<div><div><p><span><strong>Společnost Metrohm představuje OMNIS IC - iontovou chromatografii nové generace navrženou na analytické platformě OMNIS, která spojuje maximální flexibilitu, automatizaci a spolehlivost. Systém OMNIS IC je založený na modulárním hardwarovém konceptu a vybavený intuitivním softwarem. Splňuje jak současné, tak i budoucí analytické požadavky a zároveň zajišťuje efektivitu a reprodukovatelné výsledky.</strong></span></p></div></div><div><div><h3><strong>Modulární design pro iontovou chromatografii na míru</strong></h3></div></div><div><div><p><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/products/2612"><strong>OMNIS IC</strong></a> je založen na principu <strong>sestavování jednotlivých modulů</strong>, které zahrnují funkční jednotky, jako jsou <strong>vysokotlaká čerpadla, nástřikové ventily, detektory a dávkovací jednotky</strong>. Tyto komponenty lze podle potřeby různě <strong>kombinovat </strong>a vytvořit tak IC systém na míru. Díky této modularitě mohou laboratoře konfigurovat systémy přesně podle svých analytických požadavků a snadno je rozšiřovat s rostoucí složitostí aplikací.</p></div></div><div><div><h3><strong>Automatizace, která zjednoduší každodenní práci v laboratoři</strong></h3></div></div><div><div><p><strong>OMNIS IC </strong>nabízí vysoký stupeň <strong>automatizace </strong>od <strong>přípravy vzorků až po validaci výsledků</strong>. Automatizovaná inline příprava vzorků – například ředění, filtrace nebo dialýza – v kombinaci s inteligentními nástřikovými technikami, jako jsou partial loop, eliminace matrice nebo pre-koncentrace maximálně eliminuje manuální zásahy, a tím minimalizuje riziko uživatelských chyb.&nbsp; Automatizovaná příprava eluentu spolu s nepřetržitým sledováním hladin kapalin pak navíc pomáhá předcházet přerušení provozu přístroje.</p></div></div><div><div><h3><strong>Spolehlivost a automatická kontrola systému</strong></h3></div></div><div><div><p>K zajištění stabilních a reprodukovatelných výsledků, OMNIS IC <strong>nepřetržitě monitoruje stav celého systému </strong>včetně tlaků, průtoků či hladiny provozních kapalin. Kontroly před spuštěním analýz ověřují správnost seznamů vzorků, zatímco kontroly ekvilibrace zajišťují, že měření začne pouze za stabilních podmínek. Funkce jako <strong>AutoPurge</strong> a <strong>AutoRinse</strong> pomáhají udržovat cestu vzorku bez bublin a zabraňují kontaminaci vzorků mezi jednotlivými cykly.</p><div><div><div><div><div><div><h3><strong>Intuitivní software pro snadné a efektivní ovládání</strong></h3><p>OMNIS IC se ovládá prostřednictvím <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/products/649"><strong>OMNIS softwaru</strong></a>, který nabízí přehledné a intuitivní uživatelské rozhraní. Vizuální ikony, rozevírací seznamy, kontextové popisky a integrovaná nápověda usnadňují rychlé seznámení se systémem a umožňují zkušeným analytikům i novým uživatelům pracovat efektivně, jistě a bez zbytečných komplikací.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Metrohm_Metrohm_predstavuje_OMNIS_IC_a668c200ec.jpg" alt="Metrohm: Metrohm představuje OMNIS IC" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Metrohm_Metrohm_predstavuje_OMNIS_IC_a668c200ec.jpg 233w," sizes="100vw" width="600" height="401"></p></div></div></div></div></div></div><div><div><h3><strong>Jedna platforma pro více analytických technologií</strong></h3></div></div><div><div><p>OMNIS IC je plně integrován do <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.metrohm.com/cs_cz/products/omnis-platform.html"><strong>OMNIS platformy</strong></a>, takže umožňuje ovládat iontovou chromatografii, titraci i NIR spektroskopii v jednom softwarovém prostředí. Analytické výsledky z různých technik jsou přiřazeny ke konkrétním vzorkům, což pomáhá propojit dříve oddělená data a zjednodušuje tvorbu reportů – například při analýze pitné vody.</p><blockquote><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Metrohm_Meet_OMNIS_IC_The_new_benchmark_in_ion_chromatography_5cfb15cf69.png" alt="Metrohm: Metrohm představuje OMNIS IC: Meet OMNIS IC – The new benchmark in ion chromatography." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Metrohm_Meet_OMNIS_IC_The_new_benchmark_in_ion_chromatography_5cfb15cf69.png 245w," sizes="100vw" width="1280" height="720"></p><p><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.metrohm.com/cs_cz/products/ion-chromatography/omnis-ic.html"><span><strong>Zjistěte více o&nbsp;OMNIS IC</strong></span></a></p><p>Zúčastněte se naší virtuální premiéry&nbsp;"Meet OMNIS IC – The new benchmark in ion chromatography"&nbsp;29. září:</p><h5><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/cs-cz/all/webinar/6549"><span><strong>Registrujte se na dopolední sekci (09:00)</strong></span><strong> nebo </strong><span><strong>odpolední sekci (16:00)</strong></span></a></h5></blockquote></div></div></div></div>

