Metabolomics: Differentiating sugar phosphate isomers using high resolution mass spectrometry coupled with MSn, collision induced dissociation, and ultraviolet photodissociation

Postery | 2022 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Zaměření
Výrobce
Thermo Fisher Scientific

Význam tématu


Sacharidové fosfáty jsou zásadní metabolity, které se podílejí na energetickém metabolismu a biosyntéze makromolekul. Strukturální podobnost izomerů omezuje možnost jejich rozlišení tradiční chromatografií a bez specifických fragmentačních postupů nelze jednoznačně určit přítomné sloučeniny.

Cíle a přehled studie


Cílem práce bylo stanovit diagnostické fragmenty pro šest isomerů sacharidových fosfátů pomocí pokročilých fragmentačních technik na Orbitrap IQ-X Tribrid hmotnostním spektrometru. Zkoumány byly jednotlivé standardy i jejich směs ve složité matrici.

Použitá metodika a instrumentace


  • Vzorky: glukosa-1-fosfát, galaktosa-1-fosfát, glukosa-6-fosfát, galaktosa-6-fosfát, manosa-6-fosfát, fruktosa-6-fosfát připravené v roztoku acetonitril-voda a ve směsi v plasmě.
  • LC podmínky: Vanquish Horizon se ZIC-pHILIC kolonkou, gradient 80–20 % acetonitrilu v 20 minutách.
  • MS podmínky: Orbitrap IQ-X Tribrid, pozitivní ionizační režim, DDA MSn, HCD, CID a UVPD fragmentace.
  • Data zpracování: Thermo Freestyle a Mass Frontier pro predikci fragmentů.

Hlavní výsledky a diskuse


  • Všechny izomery vykázaly alespoň jeden unikátní fragment v rámci retenčního času.
  • Čtyři izomery s významným chromatografickým překryvem bylo možné rozlišit na základě diagnostických fragmentů v HCD, CID a UVPD spektru.
  • UVPD umožnila detekci specifických fragmentů pro protonované i sodíkové adukty glukosa-6-fosfátu a galaktosa-6-fosfátu.
  • Test ve složité plasmové matrici prokázal vysokou citlivost iontové pasti při sledování diagnostických fragmentů.

Přínosy a praktické využití metody


  • Metoda poskytuje rychlé a jednoznačné rozlišení izomerů bez nutnosti další komplexní chromatografie.
  • Vysoká citlivost a selektivita umožňuje analýzu ve složitých biologických vzorcích.
  • Přístup lze využít v metabolomice, farmakokinetice a kvalitativní kontrole v potravinářském či farmaceutickém průmyslu.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Integrace s iontovou mobilitou pro další rozlišení izomerů.
  • Automatizované algoritmy pro identifikaci fragmentů v reálném čase.
  • Rozšíření metodiky na další třídy metabolitů a biomarkerů.
  • Využití v klinických studiích a personalizované medicíně.

Závěr


Kombinace HCD, CID, MSn a UVPD na Orbitrap IQ-X Tribrid spektrometru umožňuje identifikaci diagnostických fragmentů pro strukturálně podobné sacharidové fosfáty. Tento přístup přináší spolehlivou diferenciaci izomerů i v komplexních vzorcích.

Reference


Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Differentiating Isomers using High Resolution Mass Spectrometry Coupled with MSn, Collision Induced Dissociation, and Ultraviolet Photodissociation
Thermo Scientific Orbitrap IQ-X Tribrid mass spectrometer
Thermo Scientific Orbitrap IQ-X Tribrid mass spectrometer
2021|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
Increased confidence in drug metabolite identification through intelligent data acquisition strategies and multiple fragmentation techniques on the Orbitrap Tribrid MS platform
Metabolomics: Intelligence Driven Metabolomics Workflows: Hardware and Software Innovations for Improved Quantification and Annotation