<p><strong>Dear friends and fans of mass spectrometry,</strong></p>
<p><strong>The history of a method for studying of matter known as mass spectrometry dates back more than a century. The foundations have mostly been laid by physics studying discharges in gases. After about five decades mass spectrometry entered the domain of chemistry and evolved into an excellent tool for studying the structure of chemical compounds. Recently we are witnessing its expansion into the field of cellular, molecular, and structural biology. The technology of mass spectrometry developed immensely over the time. Let us take a tour into the history and learn about the past technologies. Let us explore the state-of-art mass spectrometry.</strong></p>
<p>A technical museum focused on unique and significant part of science, the Czech Museum of Mass Spectrometry will display and explain laboratory instrumentation that encompasses physics, chemistry, engineering and informatics and combines them into a device that contributes to many parts of our daily life.</p>
<p>Czech and English speaking visitors will have an opportunity to learn about the principles and applications of mass spectrometry, its history, and important scientists including Nobel price winners, while experiencing a remarkable collection of mass spectrometers. Founded by mass spectrometry enthusiasts Jaroslav Pol (Thermo Scientific) and Josef Cvacka (Institute of Organic Chemistry and Biochemistry) and sponsored by Frantisek Turecek (University of Washington, Seattle), the Czech Museum of Mass Spectrometry is now being assembled and will open in Prague in 2017. Donations of mass spectrometry artifacts are gratefully appreciated; those willing to contribute please contact the curators.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/d3e7627196634c0a8fa129f95fef6edd/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry"/></p>
<h3><strong>Mass spectrometry</strong></h3>
<p>Study of matter through the formation of gas-phase ions that are characterized using mass spectrometers by their mass, charge, structure, and/or physico-chemical properties.</p>
<h3><strong>Mass Analyzers</strong></h3>
<h5><strong>Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance</strong></h5>
<p>Mass spectrometer based on the principle of ion cyclotron resonance in which an ion in a magnetic field moves in a circular orbit at the cyclotron frequency that is characteristic of its m/z value. Ions are coherently excited to a larger radius orbit using a pulse of radio frequency electric field, and their image charge is detected on receiver plates as a time domain signal. Fourier transformation of the time domain signal results in a frequency domain signal that is converted to a mass spectrum based on the inverse relationship between cyclotron frequency and m/z.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/1628c6d87adf47538f70c2d7ce971db9/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Ion Trap</strong></h5>
<p>Device for spatially confining ions using electric and magnetic fields alone or in combination.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/bcc0887a778f4df29f488bcd87ce8718/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Linear Ion Trap</strong></h5>
<p>Two-dimensional Paul ion trap in which ions are confined in the axial dimension by means of a static electric potential.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/6d35a6cdb4ee4baa95ad2d831b20db19/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Orbitrap</strong></h5>
<p>Ion trapping device that consists of an outer barrel-like electrode and a coaxial inner spindle-like elec- trode that form an electrostatic </p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/4c8de0a71fef446fa44829e9d37c8b62/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Sector</strong></h5>
<p>Device that produces a magnetic field perpendicular to a charged particle beam that deflects the beam to an extent that is proportional to the ratio of particle momentum and charge.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/240ae6e09cb443508bf7dce8309b2928/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Time of Flight</strong></h5>
