To, zda léčivo dokáže účinně zasáhnout svůj cílový protein nebo jak spolu jednotlivé části viru či buňky interagují, závisí na dějích odehrávajících se na úrovni jednotlivých molekul. Jejich chování přitom neurčuje jen tvar, ale také elektrostatické síly, které mezi nimi působí. Porozumět jejich rozložení proto vědcům pomáhá lépe pochopit, proč se určité molekuly přitahují, jak se k sobě vážou a jak spolu vzájemně interagují.Právě k tomu slouží <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://acc.biodata.ceitec.cz/">Atomic Charge Calculator (ACC)</a>, výpočetní nástroj, který vědci z&nbsp;Masarykovy univerzity rozvíjejí už více než deset let. Jeho třetí, dosud nejpokročilejší generace vznikla na CEITEC Masarykovy univerzity a Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity ve spolupráci s Fakultou informatiky MU a Univerzitou Palackého v Olomouci.ACC III umožňuje počítat elektrické náboje jednotlivých atomů a zobrazit jejich rozložení přímo v trojrozměrné struktuře molekul. V jediném prostředí nabízí dvacet různých výpočetních metod a dokáže pracovat s širokým spektrem molekul – od malých organických látek až po proteiny a další velké biomolekulární struktury.Výhodou Atomic Charge Calculator III je spojení širokého spektra výpočetních metod s jednoduchou dostupností: základní výpočty lze provádět přímo prostřednictvím webového prohlížeče, bez instalace specializovaného softwaru a bez registrace. Výsledné náboje lze rovnou zobrazit na 3D modelu molekuly. Pro pokročilé uživatele a rozsáhlé analýzy platforma zároveň nabízí automatizované zpracování dat a možnost provozovat výpočetní jádro lokálně.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/CEITEC_Co_pritahuje_molekuly_Nova_generace_nastroje_z_CEITEC_zviditelnuje_sily_mezi_atomy_d32d7bd2cd.jpg" alt="CEITEC/Biological Data Management and Analysis Core Facility: Co přitahuje molekuly? Nová generace nástroje z CEITEC zviditelňuje síly mezi atomy: Oseltamivir navázaný na neuraminidázu viru chřipky (modře: kladné parciální náboje, červeně: záporné náboje). Mezi záporně nabitou oblastí léčiva a kladně nabitými oblastmi proteinu dochází k silné elektrostatické interakci." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_CEITEC_Co_pritahuje_molekuly_Nova_generace_nastroje_z_CEITEC_zviditelnuje_sily_mezi_atomy_d32d7bd2cd.jpg 140w," sizes="100vw" width="1600" height="1786"><h3>Proč vědce zajímají elektrické náboje atomů</h3>Elektrony nejsou v molekulách rozloženy rovnoměrně. Jednotlivé atomy proto mohou nést různě velký částečný – neboli parciální – elektrický náboj. A právě ten do značné míry ovlivňuje, jak se molekuly budou chovat vůči svému okolí i vůči sobě navzájem.Kladně a záporně nabité části molekul se mohou přitahovat, zatímco stejně nabité části se odpuzují. Rozložení nábojů tak pomáhá určovat, které molekuly se k sobě přiblíží, jakým způsobem se vůči sobě natočí nebo jak pevně se mohou navázat. V biologii je to důležité například při rozpoznávání mezi molekulami nebo při vazbě léčiva na cílový protein. Znalost parciálních nábojů proto vědcům pomáhá lépe porozumět interakcím, které stojí za fungováním mnoha molekulárních systémů.Neexistuje přitom jediný univerzální způsob, jak parciální náboje určit. Různé výpočetní metody mohou vést k odlišným hodnotám a jejich volba závisí také na tom, k čemu chce vědec výsledky použít. Přesné kvantově-chemické výpočty navíc mohou být u velkého množství struktur velmi náročné. ACC III proto sdružuje empirické metody, které umožňují výpočty provádět rychleji a ve velkém měřítku. „ACC III jsme od začátku navrhovali tak, aby byl výpočet parciálních atomových nábojů co nejjednodušší. Uživatel nemusí nic instalovat ani složitě nastavovat – stačí nahrát molekulu a jedním kliknutím spustit výpočet. Aplikace přitom sama nabídne vhodné metody z celkem dvaceti dostupných, přičemž zvládá malé molekuly i rozsáhlé biomolekulární struktury,“ říká <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.ceitec.cz/rndr-tomas-racek-ph-d/u94476?page=publication">Tomáš Raček</a>, který ACC vyvíjí a spravuje od roku 2018.