytička hydrochemické laboratoře</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Analytický chemik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Plynová chromatografie</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/2000"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>8. Akademie věd ČR – Laboratoř fotosyntézy: Postdoc position</strong></h5><ul><li>Třeboň</li><li>Akademický pracovník, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Mikroskopie</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/1894"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>9. J. Heyrovského ústav fyzikální chemie: Postdoctoral Researcher in Gas Phase Ion Chemistry</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Analytický chemik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí, Plynová chromatografie s hmotnostní detekcí</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/1893"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>10. Ústav molekulární genetiky AV ČR: Operátor LC-MS</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Analytický chemik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/1821"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>11. Ústav molekulární genetiky AV ČR: Vědecký asistent/pracovník – hmotnostní spektrometrie</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Vědecký a výzkumný pracovník, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/1819"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>12. BIOCEV: Proteomics LC-MS operator</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Analytický chemik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/1336"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul><h5><strong>13. APIGENEX s.r.o.: CHEMIK PRO SYNTÉZU PEPTIDŮ</strong></h5><ul><li>Praha</li><li>Analytický chemik, Kapalinová chromatografie s hmotnostní detekcí</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/14"><strong>Detaily pracovní pozice naleznete zde</strong></a></li></ul>

Práce v oblasti LC/MS: Přehled pracovních pozic v analytické chemii v Česku a na Slovensku