<p>Mass spectrometer that separates ions by m/z in a field-free region after acceleration through a fixed accelerating potential. Ions of the same initial translational energy and different m/z require different times to traverse a given distance in the field-free region.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/0d0eaa3a8aa544d1abcca833a9e6e9ae/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Triple Quadrupole</strong></h5>
<p>Tandem mass spectrometer comprising two transmission quadrupole mass spectrometers in series, with a (non-selecting) RF-only quadrupole (or other multipole) between them to act as a collision cell.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/b6e4bd36ccb44cd8a93e84353b28a357/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h3><strong>Ion Sources</strong></h3>
<h5><strong>Atmospheric pressure chemical ionization</strong></h5>
<p>Atmospheric pressure chemical ionization (APCI) is chemical ionization of a sample that is a gas or nebulized liquid, using an atmospheric pressure corona discharge or beta emitter such as 63Ni.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/d562c1ce1a9f43c78d8a93a2c6c43932/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Atmospheric pressure photoionization</strong></h5>
<p>Atmospheric pressure photoionization (APPI) is direct ionization of molecules at atmospheric pressure by electron detachment induced by photons forming M+•, or atmospheric pressure chemical ionization in which the reactant ions are generated by photoionization of suitable dopant species and subsequent ion/molecule reactions of their molecular ions.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/828a17ec377a4313bdd59f9275192e87/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Desorption electrospray ionization</strong></h5>
<p>Desorption electrospray ionization (DESI) is formation of gas-phase ions from a solid or liquid sample at atmospheric pressure through the inter- action of electrosprayed droplets with the sample surface.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/86624af57b96403586bd27b3bafccec3/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Electrospray ionization</strong></h5>
<p>Electrospray ionization (ESI) is spray ionization process in which either cations or anions in solution are transferred to the gas phase via formation and desolvation at atmospheric pressure of a stream of highly charged droplets that result from applying a potential difference between the tip of the electrospray needle containing the solution and a counter electrode.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/673ec39a73b64561805cf60670486635/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Fast atom bombardment ionization</strong></h5>
<p>Fast atom bombardment ionization (FAB) is ionization of molecules initiated by a beam of neutral atoms with translational energies in the keV range. Labile molecules susceptible to dissociation are dissolved in an involatile liquid matrix that absorbs the energy of the bombarding atoms to form a selvedge region above the liquid surface in which ionization of the molecules occurs.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/afda171085f54f6e856bc930cf873fca/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Matrix-assisted laser desorption/ionization</strong></h5>
<p>Matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) is formation of gas-phase ions from molecules present in a solid or liquid matrix that is irradiated with a laser. The matrix is a material that absorbs the laser energy and promotes ionization.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/39f899169e27496f938621f0d25a0f12/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>
<h5><strong>Secondary ion mass spectrometry</strong></h5>
<p>Secondary ion mass spectrometry (SIMS) is technique in which a focused beam of primary ions produces secondary ions by sputtering from a solid surface. The secondary ions are analyzed by mass spectrometry.</p>
<p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/fd584fd784ab4c5197b461de5c42c5ee/obrazek.png" alt="The Czech Museum of Mass Spectrometry/Martin Strohalm"/></p>