<h3>Jak se protivirový lék váže k proteinu chřipkového viru</h3>Co lze z rozložení nábojů vyčíst, ukazují autoři na známém antivirotiku oseltamivir, prodávaném pod obchodním názvem Tamiflu. Lék se váže na neuraminidázu, protein viru chřipky typu A. Pomocí ACC III lze přímo v trojrozměrné struktuře zobrazit, kde se nacházejí kladné a záporné parciální náboje a jak se podílejí na interakci léčiva s proteinem.„Na příkladu oseltamiviru je dobře vidět, proč je užitečné náboje nejen vypočítat, ale také je zobrazit přímo ve struktuře. Můžeme tak sledovat, které části obou molekul spolu elektrostaticky interagují. Stejným způsobem lze zkoumat mnoho dalších molekulárních systémů,“ vysvětluje Tomáš Raček.ACC III přitom není určen pouze pro malé molekuly. Dokáže pracovat také s proteiny a dalšími velkými biomolekulárními strukturami. Druhým příkladem, na kterém autoři jeho možnosti demonstrují, je pórový komplex SARS-CoV-2. Koronaviry tyto póry vytvářejí během množení v infikovaných buňkách a využívají je k transportu virové RNA přes membrány. Vizualizace parciálních nábojů zde pomáhá rozlišit části komplexu procházející nepolárním prostředím membrány od jeho nabitějších oblastí.<h3>Od výpočtu rovnou k trojrozměrnému modelu</h3>Nová generace Atomic Charge Calculatoru přináší také modernější způsob vizualizace. Využívá nástroj Mol*, který umožňuje vypočtené náboje zobrazit přímo na trojrozměrné struktuře a interaktivně ji prohlížet. Právě vizualizace vytvořená pomocí ACC III se dostala také na obálku speciálního čísla časopisu Nucleic Acids Research věnovaného webovým výzkumným nástrojům. Autorem titulního obrázku, který zachycuje rozložení parciálních nábojů v membránovém proteinovém systému, je Tomáš Raček.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/CEITEC_Co_pritahuje_molekuly_Nova_generace_nastroje_z_CEITEC_zviditelnuje_sily_mezi_atomy_3_85cc310925.jpeg" alt="CEITEC/Oxford University Press: Co přitahuje molekuly_Nová generace nástroje z CEITEC zviditelňuje síly mezi atomy: Obálka speciálního čísla časopisu Nucleic Acids Research." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_CEITEC_Co_pritahuje_molekuly_Nova_generace_nastroje_z_CEITEC_zviditelnuje_sily_mezi_atomy_3_85cc310925.jpeg 124w," sizes="100vw" width="1600" height="2011">Výsledky lze stáhnout v několika standardních formátech a nově také ukládat přímo ve formátu mmCIF, který se běžně používá pro ukládání trojrozměrných struktur biomolekul. Informace o struktuře a vypočtených nábojích tak mohou zůstat společně v jednom souboru a být dále využívány jinými nástroji.Pro zpracování velkého množství struktur je k dispozici také programové rozhraní API a výpočetní jádro, které lze provozovat lokálně. ACC III tak může sloužit jak pro jednotlivé výpočty prostřednictvím webového rozhraní, tak jako součást rozsáhlejších automatizovaných analýz.<h3>Více než deset let vývoje</h3>První Atomic Charge Calculator vědci představili v roce 2015, druhá generace následovala v roce 2020. Tým mezitím vytvořil také specializované nástroje PDBCharges pro struktury z Protein Data Bank a AlphaCharges pro struktury z databáze AlphaFold. „Atomic Charge Calculator nevznikl jako jednorázový projekt,“ uvádí <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.ceitec.cz/prof-rndr-radka-svobodova-ph-d/u17518?page=publication">Radka Svobodová</a>, vedoucí sdílené laboratoře Správa a analýza biologických dat na CEITEC MUNI. „Více než deset let postupně rozvíjíme nástroje, které reagují na nové možnosti strukturní bioinformatiky i na potřeby jejich uživatelů. Třetí generace propojuje jednoduché webové použití s možnostmi, které jsou důležité pro automatizované zpracování velkého množství molekulárních struktur,“ dodává.<blockquote>Atomic Charge Calculator III je volně dostupný prostřednictvím webového rozhraní a pro základní použití nevyžaduje registraci. Jeho vývoj podpořila výzkumná infrastruktura ELIXIR CZ.</blockquote><h5>Novou generaci nástroje představili jeho autoři v časopise <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://academic.oup.com/nar/article/54/W1/W211/8662890">Nucleic Acids Research</a>.</h5>