<p><strong>&nbsp;„Pokud viru vezmeme ‚nejlepší mutace‘, můžeme ho oslabit,“ říká biochemik Jiří Zahradník, který vede virologickou laboratoř v </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/309"><strong>BIOCEVu</strong></a><strong>. Zkušenosti z prestižního Weizmannova institutu v Izraeli přetavil do výzkumu, jehož cílem je předpovídat mutace virů ještě dřív, než se objeví v populaci – a možná tak jednou pomoci zastavit další pandemii dřív, než vůbec začne.</strong></p><p>Když se Jiří Zahradník v roce 2018 vydal na prestižní Weizmannův institut věd v izraelském Rechovotu, zaměřoval se na výzkum proteinových interakcí – tedy na to, jak spolu jednotlivé bílkoviny v buňkách „mluví“ a jak jejich vzájemné vazby ovlivňují životní procesy. V době, kdy rozvíjel metody in vitro evoluce a proteinového inženýrství, však svět zasáhla pandemie covidu-19. „<i><strong>Ze dne na den jsem musel odložit svůj původní výzkum a přejít na covidový</strong></i>,“ vzpomíná Zahradník. „<i><strong>Naštěstí se ukázalo, že nástroje, které jsem vyvíjel pro studium evoluce proteinů, se dají výborně použít i při zkoumání evoluce virů.</strong></i>“</p><p>Tím se jeho práce přirozeně posunula směrem, který určil i jeho současné zaměření. Dnes vede laboratoř v BIOCEVu, společném výzkumném centru Univerzity Karlovy a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/10"><strong>Akademie věd ČR</strong></a>, kde se jeho tým patřící k 1. lékařské fakultě UK věnuje vývoji a využití moderních evolučních metod a metod proteinového inženýrství ke studiu biologických jevů, které klasické postupy strukturní biologie nedokážou dobře zachytit. Výzkum je založen na vytváření alternativ k přirozeným proteinům – takových, které se lépe chovají v laboratorních podmínkách a umožňují detailněji zkoumat jejich vlastnosti i vzájemné interakce.</p><h4><strong>Kultura spolupráce</strong></h4><p>Zkušenosti z Izraele, kde podle něj panuje mimořádně otevřená a kooperativní vědecká kultura, si přivezl i do Česka. „<i><strong>Stačilo zvednout telefon a během pár hodin jsem měl potřebné vzorky. Všichni vědci tam přesně vědí, kdo na čem pracuje, a spolupráce je naprostou samozřejmostí</strong></i>,“ říká. Právě tento přístup se snaží přenést i do českého prostředí – do týmu, který propojuje biochemii, virologii a evoluční biologii a který dnes patří k nejzajímavějším pracovištím v oblasti molekulární virologie v Česku.</p><p>Izrael je pro vědce v mnoha ohledech zemí zaslíbenou – špičkové zázemí, otevřená spolupráce, rychlost, s jakou se projekty rozbíhají. Ale i ráj má své limity. Na otázku, proč se po několika letech rozhodl vrátit do Česka, odpovídá bez váhání: „<i><strong>Moje partnerka tehdy řekla jasně, že v Izraeli žít nechce. A zpětně musím uznat, že měla pravdu. Naše životní podmínky jsou tady nesrovnatelně lepší.</strong></i>“</p><p>Podle něj máme v Česku tendenci své prostředí podceňovat. „<i>Máme pocit, že nic nefunguje a všechno je špatně, ale z mé zkušenosti to nemůže být dál od pravdy. Už jenom taková zdánlivá drobnost, jako je teplotní komfort v budovách, je u nás úplně jinde než třeba ve Španělsku, Británii, Americe, Izraeli nebo Japonsku, kde jsem nějakou dobu pobýval. A to nemluvím o zdravotní péči v Izraeli – měl jsem luxusní, velmi drahé pojištění, ale dostat se ke kvalitnímu ošetření byl obrovský problém. Často jsem musel doplácet částky, o kterých se nám tady ani nezdá.</i>“</p><p>Po návratu do Česka navázal na výzkum, který rozvíjel už na Weizmannově institutu. Na 1. LF UK bylo tehdy otevřené výběrové řízení, kam se přihlásil a uspěl. Nová pozice spadala pod Národní institut virologie a bakteriologie (NIVB), takže přirozeně pokračoval ve studiu viru SARS-CoV-2 a dalších respiračních patogenů. Součástí grantu, který získal, bylo i otevření nové laboratoře – moderního pracoviště s nejvyšším stupněm biologické bezpečnosti, tzv. BSL-3, kterou vybudovali s lékařkou a vědkyní Zorou Mělkovou a také ve spolupráci s Přírodovědeckou fakultou UK a docentkou Ruth Tachezy, koordinátorkou NIVB na Univerzitě Karlově.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"></p><h4><strong>Za dveřmi laboratoře, odkud nic nesmí ven</strong></h4><p><strong>Virologická laboratoř kategorie BSL-3</strong> patří mezi ta nejbezpečnější zařízení pro práci s infekčními viry. Před každým, kdo chce dovnitř, stojí několik vrstev ochrany – <strong>od speciálního obleku a dýchací masky až po dvojí rukavice a systém přechodových místností</strong> s postupně se snižujícím tlakem. Veškeré pokusy se odehrávají v uzavřených laminárních boxech, odkud se žádný vzorek nesmí dostat mimo kontrolované prostředí. Použité materiály putují do průtahového autoklávu, kde projdou dekontaminací při vysokém tlaku a teplotě. Vzduch i voda se filtrují přes vícestupňové systémy, takže laboratoř zůstává uzavřeným ekosystémem.</p><p>„<i><strong>Běžně pracujeme se SARS-CoV-2 nebo HIV. Máme ale i rukavicový box pro práci s ještě nebezpečnějšími původci onemocnění</strong></i>,“ říká Jiří Zahradník. Přístup sem mají jen vyškolení pracovníci. Každý nováček musí projít odborným školením, testem a zpočátku může pracovat jen pod dohledem zkušenějšího kolegy. V laboratoři může být maximálně šest lidí, obvykle ve dvojicích – kvůli bezpečnosti i přehledu. Mimo pracovní dobu a přítomnost personálu svítí na stropě germicidní lampy, které sterilizují prostor ultrafialovým světlem. Když je potřeba důkladnější čištění, laboratoř se uzavře a zaplní parami peroxidu vodíku. „<i><strong>Používáme osmiprocentní roztok, a to by vám klidně vybělilo tričko,</strong></i>“ směje se Jiří Zahradník.