MS Imaging, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
ZaměřeníProteomika
VýrobceWaters
Význam tématu
Multiplexní zobrazování proteinů v tkáni pomocí MALDI-IHC nabízí revoluční přístup ke studiu prostorové distribuce proteinů bez nutnosti jejich trávení či použití tradiční imunofluorescence s omezeným počtem markerů. Díky fotookyvatelným peptidovým štítkům navázaným na protilátky lze sledovat více než 40 cílových proteinů v rámci jedné tkáňové sekce s vysokou přesností a minimálním pozadím.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem prezentované práce bylo ověřit kompatibilitu a výkonnost metody MALDI-IHC na spektrometru SELECT SERIES MRT s MALDI zdrojem. Autoři demonstrovali schopnost zachytit prostorové rozložení proteinových markerů ve FFPE sekcích lidské mandlí a renálního karcinomu pomocí multiplexního zobrazování.
Použitá metodika a instrumentace
Popis vzorků:
- FFPE sekce lidské mandle (kontrolní vzorek) a ledviny s karcinomem ledvin (ccRCC, ISUP grade 3).
- Příprava dle protokolu AmberGen MALDI HiPLEX-IHC Miralys Imaging Workflow.
Příprava vzorků:
- Odparafínování, rehydratace, antigen-retrieval a blokace.
- Imunobarvení pomocí šesti protilátek (CD3ε, CD68, VIM, kolagen-1A1, PanCK, Ki67 pro mandle; VIM, Actin-aSM, PanCK, Ki67 pro ledvinu).
- UV osvětlení pro uvolnění peptidových štítků a nanesení CHCA matrix pomocí HTX M5 sprayeru.
Instrumentace:
- Spectrometr SELECT SERIES MRT s multi-reflektujícím Time-of-Flight analyzátorem.
- MALDI zdroj, pozitivní ionizační režim, m/z 50–2400, fixní kvadrupól 1000 Da.
- Laser 2 kHz, scan rychlost 10 s/s, rozlišení >200 000 FWHM, masová přesnost >500 ppb.
Hlavní výsledky a diskuse
Obrazová data při rozlišení 50 µm pixel size ukázala věrné rozložení markerů v mandli i karcinomu ledvin, konzistentní s literaturou a fluorescenčními metodami. V experimentu s 20 µm pixel size bylo možné rozlišit signál Ki67 na úrovni jednotlivých pixelů a detailní architekturu cév pomocí Actin-aSM. Nízké pozadí a vysoké prostorové rozlišení podtrhují schopnost MRT analyzátoru eliminovat překryvy signálů.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda MALDI-IHC na MRT spektrometru umožňuje:
- Simultánní detekci desítek proteinů ve tkáni.
- Vysoké prostorové rozlišení (<20 µm) s nízkým šumem.
- Zachování in situ lokalizace intactních proteinů bez nutnosti enzymatické trávení.
- Potenciál pro aplikace v onkologii, neurovědách a vývoji nových biomarkerů.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření počtu dostupných peptidových štítků a markerů pro různé biologické dráhy. Integrace s dalšími omickými technologiemi (metabolomika, lipidomika) může vést k komplexnímu prostorově-respektujícímu multi-OMICS přístupu. Automatizace přípravy vzorků a analýzy dat pohltí širší nasazení v klinických laboratořích.
Závěr
Studie potvrdila, že multiplexní MALDI-IHC na SELECT SERIES MRT MALDI spektrometru nabízí vysoce výkonný nástroj pro detailní mapování proteinů v tkáni. Vysoké rozlišení, přesnost a schopnost detekovat desítky markerů otevírají nové možnosti pro výzkum a diagnostiku.
Reference
1. G. Yagnik et al ; J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2021, 32, 4, 977–988
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.