 Co přitahuje molekuly? Nová generace nástroje z CEITEC zviditelňuje síly mezi atomy 

Ne každé zakoncentrování vzorku lze provádět za zvýšené teploty – a ne každý koncentrátor, který si dobře poradí s ohřevem, dokáže stejně dobře pracovat i při nízkých teplotách. <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/products/2441">Chlazené odstředivé vakuové koncentrátory</a> mají své opodstatnění: proteiny, RNA, enzymy a syntetické peptidy mohou při tepelném namáhání rychle degradovat a běžné koncentrátory spoléhající pouze na ohřev mohou narušit integritu vzorku ještě před dokončením odpařování. Porovnali jsme dva přední chlazené systémy – Labconco Refrigerated CentriVap a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/products/2611">Thermo Fisher Refrigerated SpeedVac SRF110</a> –, abychom zjistili, jak si vedou v laboratořích, kde je zachování integrity vzorků zásadní.<blockquote><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://explore.organomation.com/labconco-refrigerated-centrivap-vs-thermo-fisher-refrigerated-speedvac">Stáhněte si kompletní srovnání včetně cen!</a></blockquote><h3>Jaký problém chlazení skutečně řeší</h3>Jedna podstatná skutečnost se při srovnávání technických specifikací často přehlíží: při provozu <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/lcms/products?manufacturerItems=540&amp;search=centrivap">vakuového koncentrátoru</a> bez regulace teploty se může vzorek nadměrně ochladit. Při odpařování rozpouštědla za vakua se ze vzorku odebírá latentní teplo – jde o stejný princip ochlazování při odpařování, díky němuž odpařující se pot působí chladivě. U tepelně stabilního rozpouštědla to není podstatné. U biomolekul citlivých na teplotu však může teplota vzorku klesnout natolik, že během procesu hrozí nežádoucí zamrznutí nebo sublimace.Technická dokumentace společnosti Labconco k chlazenému systému CentriVap tento princip popisuje přímo: přístroj kombinuje chladicí systém s ohřevem, takže obsluha může udržovat přesně nastavenou teplotu a zabránit sublimaci vzorků způsobené ochlazováním při odpařování. Právě proto tato kategorie přístrojů existuje a je dobré tomu porozumět ještě před porovnáváním jednotlivých technických parametrů.<h3>Cena: Výraznější rozdíl v nejvyšší cenové kategorii</h3>Cena přístroje Labconco Refrigerated CentriVap se obvykle pohybuje kolem 13 000 USD. Thermo Fisher SRF110 je dražší, jeho cena se zpravidla pohybuje mezi 15 000 a 17 000 USD, a to ještě před započtením jednotlivých součástí modulární sestavy. Do celkové ceny je totiž třeba zahrnout také samostatný vakuový systém, rotor, lapač par a teplonosnou kapalinu.Cenový rozdíl mezi těmito dvěma chlazenými systémy je výraznější než u jejich nechlazených protějšků, které jsme porovnávali dříve. V této cenové kategorii tak ještě více vyniká cenová výhodnost systému CentriVap.<h3>Kapacita: Rozdíl, na kterém teď záleží nejvíce</h3>Právě zde se oba systémy liší nejvýrazněji – a tento rozdíl zároveň odpovídá směru, kterým se vyvíjejí požadavky laboratoří. Chlazený CentriVap dokáže zpracovat až 312 vzorků v jednom cyklu, zatímco SRF110 maximálně 132. Oba systémy pracují s objemy až 50 ml, takže na rozdíl od našeho předchozího srovnání zde nejde o kompromis z hlediska objemu vzorku. CentriVap má jednoduše výraznou výhodu v počtu vzorků zpracovaných během jednoho cyklu.Tento rozdíl je důležitý, protože <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://peptidestaff.com/industry-trends/peptide-therapy-market-forecast-2026/">léčiva na bázi peptidů</a> se stala jednou z nejrychleji rostoucích skupin léčiv ve farmaceutickém průmyslu a za hlavní překážku dalšího rozvoje tohoto odvětví je často označována výrobní kapacita, nikoli poptávka. Zejména <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/article/7540">programy GLP-1</a> vedou <a>výrobce peptidů</a> k přechodu na industrializované platformy pro velkoobjemovou výrobu namísto práce s jednotlivými výrobními šaržemi.Rostoucí nároky na výrobní kapacitu se přímo promítají také do <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.organomation.com/">přípravy vzorků</a>: každý purifikační cyklus, každá HPLC frakce i každý koncentrační krok se musí škálovat společně s chemickým procesem. Koncentrátor, který během jednoho cyklu zpracuje více než dvojnásobný počet vzorků, jako je Refrigerated CentriVap, má proto pro laboratoře zabývající se syntézou nebo purifikací peptidů podstatně větší význam než před pěti lety.