LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníLipidomika
VýrobceWaters
Význam tématu
Multidimenzionální lipidomika je klíčová pro pochopení role lipidů ve fyziologii i patologii. Tradiční chromatografické techniky nedokážou dostatečně rozlišit široké spektrum lipidových druhů v komplexních biologických vzorcích. Kombinace HILIC-UPLC separace, iontové mobility a ToF MS přináší víceúrovňové rozlišení podle polarity, tvaru molekuly a přesné hmotnosti, což významně zvyšuje hloubku a přesnost lipidového profilování.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo zavést a otestovat metodiku využívající Waters Omics Research Platform (ACQUITY UPLC, SYNAPT G2-S HDMS) ve spojení s TransOmics a HDMS Compare softwarem pro multidimenzionální charakterizaci lipidů. Autoři demonstrovali schopnost rozlišit lipidové třídy i isobarické a koelutující složky v extraktech z mozku, srdce a jater buvola.
Použitá instrumentace
- ACQUITY UPLC BEH HILIC 2.1×100 mm, 1,7 µm
- ESI zdroj pro pozitivní a negativní režim
- SYNAPT G2-S HDMS (iontová mobilita s T-Wave)
- Tof hmotnostní analyzátor s režimem HDMSE
- TransOmics Informatics a HDMS Compare software
Použitá metodika
Vzorky obsahovaly standardy Avanti Polar Lipids a celkové lipidové extrakty z mozku, srdce a jater buvola. HILIC gradient používal kombinaci 10 mM acetátu amonného v 95 % a v 50 % acetonitrilu (pH 8,0). Separace probíhala při 0,5 mL/min, sloupcová teplota 30 °C. MS analýzy v režimu HDMSE střídaly nízkou (6 V) a vysokou kolizní energii (20–35 V). Iontová mobilita probíhala v dusíkové náplni se specifickými parametry T-Wave. Data zpracována v TransOmics a HDMS Compare.
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda poskytla:
- Rozdělení lipidových tříd dle polarizace v HILIC, s reprodukovatelnými retenčními časy.
- Oddělení isobarických a koelutujících lipidů v iontové mobilitě na základě driftových časů (Ω).
- Čisté fragmentační spektra získaná v HDMSE, umožňující současné získání prekurzorových a produktových iontů.
- Multidimenzionální mapy kombinující retenční časy, driftové časy, m/z a intenzitu, ilustrující složitost lipidomů z mozku, srdce i jater.
- Porovnání vzorků pomocí HDMS Compare a TransOmics, zvýrazňující odlišnosti lipidových profilů a usnadňující statistickou analýzu.
Přínosy a praktické využití metody
Metodika umožňuje detailní exploraci lipidových biomarkerů v biomedicínských, farmaceutických i průmyslových aplikacích. Umožňuje odhalit nízce zastoupené nebo koelutující složky, zvyšuje citlivost a spolehlivost kvantifikace a podporuje rychlou analýzu velkého množství vzorků.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace s dalšími omickými platformami pro holistické pohledy na metabolomické sítě.
- Využití pokročilých iontových mobilitních technologií (FAIMS, TIMS) pro vyšší rozhodovací schopnost.
- Aplikace v klinické lipidomice pro personalizovanou medicínu a metabolické profilování pacientů.
- Rozvoj databází driftových časů a strojového učení pro automatizovanou identifikaci lipidů.
Závěr
Kombinace HILIC-UPLC, iontové mobility a HDMSE ToF MS představuje vysoce výkonnou multidimenzionální platformu pro komplexní lipidomické analýzy. Metoda přináší vyšší separační kapacitu, přesnější identifikaci a kvantifikaci lipidů a efektivní nástroje pro porovnání biologických vzorků.
Reference
- Rainville PD, Stumpf CL, Shockcor JP, Plumb RS, Nicholson JK. Novel Application of Reversed-Phase UPLC-oaTOF-MS for Lipid Analysis in Complex Biological Mixtures: A New Tool for Lipidomics. J Proteome Res. 2007 Feb;6(2):552-8.
- Lísa M, Cífková E, Holčapek M. Lipidomic profiling of biological tissues using off-line two-dimensional high-performance liquid chromatography-mass spectrometry. J Chromatogr A. 2011 Aug 5;1218(31):5146-56.
- Isaac G, McDonald S, Astarita G. Lipid Separation: UPLC System for the Separation of Complex Biological Total Lipid Extracts. Waters Application Note 720004107en. 2011.
- Netto J, Wong S, Ritchie M, Torta F, Narayanaswamy P. A Definitive Lipidomics Workflow for Human Plasma Utilizing Off-line Enrichment and Class Specific Separation of Phospholipids. Waters Application Note 720004521en. 2012.
- Nie H, Liu R, Yang Y, Bai Y, Guan Y, Qian D, Wang T, Liu H. Lipid profiling of rat peritoneal surface layers by online normal- and reversed-phase 2D LC QToF-MS. J Lipid Res. 2010 Sep;51(9):2833-44.
- Netto JD, Wong S, Ritchie M. High Resolution Separation of Phospholipids Using a Novel Orthogonal Two-Dimensional UPLC/QTof MS System Configuration. Waters Application Note 720004546en. 2013.
- Shvartsburg AA, Isaac G, Leveque N, Smith RD, Metz TO. Separation and classification of lipids using differential ion mobility spectrometry. J Am Soc Mass Spectrom. 2011 Jul;22(7):1146-55.
- Kliman M, May JC, McLean JA. Lipid analysis and lipidomics by structurally selective ion mobility-mass spectrometry. Biochim Biophys Acta. 2011 Nov;1811(11):935-45.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.