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="548"></p><h4><strong>Kreativita potřebuje prostor</strong></h4><p>Úspěch jeho výzkumu stojí nejen na moderním vybavení a schopném týmu, ale i na mezinárodních kontaktech, které si přivezl ze zahraničí. „<i>Byly to právě vazby z mého dřívějšího působení na Weizmannově institutu a z koronavirového výzkumu. Díky nim jsme se mohli rychle zapojit do mezinárodních projektů a splnit pro začínající laboratoř nelehké cíle, které grant vyžadoval. Navazovali jsme na výzkum, který už běžel, věděli jsme, jaké otázky jsou aktuální a co můžeme ostatním týmům nabídnout,</i>“ popisuje.</p><p>Jedním z problémů, s nimiž se laboratoř potýká, je ale samotné umístění BIOCEVu ve Vestci-Jesenici u Prahy. „<strong>Studenti sem moc nechtějí. Říkají, že je to daleko, i když je to pořád v rámci Prahy, mnozí to berou jako komplikaci,</strong>“ přiznává. I pro něj osobně je to velký kontrast oproti Weizmannovu institutu. „<strong>To je úplně jiný svět, tamní kampus působí jako botanická zahrada – zelený, otevřený prostor, kde se věda dělá v prostředí, které samo podporuje kreativitu,</strong>“ přibližuje atmosféru místa, kde se vědci běžně setkávají venku, sedí na trávě, diskutují a vyměňují si nápady.</p><p>„<strong>Izraelci si moc dobře uvědomují, že věda není továrna. </strong>Není to přímý, rutinní proces. Spousta důležitých myšlenek vzniká právě z neformálních rozhovorů mezi lidmi, kteří si šli jen na chvíli odpočinout od práce,“ podotýká s tím, že podobnou kulturu se snaží vytvářet i v BIOCEVu. „<i>Díky univerzitě a menším grantům na udržitelnost se nám podařilo založit komunitní zahrádku. Výrazně nás v tom podpořil náš přednosta docent Jakoubek. Má správný drive a možná i trochu rebelský přístup. Takže jsme si v tomhle dobře rozuměli,</i>“ směje se Zahradník.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"></p><h4><strong>Úspěchy i překážku výzkumu</strong></h4><p>Jinak byl ovšem jeho návrat na UK obrovskou logistickou a organizační výzvou. Díky <strong>grantu NIVB</strong>, pak <strong>Primus</strong> a nyní také <strong>Junior Star</strong> se ale všechny plány podařilo splnit. Teď stojí před další velkou výzvou. Připravuje <strong>žádost o ERC Consolidator Grant</strong>, v jejichž získávání se Univerzitě Karlově v poslední době daří. Jeden z nich nedávno směřoval i do BIOCEVu. „<i><strong>Respektive pro kolegyni, doktorku Galisovou, která ovšem na univerzitě nezůstane. Zčásti z osobních důvodů, ale také kvůli nedostatečné institucionální podpoře se rozhodla převést svůj ERC grant na univerzitu ve Freiburgu,</strong></i>“ upřesňuje Zahradník, který považuje tento případ za symptom širšího problému.</p><p>„<i>Když jsem se na to díval, téměř třetina všech ERC grantů z UK nakonec odchází jinam. To je, upřímně řečeno, poměrně alarmující a měla by to být pro univerzitní vedení jasná zpětná vazba, že by to chtělo nějakou systémovou změnu. Část úspěšných projektů dokonce nekončí ani v zahraničí, ale přechází na AV ČR. Jednoduše tam, kde mají lepší podmínky pro výzkum. Takže to není o odchodu ze země, ale o hledání funkčního prostředí</i>,“ argumentuje vědec.</p><p>Sám se potýká s podobným problémem. „<i><strong>Letos mi končí jeden z grantů a tím mi vypadnou z rozpočtu zhruba čtyři miliony korun. I když mám momentálně dva velké projekty – operační program Jan Amos Komenský pro mezisektorový výzkum a Junior Star – vznikne mi výrazný finanční propad. A zatím nevím, jak ho pokrýt,</strong></i>“ přiznává otevřeně. Na univerzitě podle něj totiž neexistuje možnost střádat si prostředky nebo pravidla pro situace, kdy vypadne grantové financování.</p><h4><strong>Predikovat další pandemii</strong></h4><p>Když se řeč vrátí k samotnému výzkumu, viditelně se nadchne. „V rámci grantu Junior Star pokračujeme dál – a je to opravdu fascinující. O SARS-CoV-2 dnes víme víc než o jakémkoli jiném viru. Je to nejstudovanější patogen v historii. A my jsme se rozhodli jít o krok dál. <i><strong>Snažíme zjistit, jestli bychom pomocí našich metod dokázali předpovědět mutace, které by mohly umožnit přenos nového koronaviru ze zvířat na člověka,</strong></i>“ popisuje. Zjednodušeně řečeno, jejich cílem je zmapovat, jak by mohl vzniknout další pandemický virus, a to ještě dřív, než k tomu vůbec dojde. Mají v plánu vytvořit mapu rizikových mutací – tedy takových, které by mohly představovat hrozbu pro člověka.</p><p>Na rozdíl od výzkumníků, kteří sbírají vzorky v terénu, má Zahradníkův tým výhodu v laboratorním modelování. „<i>Jsme schopni analyzovat desítky až stovky tisíc různých mutací, včetně těch, které zatím v přírodě nikdo nepozoroval. Můžeme tak modelovat scénáře, které teprve mohou nastat,</i>“ pokračuje Zahradník. Právě díky tomu se k nim sekvence varianty Omikron dostala už druhý den po jejím objevení. Okamžitě ji začali zkoumat a byli mezi prvními, kdo popsal její základní vlastnosti.</p><p>„<i><strong>Umíme predikovat mutace, které mají tzv. high fitness – tedy takové, které viru přinášejí výhodu,</strong></i>“ vysvětluje. „<i>Pokud bychom dokázali tyto mutace zohlednit při vývoji vakcín, mohli bychom viru vlastně zabránit, aby si je vůbec ‚vybral‘. Místo abychom jen reagovali na nové varianty, mohli bychom aktivně ovlivňovat evoluční směr viru. To by mohlo zásadně změnit způsob, jak přemýšlíme o vakcínách i prevenci budoucích pandemií,</i>“ shrnuje biochemik.</p><blockquote><h5><strong>RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D.</strong></h5><p>Působí na 1. lékařské fakultě UK a pracovišti BIOCEV, kde vede laboratoř umožňující bezpečnou práci s vysoce infekčními viry. Pro svůj výzkum virových hrozeb získal grant Junior Star. Předtím působil na Weizmannově institutu věd v Izraeli, kde byl oceněn cenou za vynikající vědecké výsledky. Výzkumně se věnuje evoluci a adaptaci koronavirů, zejména jejich receptorových domén (RBD) a mechanismů, jimiž se přizpůsobují lidským buňkám. Cílem jeho výzkumu je porozumět tomu, jak a proč některé viry překračují bariéry, a přispět tak k prevenci budoucích pandemií. Sleduje i mutace, které mohou zvýšit infekčnost či přenos mezi druhy.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"></p></blockquote>