<h3>Teplotní rozsah: Jak nízko lze jít</h3>CentriVap dokáže chladit až na -10 °C, zatímco nejnižší teplota systému SRF110 je -4 °C. Oba přístroje umožňují ohřev až na +100 °C. Rozdíl šesti stupňů na spodní hranici teplotního rozsahu nemusí na první pohled působit významně, ale u peptidů a enzymů s vysokou citlivostí na teplo poskytuje nižší dosažitelná teplota obsluze větší rezervu pro ochranu vzorku. To může být důležité zejména při delších cyklech, během nichž se může účinek ochlazování při odpařování výrazněji projevit.<h3>Otáčky rotoru a mechanická flexibilita</h3>CentriVap umožňuje nastavit otáčky rotoru v rozsahu 500 až 1 800 ot./min, zatímco SRF110 dosahuje maximálně 1 725 ot./min. Větší význam má v tomto případě především nižší spodní hranice u systému CentriVap. Křehké, rozměrnější nebo na smykové namáhání citlivé vzorky, například intaktní proteiny nebo větší peptidové struktury, mohou vyžadovat nižší otáčky rotoru, aby se omezilo jejich mechanické namáhání. CentriVap tak nabízí širší možnosti nastavení nejen na horní, ale i na dolní hranici rozsahu.<h3>Materiál víka: Viditelnost vs. odolnost</h3>Chlazený CentriVap je vybaven skleněným víkem, které umožňuje během procesu sledovat obsah komory. SRF110 používá hliníkové víko s epoxidovým povlakem, které nabízí vyšší mechanickou odolnost, ale neumožňuje přímý pohled do komory.Pro laboratoře zpracovávající vizuálně odlišné série vzorků – například barevné pufry, vzorky z různých projektů nebo HPLC frakce odebírané v různých časových bodech – může mít možnost zkontrolovat obsah komory bez přerušení cyklu skutečný praktický význam. To platí zejména pro sdílená přístrojová pracoviště, kde jeden přístroj využívá více výzkumných skupin.<h3>Co to znamená pro sdílená přístrojová pracoviště</h3>Sdílená přístrojová pracoviště vnímají omezení z hlediska kapacity zpracování vzorků a práce při nízkých teplotách jinak než laboratoře jedné výzkumné skupiny. <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://blog.organomation.com/blog/an-appreciation-for-academic-core-labs">Pracoviště zpracovávající vzorky od více výzkumných skupin</a> – z nichž některé například provádějí rutinní čištění RNA, zatímco jiné zpracovávají tepelně labilní peptidové frakce po HPLC purifikaci – potřebuje přístroj, který nebude omezovat ani kapacitu zpracování, ani možnosti práce při nízkých teplotách.Kombinace vyšší kapacity na jeden cyklus a nižší dosažitelné teploty dává systému CentriVap větší flexibilitu při různorodém využití přístroje, aniž by všechny výzkumné skupiny musely používat stejně konzervativní nastavení, jaké by vyžadoval méně flexibilní systém.<h3>Podobné prostorové nároky</h3>Oba přístroje jsou rozměrově vhodné pro umístění v digestoři. CentriVap má rozměry 15,0 × 27,2 × 13,9 palce, zatímco SRF110 měří 16,62 × 25 × 13,75 palce. Rozdíly jsou natolik malé, že prostorové uspořádání laboratoře pravděpodobně nebude při výběru rozhodujícím faktorem. Na oba systémy se vztahuje standardní jednoletá záruka.<h3>Závěr</h3>Pro laboratoře, které ve větším měřítku koncentrují proteiny, RNA, enzymy nebo peptidové frakce – zejména pro pracoviště podílející se na vývoji peptidových léčiv, kde je výrobní kapacita již nyní hlavním omezením v celém odvětví – představuje Labconco Refrigerated CentriVap díky kombinaci vyšší kapacity zpracování vzorků, nižší minimální teploty a nižší ceny vhodnější volbu.SRF110 zůstává dobrou volbou pro laboratoře, které zpracovávají menší série vzorků a již standardně využívají modulární vakuový systém Thermo Fisher.Společnost Organomation distribuuje kompletní řadu Labconco CentriVap, včetně modelů Refrigerated a Refrigerated Pro. Kontaktujte náš tým na adrese <a href="mailto:sales@organomation.com">sales@organomation.com</a> a proberte s námi konfiguraci rotoru, výběr vhodné chladicí pasti a plánování kapacity zpracování vzorků pro vaši laboratoř.<blockquote><h5><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://explore.organomation.com/labconco-refrigerated-centrivap-vs-thermo-fisher-refrigerated-speedvac">Stáhněte si kompletní srovnání včetně cen!</a></h5></blockquote>

