Peptide sequencing using Continuity miniature mass spectrometer

Aplikace | 2017 | BaySpec, Inc. Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS
Zaměření
Proteomika
Výrobce
BaySpec, Inc.

Význam tématu


Peptidové sekvenování je klíčové pro identifikaci a charakterizaci biologicky aktivních peptidů a proteinů. Rychlé a přenosné nástroje pro MSn analýzu umožňují provádět vysoce kvalitní sekvenování přímo v terénu, což zkracuje dobu analýzy a zjednodušuje logistiku vzorků.

Cíle a přehled studie


Studie demonstruje schopnosti přenosného BaySpec ContinuityTM miniaturizovaného hmotnostního spektrometru pro sekvenování peptidů v rámci standardní směsi. Cílem byla ukázka úplné MS1 a MS2 analýzy, včetně izolace vybraných iontů metodou SWIFT a následné fragmentace kolizně indukovaným disociačním (CID) dělením.

Použitá metodika a instrumentace


  • Přístroj: BaySpec ContinuityTM přenosný hmotnostní spektrometr (lineární iontový trap, kontinuita atmosférického tlakového sběru vzorků s difuzním čerpadlem).
  • Ionizace: elektrospray bez další separace.
  • MS1 režim: plný scan v rozsahu 110–950 amu.
  • SWIFT izolace: výběr dvojitě nabitého iontu peptidu DRVYIHPF.
  • MS2 režim: CID fragmentace a získání a-, b- a y-iontových spekter.
  • Připrava vzorku: standardní peptidová směs H2016 rozpuštěna v 50:50 metanol voda s 0,5 % octovou kyselinou, přímá infúze.

Hlavní výsledky a diskuse


Plný MS1 záznam odhalil série peptidů s různými m/z hodnotami, včetně hlavního signálu 524,2 odpovídajícího DRVYIHPF2+. SWIFT izolace umožnila selektivní zachycení tohoto iontu, což vedlo k čistému MS2 spektru s dobře rozlišenými a-, b- a y-ionty. Peptidová sekvence byla plně rekonstruována bez interferencí od vedlejších složek.

Přínosy a praktické využití metody


Ultralehký přístroj (22 kg) s bateriovým napájením nabízí:
  • Možnost rychlého nasazení v terénu a v nepřímých laboratořích.
  • Absenci potřeby chromatografické separace díky přímé infúzi.
  • Široký hmotnostní rozsah a vysokou citlivost pro trace analýzu.
  • Univerzální využití pro on-site proteomické studie, QA/QC i forenzní chemii.

Budoucí trendy a možnosti využití


Očekává se další miniaturizace MSn systémů s vyšším rozlišením a rychlostí analýzy. Integrace s mobilními jednotkami pro automatizované odběry vzorků a cloudovou databázovou platformou umožní on-line interpretaci spekter. Rozvoj rychlých SWIFT pulzních technik a nových zdrojů ionizace rozšíří škálu detekovaných biomolekul.

Závěr


BaySpec ContinuityTM poskytuje spolehlivou a lidsky dostupnou platformu pro peptidové sekvenování v terénu. Kombinace SWIFT izolace, CID fragmentace a přímé infúze umožňuje rychlé a kvalitní určení sekvencí bez složitých příprav.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Bruker scimaX MRMS - The Applications Book
Comprehensive identification and label-free quantitation of host cell protein contaminants using BioPharma Finder 4.1 software
Thermo Scientific Proteome Discoverer software
Thermo Scientific Proteome Discoverer software
2022|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
Advanced Native and Top-Down MSⁿ Workflows on the timsOmni Platform Enable Deep Structural Analysis of Membrane Protein Complexes