Agilent MassHunter METLIN Metabolite PCD/PCDL - Quick Start Guide

Význam tématu

Databáze METLIN PCD/PCDL představuje rozsáhlé a důvěryhodné zdroje přesných hmotností metabolitů, lipidů a teoretických peptidů s predefinovanými i experimentálně odvozenými daty o retenčních časech a fragmentačních spektrech. V praxi umožňuje rychlou a spolehlivou identifikaci složitých vzorků v oblasti metabolomiky, potravinářské, biofarmaceutické a environmentální analýzy.

Cíle a přehled dokumentu

Tento Quick Start Guide popisuje instalaci, konfiguraci a základní pracovní postupy při využití Agilent MassHunter METLIN Metabolite PCD/PCDL v prostředí LC/MS. Zahrnuje přehled obsahu sady, kroky instalace softwaru, správu databáze a knihovny, postupy vyhledávání sloučenin a podmínky chromatografického rozdělení pro pozitivní i negativní iontový režim.

Použitá metodika a instrumentace

• Kapalinová chromatografie: Agilent 1260 SL Binary Pump (1312B), Degasser (G1379B), Autosampler (G1367C) s termostatem (G1330B), Column Compartment (G1316C)
• Kolony: Zorbax SB-Aq 1.8 µm 2.1×50 mm a guard Zorbax-SB-C8 2.1×30 mm 3.5 µm
• Kapilární vedení pro minimalizaci mrtvého objemu: SS a PEEK tubing dle specifikace pro RP-AMRT metodu
• Hmotnostní spektrometrie: Agilent 6200 Series TOF LC/MS nebo 6500 Series Q-TOF LC/MS s Dual ESI Source (G3251B)
• Softwarové nástroje: MassHunter Data Acquisition, Qualitative Analysis ≥B.07.00, PCDL Manager ≥B.08.00 SP1

Hlavní výsledky a diskuse

Databáze obsahuje přes 30 000 metabolitických a příbuzných sloučenin, 39 000 lipidů a 169 400 teoretických peptidů. K dispozici jsou kompletní verze i podmnožiny (Metabolites, Lipids, Theoretical Peptides), s možností aktualizací. Uživatelé mohou přidávat vlastní retenční časy, MS/MS spektra, kolizní průřezy a importovat data z CSV. Vyhledávání podporuje přesné hmotnosti, vzorce a retenční časy, stejně jako spektroskopické porovnání v prostředí MassHunter Qualitative Analysis.

Přínosy a praktické využití metody

• Přesná a rychlá identifikace metabolitů a lipidů
• Flexibilita v úpravách databáze a knihovny pro konkrétní laboratorní potřeby
• Podpora kvalitativní analýzy s automatizovanými workflow a filtry šumu
• Možnost integrace iontové mobility pro dokonalou separaci izomerů

Budoucí trendy a možnosti využití

Rozvoj databáze o nové biologické markery, integrace strojového učení pro predikci struktur, prohloubení využití iontové mobility (CCS), podpora cloudových aktualizací a automatizovaná správa v rámci LIMS.

Závěr

Agilent MassHunter METLIN PCD/PCDL představuje komplexní řešení pro kvalitativní metabolomiku, umožňuje efektivně spravovat, rozšiřovat i využívat databáze a knihovny pro přesné a reprodukovatelné výsledky v oblasti LC/MS analýz.

Reference

• Agilent Technologies. MassHunter METLIN Metabolite PCD/PCDL Quick Start Guide, Revision A, 2017.