Metrohm představuje OMNIS IC

<p><strong>Mikroplasty se staly jedním z nejdiskutovanějších kontaminantů životního prostředí současnosti. Bez ohledu na to, kde žijeme, je každodenní expozice mikroplastům prakticky nevyhnutelná – tyto drobné plastové částice se nacházejí ve vzduchu, který dýcháme, ve vodě, kterou pijeme, i v prostředí, ve kterém žijeme. Vzhledem k tomu, že se vědci snaží lépe porozumět zdrojům mikroplastů, cestám jejich šíření a jejich dopadům, neustále roste poptávka po spolehlivých metodách jejich analýzy.</strong></p><p>Ačkoli se techniky, jako jsou FTIR a Ramanova spektroskopie, staly standardními nástroji pro identifikaci mikroplastů, jejich využití je omezené u menších částic (tj. nanoplastů) a ve složitých matricích. Pokročilejší metody analýzy mikroplastů mohou poskytnout hlubší informace o tom, co tyto částice obsahují a jak se mohou v průběhu času v životním prostředí měnit.</p><h3><strong>Omezení spektroskopických metod analýzy mikroplastů</strong></h3><p><strong>Infračervená spektroskopie s Fourierovou transformací </strong>(<strong>FTIR</strong>) a <strong>Ramanova spektroskopie </strong>patří mezi široce používané metody analýzy mikroplastů, protože umožňují<strong> identifikovat typy polymerů</strong> na základě interakce elektromagnetického záření s materiálem. Tyto techniky jsou užitečné pro určení, zda se jedná například o polyethylen, polypropylen, polystyren nebo jiný běžný plast. Pro mnoho studií jsou tyto informace dostačující k potvrzení přítomnosti mikroplastů, zejména u čistých vzorků s dostatečným množstvím mikroplastových částic.</p><p><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.leco.com/application/environmental/"><strong>Vzorky z životního prostředí</strong></a> jsou však málokdy čisté a složením jednoduché. Částice mikroplastů mohou v důsledku působení okolního prostředí postupně stárnout a být překryty či obaleny jinými materiály, což ztěžuje jejich přesnou identifikaci pomocí spektroskopie. <span>Pokud navíc výzkumníci potřebují zjistit, jaká aditiva, degradační produkty nebo znečišťující látky jsou s daným plastem spojeny, samotná identifikace částice nestačí. Metody FTIR a Ramanovy spektroskopie proto mají omezené možnosti při podrobné charakterizaci přítomných chemických látek, zejména v komplexních environmentálních matricích.</span> S rostoucím významem otázek spojených s expozicí mikroplastům proto výzkumníci potřebují analytické techniky, které dokážou podrobněji charakterizovat chemické složení vzorku, a nikoli pouze potvrdit přítomnost samotné plastové částice.</p><h3><strong>Termální desorpce a pyrolýza s GCxGC-TOFMS pro komplexnější charakterizaci mikroplastů</strong></h3><p><span>Pro podrobnější charakterizaci nano- a mikroplastů ve složitých vzorcích lze využít termální <strong>desorpci </strong>(<strong>TD</strong>) a <strong>pyrolýzu </strong>(<strong>Py</strong>) ve spojení s komplexní dvourozměrnou plynovou chromatografií a hmotnostní spektrometrií s analyzátorem doby letu (</span><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.leco.com/core-analysis/gc-and-gc-ms/"><span><strong>GCxGC-TOFMS</strong></span></a><span>). Termální desorpce a pyrolýza poskytují vzájemně se doplňující informace o chemickém složení vzorku.