Chlazený SpeedVac SRF110 vs. CentriVap: Proč je kapacita zpracování vzorků pro laboratoře pracující s peptidy a proteiny důležitější než kdy dříve

Antibiotická rezistence patří mezi nejzávažnější zdravotní hrozby současnosti a její důsledky zasahují daleko za samotnou léčbu infekcí. Ovlivňuje možnosti chirurgie, transplantací, onkologické péče i léčby chronických onemocnění. Jednou z cest k novým účinným antibiotikům může být návrat k mimořádné chemické rozmanitosti přírodních látek – v kombinaci s moderní organickou syntézou. Právě tomuto tématu se na konferenci „<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/events/888">Antibiotická rezistence v ČR: Jak společně zastavit nezastavitelné</a>“ věnoval Mgr. Ondřej Kováč, Ph.D. z Univerzity Palackého v Olomouci.Přednáška „<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/paper/34060">Organická syntéza přírodních látek jako nástroj proti antibiotické rezistenci</a>“ zazněla v rámci bloku Přístupy a strategie v boji proti AMR a ukázala, proč zůstávají přírodní produkty jedním z nejvýznamnějších zdrojů inspirace pro vývoj nových antibiotik a jak může organická syntéza pomoci překonat omezení jejich přirozeného získávání.<blockquote>Konference CZEPAR 2026<ul><li>10. - 11. listopadu 2026</li><li>Hotel Clarion, České Budějovice</li></ul>👉<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSdfFVYYWFWCXmECSeAk2Gtwk019OLpqUSr5f4rdQBaBdqCt1g/viewform">Early bird registrace do 20. září</a><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/CZEPAR_early_bird_registrace_998a197cd5.jpg" alt="CZEPAR: CZEPAR 2026 - Early bird registrace" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_CZEPAR_early_bird_registrace_998a197cd5.jpg 245w," sizes="100vw" width="1920" height="1080"></blockquote><h4>Příroda jako zdroj antibiotik</h4>Historie antibiotik je s přírodními látkami úzce propojena. Mikroorganismy, jako jsou zástupci rodů Streptomyces, Kitasatospora či Penicillium, i další přírodní zdroje produkují strukturálně rozmanité molekuly s biologickou aktivitou.Přibližně 70–80 % antibiotik je přírodního původu. Do této skupiny nebo mezi látky inspirované přírodními produkty patří například peniciliny, aminoglykosidy, tetracykliny, makrolidy, glykopeptidy, cefalosporiny, linkosamidy, karbapenemy, lipopeptidy či pleuromutiliny.Příroda tak nabízí mimořádně bohatou „knihovnu“ chemických struktur, které mohou sloužit přímo jako antibiotika nebo jako výchozí bod pro vývoj nových molekul. Samotné objevení zajímavého přírodního produktu však ještě nemusí znamenat, že je možné jej jednoduše převést do dalšího vývoje.<h4>Když nestačí látku pouze izolovat</h4>Jedním z problémů přírodních produktů může být jejich omezená dostupnost. Příkladem může být platensimycin, inhibitor FabF, jehož izolace poskytovala pouze přibližně 1–2 mg látky z 10–20 litrů fermentační kultury.Právě zde získává zásadní význam organická syntéza. Tu můžeme přirovnat k tzv. „molekulárnímu puzzle“. Chemik rozloží komplexní strukturu na jednodušší části a následně hledá cestu, jak je efektivně spojit do výsledné molekuly.Tento přístup může řešit hned několik problémů. Umožňuje potvrdit strukturu přírodního produktu, připravit větší množství látky pro další biologické testování a především vytvářet její modifikované analogy. Právě změnou jednotlivých částí molekuly lze následně hledat varianty s vyšší antibakteriální aktivitou nebo jinými výhodnými vlastnostmi.<h4>Iboxamycin: od známé třídy antibiotik k nové molekule</h4>Význam syntetické modifikace přírodních struktur Ondřej Kováč demonstroval na příběhu iboxamycinu (<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41586-021-04045-6">Nature 2021, 599, 507–512</a>)Výchozí inspiraci představovala linkosamidová antibiotika lincomycin a clindamycin. Prostřednictvím syntézy a cílených strukturních modifikací vznikl iboxamycin – molekula, která podle prezentovaných výsledků vykazovala aktivitu proti širokému spektru bakteriálních patogenů včetně zástupců skupiny ESKAPE.U iboxamycinu byly prezentovány také výsledky týkající se překonávání některých mechanismů rezistence, nového způsobu vazby a účinnosti v myších modelech. Ve srovnání s předchozími molekulami se zároveň podařilo rozšířit antibakteriální aktivitu i směrem ke gramnegativním bakteriím.Příklad iboxamycinu tak ukazuje, že chemická syntéza nemusí pouze reprodukovat molekulu vytvořenou přírodou. Může umožnit její zásadnější přetvoření a otevřít prostor k vlastnostem, které původní látka neměla.