Zahradník: Chceme být vždy krok před virem

<p><strong>Dva semináře pořádané v </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/36"><strong>CEITEC</strong></a><strong> (15. 9. 2026) a </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/309"><strong>BIOCEV</strong></a><strong> (17. 9. 2026) institucích zaměřené na nejnovější technologie a řešení v oblasti genomiky, proteomiky, metabolomiky a prostorové transkriptomiky.</strong></p><p>V průběhu programu se seznámíte s aktuálními trendy v analýze dat, automatizaci laboratoří a pokročilými nástroji pro charakterizaci vzorků – od prostorové transkriptomiky a mapování genomu s vysokým rozlišením až po cílené omické pracovní postupy s využitím LC/MS.</p><blockquote><p class="cke-user_style-important"><strong>👉</strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/events/1363"><strong>Registrace na Multi-Omics Solutions Day na CEITEC</strong></a></p><p class="cke-user_style-important"><strong>👉</strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/events/1364"><strong>Registrace na Multi-Omics Solutions Day v BIOCEVU</strong></a></p></blockquote><h3><strong>Program seminářů</strong></h3><h5><strong>od 9:30 Registrace</strong></h5><h5><strong>10:00-10:05 Úvodní slovo</strong></h5><ul><li>Naděžda Jeřábková, Altium</li></ul><h5><strong>10:05-10:20 MGI's Comprehensive Spatial Transcriptomics Solution, Genomics Core Facility</strong></h5><ul><li>Petr Vácha, Altium</li></ul><h5><strong>10:20-10:35 From Raw Data to Publication-Ready Insights: End-to-End Analytics for Stomics Users</strong></h5><ul><li>Daniel Žucha, Carta Genum</li></ul><h5><strong>10:35-10:45 High-Res Electronic Genome Mapping with Nabsys, Genomics Core Facility</strong></h5><ul><li>Petr Vácha, Altium</li></ul><h5><strong>10:45-11:00 Fast and effective protein isolation solution from GenScript</strong></h5><ul><li>Kateřina Teznerová, Altium</li></ul><h5><strong>11:00-11:15 Unchain your characterisation tools</strong></h5><ul><li>James Parry, Unchained lab&nbsp;</li></ul><h5><strong>11:15-11:30 Opals are more than just gems: Precise Tissue Phenotyping with Spatial Context</strong></h5><ul><li>Kateřina Sedláčková, Altium</li></ul><h5><strong>11:30-12:00 Přestávka na kávu</strong></h5><h5><strong>12:00-12:10 One Bravo: multiple choices. Compact and versatile robot for omics sample prep</strong></h5><ul><li>Petr Vácha, Altium</li></ul><h5><strong>12:10-12:25 Evaluating the efficacy of metabolite-protein interactions</strong></h5><ul><li>Kateřina Sedláčková, Altium</li></ul><h5><strong>12:25-12:45 Targeted omics workflows by LC/MS</strong></h5><ul><li>Jitka Zrostlíková, Altium</li></ul><h4><strong>CEITEC</strong></h4><h5><strong>12:45-13:00 From Sample Growth to Smart Storage - Automation Solutions for Modern Biobanks and Life Science Laboratories</strong></h5><ul><li>Lukáš Slavata, Altium&nbsp;</li></ul><h5><strong>13:00-14:00 Workshop: Genomics Core Facility and Agilent AssayMAP proteomics Bravo demonstration in CEITEC core proteomics laboratory</strong></h5><ul><li>prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal</li></ul><h4><strong>BIOCEV</strong></h4><h5><strong>12:45-13:00 High-speed mass spectrometry protocol for detecting clinically relevant bacterial resistance and virulence determinants</strong></h5><ul><li>Dmitry Loginov, Petr Novák, Ljubina Adámková, Mikrobiologický ústav AV ČR&nbsp;</li></ul><h5><strong>13:00-13:15 From Sample Growth to Smart Storage - Automation Solutions for Modern Biobanks and Life Science Laboratories</strong></h5><ul><li>Lukáš Slavata</li></ul><h5><strong>13:15-14:15 Workshop: GeneCore Facility and Agilent AssayMAP proteomics Bravo demonstration in Biocev Laboratory of structural biology and cell signaling&nbsp;</strong></h5><ul><li>RNDr. Petr Novák, Ph.D.</li></ul><h3><strong>Místa konání</strong></h3><h5><strong>Central European Institute of Technology (CEITEC)</strong></h5><ul><li>Kamenice 753/5, Brno 625 00</li><li>Univerzitní areál Bohunice, budova E35, 2. patro, zasedací místnost 211</li></ul><h5><strong>BIOCEV - Institute of Biotechnology of the Czech Academy of Sciences</strong></h5><ul><li>Průmyslová 595, 252 50 Vestec</li><li>Zasedací místnosti – Červená-Zelená (U1.037 a U1.038) – střední atrium v přízemí hlavní budovy BIOCEV.</li></ul><blockquote><p>Máte-li jakékoli další dotazy, neváhejte se na nás obrátit.</p><p><strong>Lenka Vlčková</strong></p><ul><li>+420 734 268 290</li><li>lenka.vlckova@altium.net</li></ul></blockquote>