</span></p><p><strong>Termální desorpce </strong>umožňuje analyzovat těkavé a adsorbované látky spojené s částicemi mikroplastů. Patří mezi ně například environmentální kontaminanty, degradační produkty nebo těkavé organické látky (VOC). Analýza tak poskytuje informace o chemických látkách, které se nacházejí na povrchu plastu nebo jsou v něm obsaženy.</p><p><strong>Pyrolýza </strong>se naopak zaměřuje na samotný polymer. Působením vysoké teploty jej rozkládá na charakteristické sloučeniny, které lze následně analyzovat pomocí GC. Tyto produkty pyrolýzy slouží jako markery umožňující určit, jaké polymery jsou ve vzorku přítomny. Tento přístup je zvláště užitečný u komplexních nebo výrazně zestárlých mikroplastů, které se pomocí běžných spektroskopických metod identifikují obtížně.</p><p>Nejvýznamnější přínos přináší spojení těchto technik s komplexní<strong> dvourozměrnou plynovou chromatografií</strong>. Environmentální vzorky často obsahují stovky až tisíce sloučenin, které mohou v jednorozměrné GC-MS koeluovat, a jejich jednotlivá identifikace je tak obtížná nebo dokonce nemožná. GCxGC poskytuje výrazně vyšší separační schopnost a pomáhá analytikům odlišit důležité polymerní markery od složek matrice. Lepší separace zároveň zvyšuje schopnost hmotnostního spektrometru identifikovat charakteristické produkty pyrolýzy polymerů, a to i ve vysoce komplexních environmentálních vzorcích. Výzkumníci tak mohou detekovat a identifikovat i obtížně analyzovatelné mikroplasty bez rozsáhlých kroků čištění vzorku, které často vyžadují jiné analytické postupy.</p><p>Další jedinečnou výhodou tohoto přístupu je možnost použít teremální desorpci a pyrolýzu postupně na stejném vzorku. Společně tak poskytují komplexnější chemický profil vzorku.</p><h3><strong>Komplexní analytický postup pro lepší pochopení mikroplastů v životním prostředí</strong></h3><p>FTIR a Ramanova spektroskopie zůstávají cennými nástroji pro rychlý screening a identifikaci vzorků obsahujících mikroplastové částice. <strong>Kombinací teremální desorpce, pyrolýzy a GCxGC-TOFMS</strong> však mohou analytici získat<strong> mnohem komplexnější informace o plastech </strong>přítomných ve vzorcích, jejich chemickém složení a změnách, kterým v životním prostředí podléhají. S postupujícím environmentálním výzkumem a rostoucími obavami z kontaminace mikroplasty budou výzkumníci stále častěji potřebovat informace, které přesahují pouhou odpověď na otázku: <i>„Jaký plast je přítomen?“</i></p><p>Tato hlubší úroveň charakterizace může v konečném důsledku přinést nové poznatky o osudu mikroplastů v životním prostředí a pomoci vědcům lépe porozumět jejich potenciálním dopadům na ekosystémy a expozici člověka.</p>