<h4>Od iboxamycinu k BT-33</h4>Vývoj přitom iboxamycinem neskončil. Dalším příkladem je molekula BT-33, připravená v roce 2025 (<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40055575/">Nat. Chem. 2025, 17, 582–589</a> a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39394994/">J. Am. Chem. Soc. 2024, 146, 29135–29139</a>)BT-33 vznikla další syntetickou modifikací struktury iboxamycinu. Prezentovaná data ukazovala mimo jiné účinnost vůči řadě bakteriálních kmenů a zlepšení některých vlastností důležitých pro další vývoj.Mezi vyzdvižené charakteristiky patřilo potlačení rezistence, delší poločas rozpadu, výsledky v myších modelech a postup do preklinického hodnocení. Farmakokinetická data zároveň ukazovala delší poločas BT-33 ve srovnání s iboxamycinem.Vývoj od lincomycinu a clindamycinu přes iboxamycin až k BT-33 dobře ilustruje princip postupného zdokonalování biologicky aktivní molekuly pomocí syntetické chemie: přírodní struktura nebo struktura od ní odvozená poskytne základ, který lze dále systematicky modifikovat a testovat.<h4>Molekulární „pásová výroba“</h4>Vlastní přístup laboratoře Ondřeje Kováče je popsán jako „molekulární pásová výroba“. Myšlenkou je sestavovat složité molekuly z jednodušších stavebních bloků způsobem, který umožňuje nejen přípravu cílového přírodního produktu, ale také jeho následnou modifikaci.Taková strategie může zpřístupnit komplexní struktury, které jsou z přírodních zdrojů dostupné pouze v malém množství, a současně vytvořit prostor pro přípravu celé série analogů.Jako příklady přírodních látek souvisejících s tímto přístupem je uváděn například nocardiopsin D, vykazující aktivitu proti MRSA a VRSA, a simocyclinone D8, u něhož je uveden mechanismus účinku spojený s DNA gyrázou.Organická syntéza se tak stává nejen metodou pro přípravu známých molekul, ale také prostředkem pro systematické hledání nových biologicky aktivních struktur.<h4>Nová antibiotika nevzniknou v jediné laboratoři</h4>Organická syntéza dokáže vytvořit molekulu, připravit její analogy a cíleně měnit její strukturu a vlastnosti. Sama o sobě však nestačí. Aby bylo možné posoudit skutečný potenciál nové látky, musí se propojit s mikrobiologií, biologickým testováním, medicinální chemií, farmakologií a dalšími obory.Právě na tomto mezioborovém přístupu stojí také výzkum <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://kovaclab.com/">Kovac Lab</a>, který propojuje syntetickou organickou chemii, medicinální chemii a chemickou biologii. Významnou inspirací jsou přitom přírodní produkty – molekuly s mimořádně rozmanitými chemickými strukturami a biologickými účinky, které mohou představovat výchozí body pro objevování nových léčiv.Moderní organická syntéza umožňuje tyto komplexní molekuly nejen připravit, ale také navrhovat a vytvářet jejich analogy, optimalizovat jejich vlastnosti a hledat efektivnější cesty jejich syntézy. Propojení chemických a enzymatických přístupů pak dále rozšiřuje možnosti, jak se k biologicky aktivním látkám dostat a jak je využít jako potenciální vedoucí struktury při vývoji léčiv nebo jako nástroje ke studiu biologických procesů.V oblasti antibiotik se tak potkávají tři zásadní prvky: příroda jako zdroj inspirace, syntetická chemie jako nástroj pro tvorbu a optimalizaci molekul a biologické a antimikrobiální testování jako cesta k ověření jejich skutečného potenciálu.Právě jejich propojení může otevírat nové možnosti v době, kdy účinnost stávajících antibiotik stále více omezuje rostoucí rezistence. Příroda přitom nabízí obrovské množství chemických řešení, která ještě nemusíme znát nebo plně využívat – a moderní chemie nám dává nástroje, jak je objevovat, upravovat a postupně posouvat směrem k potenciálním novým antibiotikům.

Organická syntéza přírodních látek jako nástroj proti antibiotické rezistenci

Přednáška

Věda a výzkum

Video

Článek

Produkt

Je výzkumné centrum zaměřené na oblast živých věd, pokročilých materiálů a technologií.  Vznikl v roce 2011 na základech šesti významných brněnských univerzit a výzkumných institucí. Od doby jeho nedávného vzniku se daří budovat významné vědecké centrum, a již nyní se řadí mezi špičkové evropské instituce.

CEITEC

Cílem CZEPAR je vytvářet prostor pro diskusi, sdílení informací a mezioborovou spolupráci. Chceme přinášet vědomostní základnu pro státní správu při hledání regulatorního rámce, který umožní účinný boj proti šíření antibiotické rezistence ve společnosti.

CZEPAR - Česká platforma antibiotické rezistence

Společnost Organomation, založená v roce 1959, navrhuje a vyrábí vysoce kvalitní dusíkové koncentrátory a extrakční systémy. Jejich laboratorní přístroje, známé svou inovativností a odolností, se používají po celém světě pro efektivní přípravu vzorků a jsou doprovázeny silnou zákaznickou podporou.

