LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
ZaměřeníLipidomika
VýrobceShimadzu
Význam tématu
Lipidy představují základní stavební kameny buněčných membrán, zdroje energie a účastníky signálních drah. Poloha dvojných vazeb v mastných kyselinách výrazně ovlivňuje jejich fyzikálně-chemické vlastnosti, interakce s enzymy i biologickou aktivitu. Přesné určení těchto vazeb je proto zásadní pro lepší porozumění mechanismům udržení lipidové homeostázy a jejich změn v patologických stavech.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem prezentované studie je demonstrovat kombinaci sekundárních fragmentačních režimů CID a OAD s rychlým přepínáním polarity v jednom LC-MS měření. Tato strategie umožňuje komplexní strukturní charakterizaci fosfatidylcholinů (PC) v extraktu jater myši, včetně stanovení délek řetězců, pozic lipidových izomerů a přesných poloh C=C dvojných vazeb.
Použitá metodika a instrumentace
Pro extrakci lipidů byly homogenizovány játra myši, následovalo vysrážení v metanolu, extrakce chloroformem a separace vodné fáze centrifugací. Analýza proběhla na systému Nexera X3 spojeném s LCMS-9050 vybaveným OAD RADICAL SOURCE I. Klíčové parametry:
- Kolona: Shim-pack Scepter Claris 100×2,1 mm, částice 1,9 µm
- Mobilní fáze A: 20 mM amonná forma, B: ACN/IPA (1:1)
- Průtok 0,3 mL/min, teplota kolony 40 °C
- Polarity switching: pozitivní/negativní ionizace, CE 25 V (pozitivně), 35 V (negativně)
- Rozsah m/z 100–1000, doba měření 20 min
Hlavní výsledky a diskuse
Ve stejném chromatografickém běhu byla detekována PC 36:4 jako [M+H]+ (m/z 782,5695) a [M+HCOO]− (m/z 826,5604). Negativní režim CID prokázal složení mastných kyselin (C18:3, C18:2, C18:1 u píku A; C20:4, C16:0 u píku B) a uspořádání sn-pozic. Pozitivní OAD generoval neutral loss fragmenty specifické pro polohu C=C, které vyjasnily, že směs obsahuje izomery PC 18:2/18:2, PC 18:3/18:1 a PC 16:0/20:4. Tyto informační toky se vzájemně doplnily bez potřeby chemického značení či samostatných analýz.
Přínosy a praktické využití metody
- Jeden LC-MS běh pokrývá pozitivní i negativní ionizaci.
- Simultánní CID/OAD odhaluje jak mastné kyseliny, tak polohu C=C.
- Bez nutnosti prederivátování vzorku, vyšší průchodnost laboratoře.
- Vhodné pro neprojektivní lipidomické studie a biomarkerový výzkum.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření aplikace OAD na další třídy lipidů, vysoce propustné lipidomiky v klinickém prostředí a integrace s pokročilou výpočetní analýzou pro automatické rozpoznávání strukturních izomerů. Dále je perspektivní kombinace s ion mobility spektrometrií za účelem separace isobarických forem.
Závěr
Popsaná metoda efektivně kombinuje rychlé přepínání polarity s duálními fragmentačními režimy CID/OAD. Jednotlivé fragmenty poskytují kompletní informace o hlavičce fosfatidylcholinu, složení mastných kyselin i polohách dvojných vazeb v jediném LC-MS běhu.
Reference
- H. Uchino, H. Tsugawa, H. Takahashi, M. Arita, Computational mass spectrometry accelerates C=C position-resolved untargeted lipidomics using oxygen attachment dissociation, Communications Chemistry, 5, 162 (2022)
- K. Ekroos et al., Charting molecular composition of phosphatidylcholines by fatty acid scanning and ion trap MS3 fragmentation, Journal of Lipid Research, 44, 2181 (2003)
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.