Překonání limitů tradičních metod analýzy mikroplastů pomocí termální desorpce a pyrolýzy ve spojení s GCxGC-TOFMS

<p><strong>NIST26 přináší integrované zpracování chromatogramů, dekonvoluci a vyhledávání v knihovnách pro data EI GC-MS a LC-MS/MS. Celý postup však začíná jedním zásadním požadavkem: chromatografická data musí být k dispozici ve formátu mzML. James Little ze společnosti Mass Spec Interpretation Services ve své prezentaci</strong> <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://labrulez.com/pdf/Conversion_to_mz_ML_63e134bb34.pdf"><i><strong>Conversion to mzML Format for NIST26 Chromatogram Processing</strong></i></a> <strong>vysvětluje, jak převést data výrobců přístrojů do formátu mzML pomocí softwaru výrobce nebo bezplatného nástroje MSConvert ze sady ProteoWizard. Zároveň upozorňuje na několik nastavení, která jsou pro správné zpracování dat v NIST26 zásadní.</strong></p><h4><span><strong>Zpracování chromatogramů v NIST26 vyžaduje formát mzML</strong></span></h4><p>Pro zpracování chromatogramů popsaným v prezentaci je <strong>mzML akceptovaným vstupním formátem</strong>. Proprietární data z LC-MS nebo GC-MS je proto nutné před načtením do prostředí NIST26 převést.</p><p>Soubor mzML lze získat dvěma základními způsoby:</p><ul><li>převodem pomocí softwaru dodávaného výrobcem přístroje,</li><li>převodem pomocí nástroje <strong>MSConvert</strong>, který je součástí bezplatného softwarového balíčku <strong>ProteoWizard</strong>.</li></ul><p>Použití otevřeného formátu, jako je mzML, zároveň představuje praktický způsob přenosu hmotnostně spektrometrických dat mezi různými softwarovými prostředími bez závislosti výhradně na proprietárních formátech jednotlivých výrobců.</p><h4><span><strong>Použití ProteoWizard a MSConvert</strong></span></h4><p>MSConvert se instaluje jako součást kompletního balíčku ProteoWizard, nikoli jako samostatná aplikace. Po instalaci ProteoWizard mohou uživatelé pracovat buď s grafickým rozhraním MSConvert, nebo s jeho verzí pro příkazovou řádku.</p><p>Pro běžné rutinní použití prezentace doporučuje stabilní verzi softwaru. Novější nebo tzv. nightly build verze však mohou někdy nabídnout lepší podporu novějších proprietárních formátů nebo širší možnosti nastavení filtrů pro zpracování dat. To může být užitečné zejména při práci se soubory, u kterých je třeba věnovat větší pozornost centroidaci nebo detekci píků.</p><p>Pro většinu uživatelů představuje grafické rozhraní jednoduchý způsob, jak převést proprietární surová data do souboru mzML vhodného pro další zpracování v NIST26.</p><h4><span><strong>Začněte výběrem mzML jako výstupního formátu</strong></span></h4><p>Prvním krokem v MSConvert je výběr zdrojového souboru nebo datové sady pomocí funkce <strong>Browse</strong>.</p><p>Software podporuje širokou škálu formátů hmotnostně spektrometrických dat. V okně pro výběr souboru lze zobrazit buď konkrétní formát daného výrobce, nebo všechny podporované spektrální formáty.</p><p>Po výběru zdrojových dat je nutné nastavit jako výstupní formát <strong>mzML</strong>. Ukázky v prezentaci zobrazují toto nastavení přímo v panelu možností MSConvert před spuštěním převodu.</p><p>Před přidáním datové sady do fronty pro konverzi lze rovněž zvolit cílovou složku a další možnosti výstupního souboru.</p><h4><span><strong>Přidání dat a spuštění konverze</strong></span></h4><p>Jakmile jsou vybrány zdrojový soubor a výstupní parametry, soubor se pomocí příkazu <strong>Add</strong> přidá do seznamu pro konverzi.</p><p>Samotný převod se následně spustí tlačítkem <strong>Start</strong>.</p><p>U jednodušších datových sad, které již obsahují spektra ve správné podobě, může být tento postup dostačující. James Little však zdůrazňuje ještě jeden požadavek, který je pro NIST26 obzvlášť důležitý: data musí být <strong>centroidovaná</strong>.</p><h4><span><strong>Centroidovaná data jsou nezbytná</strong></span></h4><p>Podle prezentace nejsou pro tento workflow zpracování chromatogramů v NIST26 vhodná <strong>data v profilovém režimu</strong>. Spektra musí být převedena do centroidované podoby, tedy do formy po detekci píků.</p><p>Profilová spektra obsahují kompletní naměřený tvar jednotlivých signálů v celém rozsahu m/z. Centroidovaná data tyto profily převádějí na jednotlivé diskrétní píky reprezentované charakteristickou hodnotou m/z a intenzitou.</p><p>Pokud jsou původní data výrobce stále v profilovém režimu, lze centroidaci provést přímo během převodu přidáním filtru <strong>Peak Picking</strong> v MSConvert.</p><blockquote><p>Konverze tak může v jednom kroku provést dvě operace:</p><p><strong>proprietární surová data → centroidace / Peak Picking → mzML</strong></p></blockquote><p>Výsledný soubor mzML je následně možné použít jako vstup pro zpracování chromatogramu v NIST26.