Organomation

Waters waters_connect software pro kvantifikaci

Ovládněte svá data, zrychlete své pracovní postupy a dosáhněte absolutní jistoty v dodržování předpisů díky softwarovému řešení waters_connect for Quantitation.

<h3>Ovládněte svá data</h3>Vyvážení produktivity a přesnosti může často vypadat jako chůze po laně, zejména když se pracovní postupy stávají složitějšími s rozšiřujícími se složenými seznamy. Manuální procesy, nekonzistentní výsledky a obavy o dodržování předpisů - to vše může přispívat ke vzniku překážek, které zpomalují efektivitu vaší laboratoře.Ovládněte svá data, zrychlete své pracovní postupy a dosáhněte absolutní jistoty v dodržování předpisů díky softwarovému řešení waters_connect for Quantitation. Revoluční řešení pro zpracování, revizi a reportování dat, které podporuje dodržování předpisů, převezme kontrolu nad vašimi daty a umožní vám trávit méně času náročnými manuálními procesy a více času rychlým a informovaným rozhodováním, které vám pomůže pokročit ve Vašem bádání.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_waters_connect_for_Quantitation_The_MS_Quan_app_is_integrated_with_the_waters_connect_workflow_and_utility_apps_to_provide_a_seamless_efficient_workflow_for_quantitation_5a8779a387.jpg" alt="Waters: waters_connect pro kvantifikaci: Aplikace MS Quan je integrována s pracovním postupem a aplikacemi waters_connect, aby poskytovala bezproblémový a efektivní pracovní postup pro kvantifikaci." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Waters_waters_connect_for_Quantitation_The_MS_Quan_app_is_integrated_with_the_waters_connect_workflow_and_utility_apps_to_provide_a_seamless_efficient_workflow_for_quantitation_5a8779a387.jpg 234w," sizes="100vw" width="1024" height="682"><h4>Bezkonkurenční výhody pro vaši laboratoř</h4><ul><li>O 50 % rychlejší kontrola dat: Věnujte více času vědeckým úkolům a méně manuálnímu přezkoumávání díky funkci Exception Focused Review.</li><li>Efektivní dávkové zpracování: Bezproblémová správa velkých objemů vzorků</li><li>Bezproblémové reportování výsledků: Na tandemových kvadrupólech <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?manufacturerItems=5&amp;search=xevo">řady Xevo</a></li><li>Snadné používání: Intuitivní rozhraní systému minimalizuje požadavky na zaškolení</li><li>Umožňuje dodržování předpisů: Splňuje průmyslové předpisy, jako je 21 CFR část 11 a normy ISO.</li><li>Integrované pracovní postupy: Zlepšete konektivitu pomocí zjednodušeného systému LIMS a síťového propojení smíšených systémů pro zefektivnění provozu.</li></ul><h4>Doporučené použití</h4>Pro laboratoře provádějící kvantitativní analýzy, které vyžadují efektivní zpracování velkých dávek vzorků, zkrácení doby kontroly dat a dodržování norem shody.<h3>Pokročilá vizualizace</h3>Zjednodušte interpretaci složitých dat pomocí pokročilých vizualizačních nástrojů. Funkce Exception Focused Review, umožňuje nastavit přizpůsobitelné soubory pravidel, rychle rozpoznat trendy a okamžitě identifikovat odlehlé hodnoty, což umožňuje rychlejší rozhodování na základě dat.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_waters_connect_for_Quantitation_Advanced_visualization_4f34501146.jpg" alt="Waters: waters_connect pro kvantifikaci - Pokročilá vizualizace." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Waters_waters_connect_for_Quantitation_Advanced_visualization_4f34501146.jpg 245w," sizes="100vw" width="1460" height="819"><h3>Převezměte kontrolu nad svými daty</h3>Ovládněte svá data s aplikací waters_connect for Quantitation. Dynamické, uživatelsky přívětivé rozhraní, navržené pro zjednodušení laboratorních operací, zajišťuje snadnou navigaci, zatímco zpracování jedním kliknutím si snadno poradí i s největšími sadami dat. Díky centralizovanému přístupu k reportům, metodám a seznamům vzorků prostřednictvím zabezpečené databáze Oracle můžete rychle odhalit kritické poznatky a činit jistá rozhodnutí založená na datech rychleji než kdykoli předtím.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_waters_connect_for_Quantitation_Take_control_of_your_data_96563b6d5a.jpg" alt="Waters: waters_connect pro kvantifikaci: Převezměte kontrolu nad svými daty." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Waters_waters_connect_for_Quantitation_Take_control_of_your_data_96563b6d5a.jpg 234w," sizes="100vw" width="1024" height="682"><h3>Zrychlené analytické pracovní postupy, nulové kompromisy</h3>Analyzujete velké dávky vzorků? Žádný problém. Editor akvizičních metod je automatický nástroj pro optimalizaci a zpracování navržený tak, aby šetřil čas a omezil chyby při přepisu při vytváření akviziční a procesní metody a metody zpracování.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_waters_connect_for_Quantitation_Accelerated_analytical_workflows_zero_compromises_c8ff142bf3.jpg" alt="Waters: waters_connect pro kvantifikaci - Zrychlené analytické pracovní postupy, žádné kompromisy." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Waters_waters_connect_for_Quantitation_Accelerated_analytical_workflows_zero_compromises_c8ff142bf3.jpg 234w," sizes="100vw" width="1024" height="682"><h3>Jistota shody</h3>S pomocí softwaru waters_connect for Quantitation, který umožňuje zajištění shody, můžete s jistotou sladit pracovní postupy LC-MS/MS s globálními předpisy a normami, jako je 21 CFR část 11 a ISO. Zvyšte integritu dat díky robustnímu základu relační databáze Oracle, který poskytuje spolehlivou kontrolu verzí metod, sledovatelnost a komplexní auditní záznamy. Posilte pracovní postupy LC-MS/Ms řízené předpisy spojením integrity dat s produktivitou prostřednictvím datových sítí pro různé systémy a konektivity LIMS.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_waters_connect_for_Quantitation_Reduce_the_burden_of_data_integrity_with_software_that_facilitates_accurate_traceable_and_secure_records_fb809b433f.jpg" alt="Waters: waters_connect pro kvantifikaci: Snižte zátěž spojenou s integritou dat pomocí softwaru, který usnadňuje přesné, sledovatelné a bezpečné záznamy." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Waters_waters_connect_for_Quantitation_Reduce_the_burden_of_data_integrity_with_software_that_facilitates_accurate_traceable_and_secure_records_fb809b433f.jpg 234w," sizes="100vw" width="1024" height="682"><h3>Pokrok v aplikacích pro analýzu PFAS, farmaceutických výrobků a bezpečnosti potravin</h3><h4>Analýza PFAS</h4>Dosáhněte přesnosti a produktivity při <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/library?mainauthorItems=5&amp;search=PFAS">testování PFAS</a> pomocí softwaru navrženého pro snadné použití a dodržování předpisů. waters_connect for Quantitation pomáhá laboratořím splnit přísné regulační požadavky a zároveň snadno spravovat složité matrice vzorků.<h4>Farmaceutická analýza</h4>S jistotou kvantifikujte farmaceutické analyty od objevu až po kontrolu kvality výroby pomocí softwaru waters_connect for Quantitation. Zjednodušte analýzu LC-MS/MS, zvyšte produktivitu a zajistěte integritu dat díky analytickým pracovním postupům s podporou shody s předpisy, které generují výsledky podporující vývoj léčiv, předkládání žádostí regulačním orgánům a audity.<h4>Bezpečnost potravin a životního prostředí</h4>Zefektivněte testování multireziduálních <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/library?mainauthorItems=5&amp;search=Pesticides">pesticidů</a>, <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/library?mainauthorItems=5&amp;search=mycotoxin">mykotoxinů</a> a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/library?mainauthorItems=5&amp;search=veterinary+drugs">veterinárních léčiv</a> pomocí efektivních pracovních postupů, které maximalizují výkonnost bez snížení kvality. Analyzujte složité vzorky rychle a s jistotou<h3>Vaše škálovatelné řešení podporující dodržování předpisů</h3>Řešení waters_connect for Quantitation, postavené na informační platformě waters_connect, umožňuje analytickým laboratořím dosahovat rychlejších a spolehlivějších výsledků. Jeho škálovatelná a bezpečná konstrukce podporuje bezproblémovou integraci se stávajícím softwarem společnosti Waters a partnerskými řešeními, což zajišťuje připravenost na budoucnost.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_waters_connect_for_Quantitation_Core_capabilities_of_the_waters_connect_Platform_22c5991e08.jpg" alt="Waters: waters_connect pro kvantifikaci - Základní možnosti platformy waters_connect." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Waters_waters_connect_for_Quantitation_Core_capabilities_of_the_waters_connect_Platform_22c5991e08.jpg 153w," sizes="100vw" width="1059" height="1082">

