LC/MS, LC/MS/MS, LC/QTRAP
ZaměřeníLipidomika
VýrobceSCIEX
Význam tématu
Lipidoví mediátoři patří mezi klíčové bioaktivní molekuly regulující zánětlivé a rezoluce zánětu procesy v organismu. Patří sem eikosanoidy odvozené z kyseliny arachidonové a specialisté pro-resolvující mediátory (SPM) získané z EPA a DHA. Porozumění jejich biosyntéze, signalizaci a přesná separace izobarických i epimerních forem je zásadní pro výzkum řady zánětlivých onemocnění a vyvíjení nových terapeutických strategií.
Cíle a přehled studie
Tento whitepaper popisuje vývoj cílené multiplexní LC-MS/MS metody pro kvantifikaci a kvalitativní potvrdění 88 lipidových mediátorů a jejich 16 deuteriovaných interních standardů v jediném 20minutovém běhu. Cílem je dosáhnout vysoké citlivosti, specificity a průchodnosti (throughput) analýzy v biomedicínských vzorcích.
Použitá metodika a instrumentace
- Chromatografie: ExionLC AD s fází Kinetex 2,6 µm Polar C18 (100 × 3,0 mm), gradient metanol/0,1 % kyseliny mravenčí, průtok 500 µL/min, doba separace 20,5 min.
- Hmotnostní spektrometrie: SCIEX QTRAP 6500+ s IonDrive Turbo V ESI, rychlé přepínání polarity (pozitivní/negativní ionty).
- Režim akvizice: Multiple Reaction Monitoring (MRM) se Scheduled MRM™ Algorithm Pro pro kvantifikaci; MRM spouštěné Enhanced Product Ion (EPI) skeny pro kvalitativní potvrzení.
- Software: MultiQuant™ pro výpočet kalibračních křivek, přesnost, opakovatelnost (CV) a lineární závislosti.
Hlavní výsledky a diskuse
- Výborná chromatografická separace izobarických i epimerních lipidů (např. PGE2/PGD2, LXA4/15-epi-LXA4, RvD1/17-epi-RvD1).
- Citlivost LLOQ v rozmezí 0,05–1 ng/mL, opakovatelnost CV < 30 %, linearita r2 > 0,997 pro reprezentativní mediátory.
- Rychlé přepínání polarity umožňuje simultánní detekci většiny lipidů v jediné injekci, čímž se zdvojnásobuje průchodnost analýz.
- MRM-EPI workflow přináší kvalitativní potvrzení identity i nízkokoncentrovaných látek díky bohatým fragmentačním spektrům.
Přínosy a praktické využití metody
Vyvinutá LC-MS/MS metoda umožňuje komplexní sledování panelu pro- a pro-resolvujících lipidových mediátorů v klinických i experimentálních vzorcích. Poskytuje robustní nástroj pro:
- Studium zánětlivých drah a rezoluce zánětu.
- Vyhodnocení farmakologických účinků inhibitorů nebo aktivátorů lipoxygenáz a cyklooxygenáz.
- Metabolomické a lipidomické přístupy v translaci biomedicínských dat.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření panelu analyzovaných mediátorů a interních standardů.
- Integrace s vysokoprocesním automatizovaným vzorkovým přípravám.
- Využití umělé inteligence a strojového učení pro interpretaci komplexních lipidomických dat.
- Personalizovaná medicína založená na lipidových profilech pacientů.
Závěr
Popsaná multiplexní LC-MS/MS metoda na platformě QTRAP 6500+ představuje robustní, citlivý a vysokopropustný přístup k cílenému profilování lipidových mediátorů. Umožňuje spolehlivou separaci izobarických a epimerních látek, kvantitativní i kvalitativní potvrzení identity a splňuje nároky moderního lipidomického výzkumu.
Reference
1. Funk CD. Prostaglandins and leukotrienes: advances in eicosanoid biology. Science. 2001;294:1871–1875.
2. Serhan CN, Levy BD. Resolvins in inflammation: emergence of the pro-resolving superfamily of mediators. J Clin Invest. 2018;128:2657–2669.
3. Ekroos K. Lipidomics; Technologies and Applications. Wiley-VCH; 2012.
4. Harizi H, Corcuff JB, Gualde N. Arachidonic Acid derived eicosanoids: roles in biology and immunopathology. Trends Mol Med. 2008;14:461–469.
5. Benjamim CF, Canetti C, Cunha FQ, Kunkel SL, Peters-Golden M. Opposing and hierarchical roles of leukotrienes in local innate immune versus vascular responses in a model of sepsis. J Immunol. 2005;174:1616–1620.
6. Harkewicz R, Dennis EA. Applications of mass spectrometry to lipids and membranes. Annu Rev Biochem. 2011;80:301–325.
7. Dennis EA, Norris PC. Eicosanoid storm in infection and inflammation. Nat Rev Immunol. 2015;15:511–523.
8. SCIEX Technical note RUO-MKT-02-8539-A. The Scheduled MRM™ Algorithm Pro.
9. SCIEX community method for lipid mediator quantitation on QTRAP and triple quadrupole systems.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.