Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Liver Metabolome Using the DPiMS-8060

Aplikace | 2019 | ShimadzuInstrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ, DART
Zaměření
Klinická analýza
Výrobce
Shimadzu

Význam tématu


Analýza metabolomu poskytuje klíčové informace o biochemickém stavu tkání bez rozsáhlé přípravy vzorků. Přímá ionizace pomocí PESI (Probe Electrospray Ionization) zjednodušuje workflow, omezuje ztráty látek a minimalizuje analytické artefakty vzniklé při extrakci.

Cíle a přehled studie


Cílem bylo vyvinout a ověřit metodiku pro přímou analýzu metabolomů myší jater pomocí přístroje DPiMS-8060 (PESI + tandemová hmotnostní spektrometrie). Studie se zaměřila na validaci metody na standardních metabolitech a následnou aplikaci na model akutního poškození jater indukovaného CCl4.

Použitá metodika a instrumentace


Pro stanovení 26 klíčových metabolitů (aminokyseliny, organické kyseliny, sacharidy) byly připraveny standardní roztoky 50% ethanolu, 10 µl vzorku roztoku nanesených na destičku pro kapalné vzorky. Pro analýzu jaterních sekcí (cca 3 mm²) z kontrolních a CCl4 modelových myší byly vzorky umístěny do destiček pro pevné vzorky bez dalšího zpracování. Optimální MRM přechody a kolizní energie byly nastaveny pro každý metabolit.

  • Hmotnostní spektrometr: Shimadzu DPiMS-8060
  • Ionizační metoda: PESI
  • MRM přechody pro 26 metabolitů (např. 3-hydroxybutyrát 103.1→59.0, glukóza 179.1→59.2)
  • PCA pro multivariační analýzu výsledků

Hlavní výsledky a diskuse


Multivariační analýza (PCA) jasně odlišila vzorky zdravých a CCl4 poškozených jater podél první hlavní složky. Nejvýraznějším markerem byla snížená koncentrace taurinu v modelové skupině (p<0,001, Welchův test). Pozorovaná deplece taurinu korelovala s nárůstem jaterních enzymů ALT (r = –0,975) a AST (r = –0,785), což potvrzuje souvislost s oxidačním stresem vyvolaným trichloromethylovými radikály.

Přínosy a praktické využití metody


Díky absenci komplikované extrakce a chromatografie lze metodou rychle detekovat změny klíčových metabolitů přímo z tkání. Přímá analýza přináší vyšší reprodukovatelnost a snižuje riziko ztráty látek citlivých na degradaci. Metoda je vhodná pro farmakologický výzkum, toxikologii a screening biomarkerů.

Budoucí trendy a možnosti využití


Rozšíření počtu analyzovaných sloučenin, integrace s obrazováním vzorků a vývoj kvantitativních protokolů umožní komplexnější mapování metabolomů. Kombinace PESI s vysokorozlišovacími spektrometry a automatizovanými vzorkovači zvýší throughput a citlivost.

Závěr


Byla úspěšně etablována metoda přímé analýzy myšího jaterního metabolomu pomocí DPiMS-8060. Metoda prokázala schopnost detekovat významné biochemické změny bez časově náročného předúpravy.

Reference


Zaitsu, K.; Hayashi, Y.; Murata, T., et al. Anal. Chem. 2016, 88, 3556–3561.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Liver Metabolome Using the DPiMS-8060
Direct Probe Ionization Mass Spectrometer - Application Notebook
Shimadzu Kit for Direct Probe Ionization Mass Spectrometer - DPiMS-8060
Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Brain Metabolome Using the DPiMS-8060