Waters Empower Chromatography Data System (CDS)

Chromatografický software Empower může růst tak, aby vyhovoval měnícím se potřebám Vaší laboratoře – je snadno škálovatelný z jedné pracovní stanice do celopodnikové sítě.

Software Empower je náš vlajkový chromatografický data systém (CDS) se kterým budete analyzovat vzorky a získavat smysluplné výsledky snadněji než kdy dříve. Minimalizujete prostoje kvůli potřebným školením, přepracováním pracovních postupů nebo nutnosti pořizování dalšího softwaru pro ovládání dalších instrumentů nebo pokročilých chromatografických technik.
Náš všestranný, snadno použitelný chromatografický software zvýší Vaši produktivitu a také:
<ul>
<li>Minimalizuje náklady na školení a úpravy pomocí intuitivního a konfigurovatelného uživatelského rozhraní</li>
<li>Má vestavěnou relační databází ORACLE</li>
<li>Je k dispozici v uspořádání Personal, Workgroup a Enterprise</li>
<li>Eliminuje potřebu ručního vedení záznamů</li>
<li>Je plně ve shodě s požadavky na integritu dat a 21 CFR Part 11</li>
<li>Automaticky počítá parametry podle EP, USP a JP</li>
<li>Posune Vaše možnosti správy, ukladání a vyhledávání dat</li>
<li>Disponuje nástroji pro vývoj metod nebo správu validací</li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Moznosti_a_duvera_ve_Vase_vysledky_s_chromatografikym_software_Waters_Empower_e076379a12/Moznosti-a-duvera-ve-Vase-vysledky-s-chromatografikym-software-Waters-Empower.webp" alt="Waters: Možnosti a důvěra ve Vaše výsledky s chromatografickým software Waters Empower"/>
<h3>Zjednodušte měření, zpracování a reportování dat</h3>
Empower je navržený pro datově zabezpečené a regulované laboratorní prostředí a Vaší laboratoři pomůže pracovat efektivněji a bezpečněji:
<ul>
<li>Ukládá a získává chromatografická data pomocí vestavěné relační databáze a zjednodušeje vyhledávání dat podle kritérií, která jsou pro vás smysluplná</li>
<li>Šetřete čas, omezte ruční integraci a získejte přesnější integrace píků s algoritmem Empower ApexTrack™</li>
<li>Snadno ovládá systémy <a href="https://lcms.cz/products?category=37&amp;distributorItems=50&amp;manufacturerItems=5">Waters ACQUITY UPLC</a> a Alliance HPLC, stejně jako systémy HPLC, GC, PDA a MS od jiných výrobců</li>
<li>Rozšíření z jediné pracovní stanice na celopodnikový systém je se škálovatelnou modulární architekturou Empower, která zapadá do nejmodernější a bezpečné podnikové architektury, velice snadné</li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_Zakladni_sitove_reseni_Waters_Empower_pro_mene_nez_10_uzivatelu_85451f79a1/Waters-Zakladni-sitove-reseni-Waters-Empower-pro-mene-nez-10-uzivatelu.webp" alt="Waters: Základní síťové řešení Waters Empower pro méně než 10 uživatelů"/>
<h3>Možnosti, které odpovídají Vašemu způsobu práce</h3>
Se softwarem Empower Software můžete snadno provádět více úkolů najednou – nepotřebujete více softwarových nástrojů. Tři intuitivní rozhraní pomáhají komukoli ve Vaší laboratoři pracovat efektivněji. Vyberte si možnost, která odpovídá vašemu způsobu práce a můžete začít pracovat jen několika kliknutími:
<ul>
<li>Naměřte data a ovládejte různé přístroje, včetně HPLC, UPLC a GC</li>
<li>Používejte pokročilé detekční techniky, jako jsou MS a PDA bez potřeby outsourcingu třetí stranou</li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_Enterprise_sitove_reseni_Waters_Empower_pro_vice_nez_10_uzivatelu_de220ce56e/Waters-Enterprise-sitove-reseni-Waters-Empower-pro-vice-nez-10-uzivatelu.webp" alt="Waters: Enterprise síťové řešení Waters Empower pro více než 10 uživatelů"/>
Další informace naleznete na webu <a href="https://www.waters.com/waters/en_US/Empower-Chromatography-Data-System/nav.htm?cid=513188&amp;locale=en_US">Waters Corporation</a>.

Waters MassLynx software pro hmotnostní spektrometrii

Software Waters MassLynx doplní Váš MS systém svým intuitivním rozhraním, inteligentním ovládáním a softwarovými funkcemi zaměřenými na Vaše analýzy a vzorky.

Měřit, analyzovat, spravovat a sdílet informace o hmotnostní spektrometrii.
Software MassLynx zvyšuje rychlost, s jakou můžete svá data převádět na cenné výsledky. Poskytne Vám základní platformu pro získávání, analýzu, správu a sdílení informací získáných z Vašho hmotnostního spektrometru.
MassLynx inteligentně řídí jakýkoli hmotnostní spektrometr Waters, od samotných vzorků a mobilních fází až po hmotnostní spektrometr a další detektory. MassLynx Software pro Vás naměří údaje o nominální hmotě, přesné hmotě, MS/MS a MS/MS s přesnou hmotou.
<blockquote>
<ul>
<li>software pro oblast hmotnostní spektrometrie</li>
<li>určen pro nízkorozlišující i vysokorozlišující MS</li>
<li>jednoduchý software pro komplexní data</li>
<li>k dispozici celá řada doplňků</li>
</ul>
</blockquote>
Vzorový seznam MassLynx je jádrem systému. Udržuje a konsoliduje data o všech vašich vzorcích. Můžete také zahájit jakékoli činnosti související s vaším vzorkem ze seznamu vzorků. Tento &quot;vzorek centrický&quot; přístup zjednodušuje interakci s vaším LC/MS nebo GC/MS systémem, získanými daty a zpracovanými výsledky.
<h3>Zpracovávejte data specifická pro danou aplikaci</h3>
MassLynx Software obsahuje obecné a specializované aplikační moduly, které poskytují informace pro vaše specifické MS analýzy a data. Se sosftwarem MassLynx je standardně dodáván:
<ul>
<li>OpenLynx pro kvalitativní screening a identifikaci</li>
</ul>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_Mass_Lynx_software_pro_hmotnostni_spektrometrii_Metabo_Lynx_bdd1fa327b/Waters-MassLynx-software-pro-hmotnostni-spektrometrii-MetaboLynx.webp" alt="Waters Corporation: MassLynx software pro hmotnostní spektrometrii: MetaboLynx"/>
<h5>Volitelné aplikační moduly</h5>
<ul>
<li>Cílená kvantitativní analýza</li>
<li>Purifikace řízené na základě MS dat</li>
<li>Identifikace metabolitů</li>
<li>Dekonvoluce komplexních chromatogramů</li>
<li>Metabonomika a metabolomika</li>
<li>Identifikace a charakterizace proteinů</li>
</ul>
<h3>MassLynx plně podporuje celou škálů iontových zdrojů</h3>
<ul>
<li>ESI</li>
<li>APcI</li>
<li>ESCi</li>
<li>Multi-Mode Ionization</li>
<li>IonSABRE</li>
<li>Photoionization (PI)</li>
<li>LockSpray</li>
<li>NanoLockSpray</li>
<li>MUX-technology</li>
<li>GC</li>
<li>Direct probes</li>
<li>MALDI MS</li>
</ul>

Produkty zaměřené na Software od Waters - strana 1

Mohlo by Vás zajímat

Organická syntéza přírodních látek jako nástroj proti antibiotické rezistenci

Chlazený SpeedVac SRF110 vs. CentriVap: Proč je kapacita zpracování vzorků pro laboratoře pracující s peptidy a proteiny důležitější než kdy dříve

Co přitahuje molekuly? Nová generace nástroje z CEITEC zviditelňuje síly mezi atomy