Dissecting the Mechanism of Antifungal Drug Action by GC/Q-TOF

Postery | 2012 | Agilent TechnologiesInstrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, GC/Q-TOF
Zaměření
Metabolomika, Klinická analýza
Výrobce
Agilent Technologies

Význam tématu


Metabolické profilování sterolů u kvasinek poskytuje detailní pohled na mechanismy účinku antifungálních látek. Precizní stanovení koncentrací meziproduktů v biosyntetické dráze ergosterolu umožňuje odhalit specifické enzymové cíle nových léčiv. Tento přístup spojuje výhody cílené a necílené analýzy při vysokém rozlišení hmotnostní spektrometrie, čímž se zvyšuje citlivost a specifičnost detekce.

Cíle a přehled studie / článku


Studie si klade za cíl validovat GC/Q-TOF platformu pro sledování změn metabolitů sterolů v Saccharomyces cerevisiae po ošetření různými antifungálními látkami. Jako modelové sloučeniny byly použity známé inhibitory terbinafinu a flukonazolu, dále pak potenciální nové sloučeniny (NCE 1181-0519) a přírodní terpen Totarol. Studie kombinuje cílené měření klíčových meziproduktů dráhy ergosterolu s necílenou analýzou neznámých akumulovaných sterolů.

Použitá instrumentace


  • GC: Agilent 7890 s kolonkou HP-5 MS UI (30 m, 0,25 mm ID, film 0,25 µm)
  • MS: Agilent 7200 Series Q-TOF v režimu EI, rozsah 50–600 m/z
  • Software: MassHunter Quantitative a Unknowns Analysis, Mass Profiler Professional, NIST11 knihovna, Molecular Structure Correlator

Použitá metodika


Vzorky divokého kmenů kvasinek byly ošetřeny koncentracemi inhibitorů s inhibicí růstu ~10 %. Lipidy extrahovány Folchovou metodou, derivatizovány oximation hydroxyaminy a silylací MSTFA+1 % TMCS. GC/Q-TOF měření probíhalo v plném skenu EI a cíleném MS/MS na potvrzení struktur nových metabolitů. Data byly zpracována dekonvolucí chromatogramů, kvantifikací a multivariační analýzou pro identifikaci významně změněných sloučenin.

Hlavní výsledky a diskuse


Targeted přístup potvrdil akumulaci squalenu po léčbě terbinafinem a lanosterolu po flukonazolu. Necílená analýza odhalila nadbytek 14α-methylových sterolů, které běžně v kvasinkách nejsou detekovány. U NCE 1181-0519 byl významně akumulován 4,4-dimethyl-8,24-cholestadienol a potlačeny následující meziprodukty, což ukazuje na specifickou inhibici enzymu Erg25. Totarol vedl k hromadění 4α-carboxy-4β-methyl-5α-cholesta-8,24-dienolu, indikujícímu cíl Erg26. Strukturální potvzení metabolitů proběhlo pomocí MS/MS produkt-ion spectrum a MSC nástroje.

Přínosy a praktické využití metody


  • Rychlá identifikace cílových enzymů v dráze ergosterolu
  • Možnost screeningu nových chemických i přírodních látek
  • Vysoká citlivost a rozlišení umožňující odhalit vzácné a biologicky nestabilní meziprodukty

Budoucí trendy a možnosti využití


Integrace metabolického profilování s genetickými screeny (HIP) může dále zpřesnit mapování mechanismů účinku. Další vývoj směřuje k vyššímu rozlišení iontových reakcí, kvantitativnímu zobrazovacímu MS a automatizované interpretaci dat pomocí umělé inteligence. Rozšíření analýzy na další patogenní kvasinky a plísně otevírá nové cíle pro antifungální terapii.

Závěr


GC/Q-TOF metabolické profilování sterolů v kvasinkách prokázalo schopnost rychle a spolehlivě určit enzymové cíle antifungálních látek. Kombinace cíleného a necíleného přístupu spolu s pokročilou datovou analýzou poskytuje komplexní pohled na změny v biosyntéze ergosterolu a podporuje vývoj nových terapeutik.

Reference


Folch J., Lees M., Stanley G.H.S. J Biol Chem, 1957, 226, 497.
Aronova S. et al., ASMS 2012, Poster Th602.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Elucidation of Antifungal Drug Action by High Resolution GC/MS
Metabolic Profiling of Yeast Sterols Using the Agilent 7200 Series GC/Q-TOF System
Proteomics in Multi-omics Workflows Using Yeast as a Model System
Agilent 7200B Series GC/Q-TOF
Agilent 7200B Series GC/Q-TOF
2014|Agilent Technologies|Brožury a specifikace