The Czech Museum of Mass Spectrometry

<p><strong>Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR vyvinuli nový iontový zdroj pro analýzy vzorků s neplanárními povrchy pomocí ambientní hmotnostní spektrometrie.</strong></p>
<p>Josef Cvačka a spolupracovníci navrhli dvoupolohové zařízení, které měří výšku vzorku pomocí laserové triangulace a cílové sloučeniny analyzuje pomocí desorpční elektrosprejové ionizace nebo desorpční fotoionizace za atmosférického tlaku. </p>
<p>Experimenty ukázaly, že jejich zařízení nabízí rychlá a praktická měření vzorků ve farmaceutických, potravinářských, forenzních nebo průmyslových aplikacích.</p>


Iontový zdroj s laserovou triangulací pro ambientní hmotnostní spektrometrii neplanárních vzorků

<p>Vědci z Max Planckova institutu chemické ekologie v Jeně (Německo) a jejich kolegové z Ústavu organické chemie a biochemie Akademie věd České republiky vyvinuli novou metodu umožňující rychle a spolehlivě detekovat rozličné metabolity, jako například cukry, mastné kyseliny, aminokyseliny a další organické látky ze vzorků rostlinných a živočišných tkání.</p>
<p>Pouhá jedna kapka krve stačí k identifikaci řady metabolitů obsažených v krvi, například mastných kyselin. Tato nová technika, nazvaná MAILD („Matrix-Assisted Ionization/Laser Desorption“), je založena na dnes již klasické metodě hmotnostní spektrometrie (MALDI-TOF/MS). Umožňuje vědcům rozpoznávat velké množství metabolitů v biologickém materiálu, což otevírá dveře pro tzv. cílenou vysokokapacitní metabolomiku. S ohledem na rozsáhlé možnosti použití této metody, např. v oblasti lékařské diagnostiky, je tento objev chráněn patentem. Podrobné výsledky lze též nalézt v odborném <a href="https://www.pnas.org/content/106/25/10092">článku</a> v prestižním časopise <em>Proceedings of the National Academy of Sciences of the U. S. A</em>.</p>
<p>Výrazný posun možností MALDI-TOF techniky (tedy výše uvedený objev - MAILD) spočívá v nalezení tzv. „chytrých matricí“, které samy o sobě neprodukují žádné nežádoucí ionty. <em>„Právě kvůli těmto nežádoucím iontům rušícím hmotnostní spektrum jsme nebyli schopni analyzovat malé molekuly, které hrají zásadní roli v metabolismu rozličných organismů,“</em> vysvětluje Aleš Svatoš, vedoucí vědecké skupiny hmotnostní spektrometrie a proteomiky na Max Planckově institutu a zaměstnanec Ústavu organické chemie a biochemie AV. <em>„Nežádoucí ionty pocházející ze standardních matricí se tak dají připodobnit ke kupce sena, ve které se snažíme najít pár malých, ale velmi důležitých jehliček“</em>.</p>
<p>A tak místo aby se stále zlepšovalo pátrání po jehlách, tj. metabolitech (cukry, mastné kyseliny, aminokyseliny a další organické sloučeniny), začali vědci vymýšlet matrice, které by si jednak zachovaly svoji funkci, ale zároveň by nedávaly vzniknout iontům rušícím měření metabolitů. Jinými slovy, badatelé se snažili odstranit onu kupku sena a učinit jehly viditelnými. Pomoc našli v aplikaci základních konceptů fyzikální a organické chemie a ve svém úsilí uspěli. <em>„Práce zároveň krásným způsobem demonstrovala, jak lze užitečně spojit originální nápad experimentálních chemiků s teoretickou a výpočetní chemií, což nás vede k hlubokému porozumění novému jevu,“</em> dodává Lubomír Rulíšek, teoretický chemik z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR.</p>
<p>Pomocí tohoto nového experimentálního protokolu byli vědci schopni rychle a spolehlivě detekovat více než stovku různých analytických vzorků malých molekul. <em>„Analýza malého kousku listu z huseníčku (Arabidopsis thaliana) – o průměru 0.5 milimetru – odhalila více než sto látek přítomných ve vzorku, z nichž 46 bylo přesně identifikováno,“</em> říká Rohit Shroff, indický doktorand působící v „Mezinárodní výzkumné škole Maxe Plancka“ v Jeně, který provedl většinu experimentů.</p>
<p>Nová metoda MAILD umožňuje měření rozličných biologických materiálů. Kromě vzorků z rostlin a hmyzu vědci studovali také klinické vzorky. Kupříkladu identifikovali široké spektrum látek – organických kyselin – vyskytujících se v jedné kapičce lidské krve. V rutinní lékařské diagnostice jsou podobné analýzy stále prováděny řadou velice komplikovaných metod. Jestliže se vědcům povede dále rozvést popsanou metodu, a to tak, aby byla schopna nejen posloužit k identifikaci látek, ale též k jejich kvantifikaci, může se z MAILD stát velice rychlá a efektivní metoda pro lékařskou a biologickou diagnostiku.</p>


Jak najít jehlu v kupce sena? Zkuste odstranit seno!

Webináře

Aplikace

Akademie

Osobnosti

Plasty

Životní prostředí

Potraviny

Vody

Zdraví

Přednáška

Vědecký článek

Rozhovor

Toxikologie

Popularizace

Věda a výzkum

Software

Covid-19

Kariéra

Article

Popularization

Článek

Laboratoře

Různé

PFAS

Produkt

Video

Poster

Nejbližší akce

Typ novinky

Zaměření

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Altium Podzimní semináře na Moravě 2026

Validace analytické metody a použití programu Excel - 2026

27. Škola hmotnostní spektrometrie 2026

A novel monodisperse supermacroporous reversed-phase platform for comprehensive nucleic acid analysis across a broad size range

How is capillary electrophoresis being used to analyze DNA and RNA

Expanding the Evidence: New Data for More Reliable PFAS Analysis