GlycoWorks HILIC SPE Robust Glycan Sample Preparation

Aplikace | 2014 | WatersInstrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Waters

Význam tématu


Glykanové struktury hrají klíčovou roli v biologie proteomů, léčiv a biomarkerů. Díky své vysoké polarity vyžadují specifické separační techniky k účinnému očištění a koncentraci před analýzou. Hydrofobní metody jsou pro tyto molekuly nevhodné, zatímco HILIC v podobě SPE nabízí ideální prostředí pro selektivní retenci a následující eluci glykanů z komplexních matric.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem studie bylo demonstrovat:
  • schopnost HILIC SPE selektivně čistit 2-AB značené glykany,
  • robustnost a reprodukovatelnost metody při variabilních průtokových podmínkách v 96-well µElution formátu,
  • optimalizaci elučního roztoku pro vysoké a vyrovnané výtěžky jednotlivých glykanů.

Použitá metodika a instrumentace


Metodický postup zahrnoval následující kroky:
  1. Podmínění sorbentu (aminopropyl silika) vodným mobilním fází pro vytvoření polárního vodního filmu.
  2. Naložení vzorku obsahující 2-AB značené glykany v nízkopolární fázi (vysoký obsah acetonitrilu).
  3. Promytí k odstranění méně polárních kontaminantů.
  4. Eluce glykanů v roztoku 100 mM amonium octanu s 5 % acetonitrilu, pH stabilním a volatilním.
  5. Řízení průtoku pomocí vakuového manifoldu při –5 inches Hg v 96-well µElution destičce.
  6. Analýza eluátů pomocí HILIC-FLR chromatografie a Dextran Calibration Ladder pro kvantifikaci pomocí Glucose Unit (GU) škály.

Hlavní výsledky a diskuse


Studie prokázala:
  • Optimální eluční podmínky (100 mM NH4OAc, 5 % ACN) vedou k vysokým (>90 %) a vyrovnaným výtěžkům 2-AB značených glykanů různých GU.
  • Variace průtoku mezi studenami µElution destičky až 3-násobně (14–27 µL/s) nemá praktický vliv na absolutní ani relativní výtěžky (R2 <0,1).
  • Metoda je vysoce reprodukovatelná i bez speciálních preventivních opatření, přičemž %RSD výtěžků zůstává nízké.

Přínosy a praktické využití metody


HILIC SPE GlycoWorks:
  • zjednodušuje a urychluje přípravu glykanových vzorků,
  • umožňuje vysokopropustné zpracování (96 vzorků současně),
  • zajišťuje konzistentní čistotu a koncentrovaní glykanů vhodné pro LC-MS či FLR detekci,
  • nachází uplatnění v biotechnologickém vývoji, QA/QC laboratořích a glyko-proteomice.

Budoucí trendy a možnosti využití


Očekávaný vývoj zahrnuje:
  • další miniaturizaci a automatizaci SPE formátů pro ultra-high-throughput,
  • integraci s pokročilými palubními LC-MS systémy pro okamžité přechodové analýzy,
  • vývoj nových sorbentů a modifikací povrchů pro cílené oddělování specifických glykozylací,
  • využití strojového učení pro optimalizaci pH, ionické síly a složení mobilní fáze.

Závěr


GlycoWorks HILIC SPE poskytuje robustní, reprodukovatelnou a vysoce účinnou metodu přípravy 2-AB značených glykanů. Díky optimalizovaným elučním podmínkám i vysoké toleranci vůči proměnlivým průtokům v 96-well formátu je metoda ideální pro rutinní i výzkumné aplikace v oblasti glykanové analytiky.

Reference


  1. Comprehensive Guide to HILIC - Hydrophilic Interaction Chromatography. Waters Primer 715002531.
  2. Wuhrer M.; de Boer A. R.; Deelder A. M. Structural glycomics using hydrophilic interaction chromatography (HILIC) with mass spectrometry. Mass Spectrom Rev 2009, 28(2), 192–206.
  3. Optimization of GlycoWorks HILIC SPE for the Quantitative and Robust Recovery of N-Linked Glycans from mAb-Type Samples. Waters Application Note 720004717EN.
  4. GlycoWorks High-throughput Sample Preparation Kit Care and Use Manual. Waters User Manual 715004079.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Optimization of GlycoWorks HILIC SPE for the Quantitative and Robust Recovery of N-Linked Glycans from mAb-Type Samples
Waters Application Notes - Glycans
Waters Application Notes - Glycans
2016|Waters|Příručky
GlycoWorks Sample Preparation Consumables
BIOPHARMACEUTICAL - Key Applications