Nenechte si ujít Multi-Omics Solutions Days pořádáné Altium International

Webináře

Aplikace

Akademie

Osobnosti

Plasty

Životní prostředí

Potraviny

Vody

Zdraví

Přednáška

Vědecký článek

Rozhovor

Toxikologie

Popularizace

Věda a výzkum

Software

Covid-19

Kariéra

Článek

Laboratoře

Různé

Produkt

Video

Poster

Nejbližší akce

Typ novinky

Zaměření

Akademie věd České republiky (AV ČR) vznikla v roce 1992 jako nástupce někdejší Československé akademie věd. V současnosti ji tvoří komplex 54 veřejných výzkumných institucí.

Akademie věd České republiky

Je autorizovaným distributorem společnosti Agilent Technologies pro Českou republiku v oblastech chromatografie (GC, HPLC, UHPLC, kapilární elektroforéza) a hmotnostní spektrometrie (GC/MS, LC/MS, CE/MS), disolučních aparátů, molekulární (UV-Vis, UV-Vis-NIR, fluorescence, FTIR analyzátory a mikroskopy) a atomové spektroskopie (ICP-OES, ICP-MS, AAS), a v neposlední řadě také v oblasti molekulární biologie a genomiky (analýza nukleových kyselin a proteinů, microarray skenery a skla, PCR & RT-PCR, qPCR, řešení pro NGS, reagencie pro mutagenezi a klonování, sondy FISH a další).

Altium International

Vše ze světa analytické chemie na jednom místě. Propojujeme lidi při řešení jejich problémů. U nás naleznete všechny potřebné informace snadno, rychle a přehledně. Přestaňte hledat a začněte nacházet.

LabRulez

Reportáže, rozhovory, zprávy o vědeckých projektech a studentských akcích ... Jsme online informační bránou Univerzity Karlovy.

Forum: magazín Univerzity Karlovy

DataApex at ISC 2026

Představení přístroje Revo od společnosti Nicoya

Waters at ISC 2026

From Legacy Workflows to Paperless Labs: Track Every Sample, Process, and Decision

Informatics series #34 Ready for Self-Documenting Chromatography?

Ask the Expert: What to expect from the new Thermo Scientific™ Orbitrap™ Excedion™ Hybrid mass spectrometers