</p><h4><span><strong>Peak Picking musí být prvním filtrem</strong></span></h4><p>Jedním z nejdůležitějších praktických bodů prezentace je pořadí operace Peak Picking v seznamu filtrů MSConvert.</p><p>Pokud je centroidace nutná, <strong>Peak Picking musí být prvním algoritmem nebo filtrem v seznamu</strong>. Zařazení jiné zpracovatelské funkce před něj může narušit zamýšlený průběh konverze.</p><p>MSConvert umožňuje zvolit filtr Peak Picking, nastavit příslušné úrovně MS a přidat jej do posloupnosti zpracování ještě před spuštěním převodu. Příklad v prezentaci využívá vendor-based peak picking pro vybrané úrovně MS.</p><p>Pokud si uživatel není jistý, zda jsou zdrojová data již centroidovaná, lze filtr Peak Picking přidat i tak. Podle prezentace jeho aplikace na již centroidovaná data soubor zbytečně nemění.</p><p>To může být užitečná pojistka zejména u starších datových sad, u kterých není režim akvizice zcela jistý.</p><h4><span><strong>Výběr správných úrovní MS</strong></span></h4><p>Peak picking nemusí být nutně aplikován stejným způsobem na všechna spektra v datové sadě. MSConvert umožňuje určit <strong>úrovně MS</strong>, na které se má filtr vztahovat.</p><p>To je důležité zejména u LC-MS/MS dat, kde jeden soubor může obsahovat jak MS spektra prekurzorových iontů, tak tandemová MS/MS spektra.</p><p>Nastavení konverze by proto mělo odpovídat způsobu, jakým byla původní data získána, a také tomu, jak budou následně zpracovávána v NIST26.</p><h4><span><strong>Počítejte se změnami velikosti souboru</strong></span></h4><p>Prezentace rovněž upozorňuje, že velikost převedených souborů se může výrazně lišit od původních proprietárních dat.</p><p>To je důležité zejména při práci s rozsáhlými LC-MS/MS datovými sadami nebo při dávkovém zpracování většího množství chromatogramů. Velikost výsledného souboru mzML může záviset na původním režimu akvizice, centroidaci, nastavení komprese, počtu úrovní MS i dalších výstupních parametrech.</p><p>Před převodem rozsáhlejších kolekcí surových dat je proto vhodné počítat také s požadavky na úložný prostor.</p><h4><span><strong>Jednoduchý postup pro přípravu dat pro NIST26</strong></span></h4><p>Celý postup prezentovaný Jamesem Littlem lze shrnout do několika kroků:</p><ol><li>Získejte původní proprietární LC-MS nebo GC-MS data.</li><li>Otevřete data v MSConvert nebo použijte konverzní software výrobce přístroje.</li><li>Nastavte <strong>mzML</strong> jako výstupní formát.</li><li>Ověřte, zda jsou spektra centroidovaná.</li><li>Pokud je to nutné, přidejte <strong>Peak Picking</strong> jako první filtr zpracování.</li><li>Vyberte odpovídající úrovně MS.</li><li>Přidejte soubor do seznamu pro konverzi.</li><li>Spusťte převod.</li><li>Výsledný soubor mzML použijte pro zpracování chromatogramu v NIST26.</li></ol><p>Samotný postup není složitý, ale požadavek na centroidovaná data je zásadní. Soubor může mít správnou příponu <code>.mzML</code>, ale přesto nemusí být pro daný workflow vhodný, pokud jeho spektra zůstávají v profilovém režimu.</p><h4><span><strong>Od proprietárních dat k integrovanému zpracování v NIST26</strong></span></h4><p>Převod datových souborů může na první pohled působit jako méně důležitý krok ve srovnání s dekonvolucí, interpretací spekter nebo knihovním vyhledáváním, ve skutečnosti však tvoří základ celého následného workflow.</p><p>Díky použití mzML jako jednotného vstupního formátu může NIST26 zpracovávat data pocházející z různých přístrojových platforem konzistentnějším způsobem. ProteoWizard a MSConvert představují praktické propojení mezi proprietárními hmotnostně spektrometrickými soubory a tímto standardizovaným formátem.</p><p>Hlavní sdělení prezentace je proto jednoduché: <strong>převeďte data do mzML, ověřte, že jsou spektra centroidovaná, a pokud je centroidace nutná, umístěte Peak Picking jako první filtr v pořadí</strong>. Po splnění těchto podmínek jsou data připravena pro integrované zpracování chromatogramů a vyhledávání v knihovnách v NIST26.</p>

Převod do formátu mzML pro zpracování chromatogramů v NIST26

Akademie

Životní prostředí

Software

Video

Článek

Produkt

Naše společnost nabízí řešení v oblasti iontové analýzy pomocí titrace, iontové chromatografie, voltametrie a polarografie.

Metrohm Česká republika

Pomůžeme Vám nalézt vhodné zařízení pro tepelnou analýzu, metalografii nebo hmotnostní spektrometrii a poskytneme Vám školení, aplikační podporu a servis, který potřebujete k udržení chodu laboratoře na nejvyšší možné úrovni.

LECO

Mým hlavním zájmem je identifikace organických sloučenin hmotnostní spektrometrií v organických směsích.

Nejbližší události z oblasti analytické chemie

19. Škola hmotnostní spektrometrie

7. Konference ČSHS

18. Škola hmotnostní spektrometrie

Mohlo by Vás zajímat

Převod do formátu mzML pro zpracování chromatogramů v NIST26

Překonání limitů tradičních metod analýzy mikroplastů pomocí termální desorpce a pyrolýzy ve spojení s GCxGC-TOFMS

Metrohm představuje OMNIS IC