Když hmotnostní spektrometr pomáhá odhalovat tajemství DNA a RNA

Jaké chemické změny probíhají v našich nukleových kyselinách a jak mohou ovlivňovat fungování buněk? I na takové otázky pomáhají vědcům hledat odpovědi moderní analytické technologie. Jsme proto velmi rádi, že jsme mohli na Biofyzikálním ústavu Akademie věd České republiky v Brně úspěšně instalovat náš hmotnostní spektrometr Shimadzu LCMS-8045RX.

Nový systém kapalinové chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií (LC-MS/MS) rozšíří analytické možnosti pracoviště při studiu biologicky významných molekul, především modifikovaných nukleosidů.

Malé chemické změny s velkým biologickým významem

DNA a RNA nejsou pouze neměnnými nositeli genetické informace. Jejich nukleové báze mohou podléhat celé řadě chemických modifikací, které mají zásadní význam pro buněčné procesy.

Příkladem je methylace nukleových bází, která se může podílet na regulaci genové exprese. Modifikace RNA mohou ovlivňovat její stabilitu, strukturu nebo funkci. Některé chemické změny DNA také vznikají v důsledku poškození genetického materiálu.

Právě schopnost tyto modifikace spolehlivě identifikovat a stanovit jejich množství představuje důležitý nástroj moderního molekulárně-biologického výzkumu.

Shimadzu: Biofyzikální ústav AV ČR

Součástí naší instalace proto nebylo pouze uvedení přístroje do provozu, ale také zavedení analytické metody pro stanovení modifikovaných nukleosidů. Pomocí LC-MS/MS lze jednotlivé látky chromatograficky oddělit a následně vysoce selektivně detekovat i při jejich nízkých koncentracích.

Shimadzu LCMS-8045RX: rychlost, citlivost a spolehlivost

Srdcem analytického MS pracoviště je hmotnostní spektrometr s trojitým kvadrupólem Shimadzu LCMS-8045RX, který spojuje vysokou citlivost s rychlou akvizicí dat a robustní konstrukcí pro dlouhodobý laboratorní provoz.

Přístroj patří do rodiny systémů Shimadzu UFMS (Ultra-Fast Mass Spectrometry) a nabízí řadu technologických předností:

• Vysokou citlivost a selektivitu pro přesné stanovení stopových koncentrací analytů pomocí MRM přechodů.
• Rychlost skenování až 30 000 u/s, která umožňuje efektivní sběr dat i při rychlých chromatografických separacích.
• Přepínání polarity za pouhých 5 ms, což dovoluje sledovat látky ionizující v pozitivním i negativním módu během jediné analýzy.
• Rychlost až 555 MRM přechodů za sekundu, výhodnou zejména pro vícesložkové analytické metody.
• Robustní ionizační rozhraní ESI, navržené s důrazem na stabilitu odezvy, citlivost a snadnou údržbu.

Díky těmto vlastnostem představuje LCMS-8045RX vhodné řešení nejen pro rutinní kvantitativní analýzy, ale také pro náročné výzkumné aplikace v oblasti biochemie, molekulární biologie a dalších life science oborů.

Shimadzu: Když hmotnostní spektrometr pomáhá odhalovat tajemství DNA a RNA: Nová instalace Shimadzu LCMS-8045RX v Brně

Kvalitní analytika si zaslouží také kvalitní pracovní prostředí

Pozornost jsme při této instalaci věnovali také samotnému uspořádání laboratoře. Celý LC-MS/MS systém je umístěn na speciálním laboratorním stole ionBench, který je navržen přímo pro potřeby hmotnostní spektrometrie.

Velkou předností tohoto řešení je integrovaný odhlučňovací box pro rotační vakuovou pumpu a box pro generátor dusíku od stejné firmy, které pomáhají výrazně omezovat hluk v laboratoři.

Výsledkem je kompaktní, praktické a ergonomické pracoviště, které šetří prostor, umožňuje pohodlný přístup k přístrojové technice a přispívá k příjemnějším pracovním podmínkám.
Protože špičková analytika není jen o výkonu přístrojů, ale také o prostředí, ve kterém vědci každý den pracují.

Děkujeme za důvěru!

Velmi si vážíme toho, že si Biofyzikální ústav AV ČR pro rozšíření svých analytických možností vybral právě technologii Shimadzu. Děkujeme celému týmu za skvělou spolupráci během instalace, zaškolení i zavádění analytické metody.

Shimadzu: Biofyzikální ústav AV ČR

Přejeme mnoho úspěchů při dalším výzkumu a těšíme se na zajímavé vědecké výsledky, ke kterým nový LCMS-8045RX pomůže přispět!

Shimadzu – Excellence in Science.